Method Article
* 이 저자들은 동등하게 기여했습니다
이 프로토콜은 밀도 구배 원심분리를 사용하여 HSD를 먹인 염분에 민감한 쥐로부터 장내 미생물 EV를 분리하는 방법을 설명합니다. EV는 나노입자 추적, TEM, LPS/BCA 분석 및 16S rRNA 염기서열분석을 통해 크기, 형태, 구성 및 미생물군 기원을 분석했습니다.
높은 염분 섭취는 고혈압의 주요 위험 요소이며, 그 기저에 있는 메커니즘은 장내 미생물총(microbiota)이 분비하는 세포외 소포체(EV)와 밀접하게 관련되어 있을 수 있습니다. 장내 미생물총(microbiota)에 의해 생산되는 이러한 EV는 고염 식단(HSD)으로 인한 고혈압 발병에 중요한 역할을 할 수 있는 다양한 생체 활성 성분을 가지고 있습니다. 이 메커니즘을 조사하기 위해 우리는 HSD를 먹인 염분에 민감한 쥐의 장내 미생물군에서 EV를 분리하기 위해 밀도 구배 원심분리를 기반으로 하는 효율적인 추출 방법을 개발했습니다. 입자 크기 분석, 투과전자현미경(TEM) 및 지질다당류(LPS) 검출을 통해 장내 미생물군 EV의 기울기 분포를 확인하고 정밀한 추출을 달성했습니다. 또한, 16S rRNA 유전자 염기서열분석을 통해 정상 그룹과 HSD 그룹 간 EV의 기원 및 구성 차이를 분석하여 높은 염분 섭취가 장내 미생물군 EV의 유전적 특성에 미치는 영향을 밝혔습니다. 이 연구는 염분 유발 고혈압의 기저에 있는 장내 미생물군 메커니즘에 대한 귀중한 도구와 과학적 통찰력을 제공하고 관련 질병의 예방 및 치료에 대한 새로운 관점을 제공합니다.
장내 미생물총(microbiota microflora) 또는 장내 미생물 생태학(gut microecology)으로도 알려진 장내 미생물군(microbiota)은 생물학적 위장관에 위치한 수만 개의 미생물로 이루어진 복합체로, 인간의 건강 유지에 중요한 역할을 합니다1. 최근 몇 년 동안 추가 연구를 통해 장내 미생물총(microbiota)이 세포외 소포체(EV)를 생성할 수 있다는 사실이 밝혀졌습니다2. EV는 세포에서 방출되는 작은 소포로, 세포에서 단백질, 핵산 및 지질과 같은 다양한 분자를 운반합니다 3,4. 그들은 다른 미생물5, 장 상피 세포, 심지어 먼 조직 및 장기6와 상호 작용할 수 있으므로 인체 건강 7,8에 영향을 미칠 수 있습니다. 이러한 장내 미생물총(microbiota)에 의해 생성되는 전기차와 식단 사이에는 밀접한 연관성이 있습니다9.
장내 미생물총(microbiota)에 의해 생성되는 EV는 고염 식단(HSD)이 신체 건강에 영향을 미치는 중요한 병원체일 수 있습니다. HSD는 장내 미생물총(microbiota10)의 균형을 직접적으로 교란시켜 유익한 박테리아(예: 락토바실러스)11의 수를 현저히 감소시킬 뿐만 아니라11 해로운 박테리아(예: 박테로이드(Bacteroides) 등)의 증식을 촉진합니다.12. 이러한 불균형은 장 장벽 기능을 감소시키고 장 염증의 위험을 증가시킵니다. 또한, HSD는 여러 생리적 기능을 가진 단쇄 지방산14,15의 생성을 감소시키는 것과 같이 장내 미생물총(microbiota)의 대사 활동(13)을 변화시킴으로써 장에서의 산-염기 균형과 영양소 흡수에 더 많은 영향을 미친다.
이러한 변화는 장 건강에 영향을 미칠 뿐만 아니라 EV의 생산 및 방출을 간접적으로 조절하고 EV의 구성과 기능을 변화시킬 수 있습니다. 고염분 환경은 EV의 방출 및 수송을 포함한 장 세포의 정상적인 생리적 기능에 영향을 미칠 수 있으며, 이로 인해 세포 간 정보 전달 및 면역 조절에서 EV의 역할을 방해할 수 있습니다. 동시에, 장 염증은 특수 기능16을 가진 다양한 EV를 촉진하고 장 장기 축 및 기타 방법을 통해 전신으로 퍼질 수 있습니다17, 18, 이는 고혈압19, 20, 심혈관21 및 뇌 혈관 질환22, 23, 비만24, 25, 당뇨병26의 발생 및 발병과 밀접한 관련이 있습니다 및 기타 만성 질환.