Method Article
Une méthode innovante de fabrication de dispositifs microfluidiques à l’aide de la stratification en polyéthylène téréphtalate (PET) réduit considérablement le coût et la complexité du piégeage et de l’imagerie de plusieurs embryons de poisson-zèbre vivants.
Les embryons de poisson-zèbre sont transparents et conviennent donc particulièrement à l’imagerie intravitale non invasive de processus fondamentaux, tels que la cicatrisation des plaies et la migration des cellules immunitaires. Les dispositifs microfluidiques sont utilisés pour le piégeage afin de soutenir l’imagerie à long terme d’organismes multicellulaires, y compris le poisson zèbre. Cependant, la fabrication de ces dispositifs à l’aide de la lithographie douce nécessite des installations spécialisées et des compétences en impression 3D, qui peuvent ne pas être accessibles à tous les laboratoires. Notre adaptation d’une méthode de stratification du polyéthylène téréphtalate à faible coût précédemment développée pour la construction de dispositifs microfluidiques augmente l’accessibilité en permettant la conception, la fabrication et l’itération pour une fraction de l’investissement technique des techniques conventionnelles. Nous utilisons un appareil fabriqué avec cette méthode, l’assistant rotatif pour l’imagerie Danio de la cicatrisation ultérieure (RADISH), pour permettre le traitement médicamenteux, les blessures manuelles et l’imagerie à long terme d’un maximum de quatre embryons dans le même champ de vision. Grâce à cette nouvelle conception, nous réussissons à capturer les caractéristiques morphologiques grossières du signal calcique autour de l’ablation laser et des plaies de transsection manuelle pour plusieurs embryons dans les 2 heures suivant immédiatement la blessure, ainsi que le recrutement des neutrophiles sur le bord de la plaie pendant 24 h.
La capacité de réagir adéquatement aux dommages est essentielle à la survie de chaque organisme à toutes les échelles, d’une seule cellule à plusieurs tissus. La blessure et ses réponses associées, telles que le recrutement de phagocytes dans les zones endommagées1, sont donc des sujets importants en biologie cellulaire et tissulaire. Les plaies sont détectées immédiatement après la rupture de la barrière tissulaire, provoquant une réponse de gradient tissulaire impliquant une contraction de la plaie 2,3 qui coordonne la cicatrisation de la plaie et la repousse ultérieure4. En raison de la nature mécanique de cette contraction, les outils utilisés lors de l’expérimentation ne doivent pas entraver physiquement le mouvement des cellules à proximité du site de la lésion.
Les embryons de poisson-zèbre sont un excellent modèle pour étudier le développement et les maladies, y compris la réponse des blessures des vertébrés, en raison de leur facilité d’entretien, de leur traçabilité génétique et de leur transparence optique 5,6. Cependant, l’immobilisation de l’ensemble de l’organisme pendant une période prolongée est nécessaire pour étudier le comportement à long terme des cellules proches d’un site de lésion. L’intégration d’embryons dans de l’agarose à bas point de fusion est suffisante pour l’imagerie à court terme des tissus non blessés. Cependant, la matrice de gel environnante limite la contraction et le relâchement des plaies et entrave la croissance des embryons en développement au fil du temps 7,8,9.
Les dispositifs microfluidiques peuvent immobiliser les embryons de poisson-zèbre à différents stades de développement 10,11,12,13,14,15,16, et certains, comme le zWEDGI 7, permettent des blessures manuelles. Cependant, il existe plusieurs inconvénients aux conceptions d’appareils disponibles. Par exemple, de nombreux appareils imprimés directement sur du plastique sont incompatibles avec l’imagerie sur des systèmes de microscope inversé en raison de leur faible transparence optique. De plus, les canaux parallèles permettent une imagerie multipositionnelle10,11, mais le mouvement physique de la platine du microscope introduit un décalage dans l’acquisition de l’image. Il est difficile d’itérer et d’optimiser à plusieurs reprises pour résoudre ces problèmes si l’on considère l’investissement financier et technique requis pour chaque nouvelle conception, en particulier pour les méthodes actuelles de fabrication de dispositifs utilisant la lithographie douce au polydiméthylsiloxane (PDMS). La toute première étape, la création d’un moule maître, nécessite souvent la connaissance d’un logiciel de modélisation 3D, l’accès à des équipements de fabrication spécialisés et (selon le matériau utilisé) un traitement anti-adhérence supplémentaire tel que la silanisation avant même que le moule ne soit utilisé. Le durcissement du PDMS une fois coulé prend au moins une heure à haute température, et généralement, doit être effectué sous vide ou avec une pince pour de meilleurs résultats, souvent dans une salle blanche 7,17,18. Comme en biologie du développement, ces coûts peuvent rapidement s’avérer prohibitifs pour des expériences nécessitant de nombreux environnements microfluidiques uniques sur plusieurs modèles.
Parmi les matériaux de construction alternatifs disponibles, le polyéthylène téréphtalate (PET) est durable, non toxique et facile à manipuler. Les feuilles de PET sont des pochettes de laminage en plastique largement disponibles dans la plupart des magasins de fournitures de bureau, avec un adhésif activé thermiquement pré-appliqué (généralement de l’éthylène-acétate de vinyle). En façonnant ces feuilles de PET à l’aide de découpeuses artisanales disponibles dans le commerce (c’est-à-dire des traceurs de découpe contrôlés par ordinateur conçus pour les bricoleurs amateurs) et en collant les couches les unes aux autres à l’aide d’un équipement de laminage thermique standard, un large éventail de conceptions potentielles peut être rapidement généré et itéré. Nous avons donc adapté une méthode de conception et de construction précédemment décrite impliquant du PET18 empilé pour créer le Rotational Assistant pour la Danio Imaging of Subsequent Hailing (RADISH) (Figure 1A,B). Une disposition rotative de plusieurs canaux de retenue en forme de coin optimise la proximité tout en laissant de la place pour la transsection manuelle de la nageoire caudale, permettant l’imagerie immédiatement après la blessure et l’imagerie simultanée à long terme de plusieurs embryons de poisson-zèbre blessés dans le même champ de vision. De plus, cette méthode de construction réduit considérablement les coûts d’investissement initiaux et le temps nécessaire à la construction du dispositif tout en maintenant la réutilisabilité.
Cette étude a utilisé des embryons 3 jours après la fécondation (dpf), mais peut être conçue pour utiliser de 2 à 14 embryons dpf. L’expérience du poisson-zèbre a été menée selon les normes internationalement acceptées. Le protocole de soin et d’utilisation des animaux a été approuvé par le Purdue Animal Care and Use Committee (PACUC), conformément aux lignes directrices pour l’utilisation du poisson-zèbre dans le programme de recherche intra-muros des NIH (numéro de protocole : 1401001018).
1. Assemblage du dispositif microfluidique PET
REMARQUE : Toute partie de ce protocole peut être interrompue à tout moment, à l’exception des étapes 1.8 et 1.9, qui sont sensibles au temps de séchage du cyanoacrylate.
2. Positionnement des embryons dans le RADISH et préparation à l’imagerie
3. Imagerie des transitoires calciques après une blessure
REMARQUE : Cette section et la section 4 sont facultatives et fournies à titre d’exemples d’expériences potentielles.
4. Imagerie du recrutement des neutrophiles après une blessure
Pour comparer la qualité d’image produite par un confocal à balayage laser avec et sans l’aide du RADISH, des embryons exprimant le biocapteur calcique intensiométrique GCaMP6f22,24 dans la couche épithéliale externe ont été colorés à l’aide de MemGlow 560 et imagés avec un confocal à balayage laser inversé couvrant toute l’épaisseur du pli de la nageoire caudale à un intervalle de temps de 1 min par image (Vidéo 2). Sans le dispositif (Figure 3A), les échantillons ont dérivé de manière significative et ont présenté des artefacts de bandes, résultant de la limitation de la pile Z à 25 tranches pour s’adapter à la résolution temporelle spécifiée par rapport à l’imagerie avec le dispositif (Figure 3B). Le RADISH a ensuite été utilisé pour examiner les transitoires calciques immédiatement après la blessure chez les embryons exprimant Tg(krt4 :Gal4, UAS :GCaMP6f) x (cdh1-dTomato)xt1821, mettant en évidence la E-cadhérine endogène en rouge et le calcium cytoplasmique dans l’épithélium apical en vert. Les embryons ont été blessés parallèlement aux côtés de la chambre centrale à l’aide d’une lame de scalpel (Figure 4A et Vidéo 3) ou par ablation laser directe avec un laser IR (Figure 4B), puis imagés sur toute l’épaisseur du pli de la nageoire caudale.
Pour démontrer l’efficacité du RADISH pour l’imagerie à plus long terme, nous avons étudié le recrutement des cellules immunitaires sur le bord de la plaie pendant 24 heures après la blessure. Quatre embryons de poisson-zèbre à 3 dpf exprimant Tol2(mpx :Dendra2) pour marquer les neutrophiles en vert23 ont été blessés par la section de la queue et imagés pendant 24 heures consécutives (Figure 5). Les artefacts d’imagerie généralement associés aux embryons tardifs de 3 dpf à 4 dpf, tels que l’inclinaison et le flottement, étaient remarquablement absents (vidéo 4), et la repousse des tissus s’est poursuivie sans entrave pendant l’expérience. Le recrutement des neutrophiles sur le bord de la plaie se poursuit tout au long de l’image (Figure 5B), la plupart des cellules migratrices partant 24 heures après la blessure (Figure 5C), ce qui correspond à la résolution attendue del’inflammation 25,26.
Figure 1 : Conception et utilisation d’un dispositif microfluidique à stratifié PET (RADISH). (A) Schéma illustrant la disposition et l’épaisseur des couches individuelles de PET, l’assemblage, le montage et l’utilisation du dispositif. (B) Produit final, monté dans une découpe de 3/4" dans un plat de 35 mm. (C) 3 embryons dpf, (D) 5 embryons dpf, (E) 14 embryons dpf logés à l’intérieur du dispositif. Barres d’échelle = 1 000 μm (C, D, E). Abréviations : PET = polyéthylène téréphtalate ; RADISH = assistant en rotation pour l’imagerie Danio de la cicatrisation ultérieure ; DFF = jours après la fertilisation. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 2 : Illustration photographique étape par étape de l’assemblage d’un dispositif PET. (A) Couches individuelles en PET avant laminage. (B) Couche de PET fixée à la lamelle de 25 mm à l’aide de ruban adhésif. (C) Dispositif en cours fixé à un support en plastique pour le laminage. (D) Dispositif stratifié PET terminé. (E) Antenne parabolique de 35 mm modifiée avant le montage de l’appareil. (F) Appareil terminé. Abréviation : PET = polyéthylène téréphtalate. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 3 : Amélioration de la qualité des images confocales à balayage laser d’embryons de 3 dpf dans le design RADISH. (A) Image représentative d’un embryon de 3 dpf Tg(krt4 :Gal4, UAS :GCaMP6f) coloré avec MemGlow 560 sans utiliser le RADISH. (B) Image représentative de l’embryon Tg(krt4 :Gal4, UAS :GCaMP6f) coloré avec MemGlow 560 monté dans le RADISH. Barre d’échelle = 100 μm. Abréviations : RADISH = assistant de rotation pour l’imagerie Danio de la cicatrisation ultérieure ; DFF = jours après la fertilisation. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 4 : Compatibilité de la conception RADISH avec plusieurs techniques de blessure. (A) 3 dpf Tg(krt4 :Gal4, UAS :GCaMP6f) x (cdh1-dTomato)xt18 embryon blessé par transsection manuelle de la nageoire caudale. (B) Embryon blessé par ablation au laser. (C, D) Les mêmes embryons 4 minutes plus tard, montrant la progression des transitoires calciques après la blessure. Barres d’échelle = 100 μm. Abréviations : RADISH = assistant de rotation pour l’imagerie Danio de la cicatrisation ultérieure ; DFF = jours après la fertilisation. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 5 : Piégeage à long terme d’embryons pour l’imagerie de la migration des phagocytes. (A) Les embryons Tol2(mpx :Dendra2) post-blessure et les mêmes embryons (B) 25 min, (C) 12 h et (D) 24 h plus tard. Barres d’échelle = 100 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Fichier supplémentaire 1 : Fichiers vectoriels et PNG pour la conception du dispositif RADISH, comme illustré à la figure 1A. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Vidéo 1 : Vidéo en fond clair de la section manuelle de l’aileron arrière à l’aide de la conception du dispositif RADISH. Abréviation : RADISH = assistant de rotation pour l’imagerie Danio de la cicatrisation ultérieure. Veuillez cliquer ici pour télécharger cette vidéo.
Vidéo 2 : Comparaison d’embryons non montés et d’embryons montés de 3 dpf Tg(krt4 :Gal4, UAS :GCaMP6f) de la figure 3, acquis à 1 image/min. Veuillez cliquer ici pour télécharger cette vidéo.
Vidéo 3 : Transitoires calciques dans les embryons Tg(krt4 :Gal4, UAS :GCaMP6f) x (cdh1-dTomato)xt18 blessés par section de scalpel ou ablation laser de la figure 4, acquis à 1 image/min. Veuillez cliquer ici pour télécharger cette vidéo.
Vidéo 4 : Imagerie à long terme du recrutement des leucocytes et de la régénération de la nageoire caudale chez les embryons de Tol2(mpx :Dendra2). Abréviations : RADISH = assistant de rotation pour l’imagerie Danio de la cicatrisation ultérieure ; HPW = heures après la blessure. Veuillez cliquer ici pour télécharger cette vidéo.
Le principe de base de la méthode de laminage PET implique la réduction des coûts et la minimisation des barrières techniques à l’entrée par rapport aux méthodes traditionnelles de création de dispositifs microfluidiques, telles que la lithographie douce ou le moulage PDMS. En tant que tel, les seules étapes critiques de ce protocole sont l’alignement précis des couches de PET lors du laminage et l’imperméabilisation des bords de l’appareil après la construction. Toutes les autres parties de la méthode peuvent être modifiées en fonction des besoins expérimentaux (par exemple, si l’immobilisation d’embryons plus jeunes ou plus âgés est nécessaire, l’épaisseur des couches de PET peut être ajustée pour rétrécir ou élargir le canal en conséquence). Les motifs peuvent être créés dans n’importe quelle forme et stratifiés sur n’importe quel matériau de base, à condition que le matériau soit résistant à la chaleur et suffisamment fin pour être envoyé à travers la plastifieuse18,27. Comme les feuilles de PET sont découpées à l’aide de découpeuses artisanales disponibles dans le commerce, qui lisent des fichiers d’image bidimensionnels plutôt que tridimensionnels, la conception et l’itération d’un appareil donné ne nécessitent que la capacité de manipuler des formes en noir et blanc dans un programme d’édition d’images, ce qui réduit considérablement la difficulté. Cette flexibilité dans le choix des logiciels et la disponibilité commerciale des matériaux utilisés représentent une augmentation spectaculaire de l’accessibilité des dispositifs microfluidiques en général, permettant leur utilisation dans n’importe quel laboratoire ou salle de classe pour un coût initial de moins de 500 $ au moment de la rédaction de cet article, contre plus de 2000 $ en coûts d’équipement de départ pour la fabrication de moules PDMS17.
De plus, le temps nécessaire à la création d’un seul appareil utilisable à l’aide de cette méthode est considérablement réduit par rapport à la lithographie douce typique. En supposant une familiarité avec le logiciel requis, un dispositif microfluidique unique de stratifié PET peut être conceptualisé, fabriqué et immédiatement utilisé en ~3 h, y compris le temps de durcissement du cyanoacrylate. L’itération prend encore moins de temps, en fonction de l’ampleur des modifications nécessaires aux fichiers de conception originaux, et plusieurs variantes d’appareils peuvent être créées en parallèle avec un minimum de temps supplémentaire investi et aucun équipement supplémentaire. Bien que les dispositifs créés à l’aide de cette méthode soient moins durables que ceux fabriqués avec PDMS pour diverses raisons (notamment la défaillance de l’adhésif et les contraintes internes pour les formes avec de nombreuses couches et de longs rapports d’aspect), leur nature peu coûteuse et leur fabrication évolutive signifient qu’ils sont beaucoup plus faciles à remplacer. Étant donné que les découpeuses artisanales commerciales sont commercialisées avec la capacité de répéter la même coupe précise encore et encore et que le PET n’a pas de date d’expiration, les couches individuelles d’une conception terminée peuvent être pré-préparées en vrac pour l’assemblage et l’utilisation à tout moment dans le futur, ce qui réduit encore l’investissement global en temps requis.
Cependant, la vitesse et la variabilité se font au détriment de la précision. La principale limitation du laminage PET par rapport au moulage PDMS traditionnel est la résolution spatiale. Les découpeurs artisanaux commerciaux ont souvent du mal à utiliser les angles vifs sur des formes inférieures à environ 500 μm, et les feuilles de laminage PET ne sont pas disponibles à des épaisseurs inférieures à 33 μm (sans compter l’épaisseur de l’adhésif lui-même, qui n’est pas incluse dans la mesure sur l’emballage), ce qui limite considérablement l’échelle à laquelle cette technique peut être appliquée. Le nombre maximum de couches est également limité par la taille de la plastifieuse, qui peut varier d’un fabricant à l’autre.
La version finale du protocole, y compris les variations dans les techniques d’enregistrement et d’alignement, les fournisseurs de matériaux et les logiciels, dépendra en grande partie des préférences de l’utilisateur. Cependant, l’accessibilité et la flexibilité globale de la méthode réduisent le coût de l’adaptation. Les utilisateurs individuels sont encouragés à itérer autant que nécessaire pour adapter l’approche à leurs besoins uniques.
Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.
Les travaux ont été soutenus par des fonds de recherche des National Institutes of Health (R35GM119787 to QD). Ce travail est basé sur les efforts soutenus par l’Institut EMBRIO, contrat NSF #2120200, un institut d’intégration de la biologie de la National Science Foundation (NSF). L’imagerie confocale a été réalisée à l’installation d’imagerie de Purdue. Nous remercions le Dr Guangjun Zhang (Université Purdue) d’avoir fourni la ligne Tg(UAS :GCaMP6f). Nous remercions le Dr David Tobin (Université Duke) d’avoir fourni la lignée (cdh1-tdtomato)xt18.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
25 mm diameter round coverglass #1 thickness | Chemglass Life Sciences | CLS-1760-025 | Base mounting material. Thickness was chosen based on the specifications of the microscope lens. |
Adobe Illustrator v28.5 | Adobe | N/A | Vector editor for designing the device pattern. |
Calcium Chloride Dihydrate | Fisher | C79 | For making E3 medium. |
Design PNG Files (Online Mirror) | N/A | N/A | https://i.ibb.co/QPYj7BL/multipositionalv7-1.png https://i.ibb.co/FDpQYXc/multipositionalv7-2.png https://i.ibb.co/5TG4SB6/multipositionalv7-3.png |
Design Space for Desktop v8.39 | Cricut | N/A | Proprietary software to drive the craft cutter. |
Fusion Plus 7000L | GBC | 1703098 | Thermal laminator. This specific model was selected for quality of life features, such as maximum sheet stack size. |
German Carbide Premium Blade | Cricut | 10396595 | Replacement blade for craft cutter. |
Gray Basic Tool Set | Cricut | 10307854 | Tool set for weeding cuts, cleaning mats, and mounting PET sheets. Optional. |
Magnesium Chloride Hexahydrate | Acros Organic | 223211000 | For making E3 medium. |
Maker 3 | Cricut | 10669040 | Craft cutter. The Cricut Maker 3 was selected over the Silhouette Cameo 4 for software user friendliness, but any craft cutter capable of reading black and white images will work. |
MemGlow 560 | Cytoskeleton | MG02-10 | Red live cell dye for cell membranes. No washing needed. Used in Figure 3. |
No. 22 Carbon Scalpel Blade | Surgical Design | 22-079-697 | Scalpel blade for manual cut adjustments. Any similar craft knife (e.g., X-acto #2 knife) will also work. |
Potassium Chloride | Fisher | BP366 | For making E3 medium. |
Sodium Chloride | Fisher | BP358 | For making E3 medium. |
StandardGrip Adhesive Cutting Mat | Cricut | 10138842 | Mounting mat for craft cutter. The LightGrip cutting mat will also work, but avoid the StrongGrip and FabricGrip cutting mats as the strength of the adhesive may warp the final cut during weeding and removal. Adhesive on mats will eventually wear out with continued use; replace mats as needed. |
Stationery Tape 12 mm | Deli | 30014 | Office tape. Deli brand was chosen via testing for ease of removal after lamination. |
Super glue, liquid | Loctite | 1364076 | Cyanoacrylate glue. Glue used must be liquid. Gel formulations will not sufficiently seal or waterproof device edges. |
PET Thermal Laminating Pouches, 3 mil | Scotch | TP3854 | PET sheets with thermal adhesive. Sheets arrive as sandwiched pairs and should be separated before use. Cut with adhesive side facing down. |
PET Thermal Laminating Pouches, 5 mil | Scotch | TP5854 | PET sheets with thermal adhesive. Sheets arrive as sandwiched pairs and should be separated before use. Cut with adhesive side facing down. |
Tricaine (MS-222) | Syndel | IC10310680 | Fish anaesthetic. |
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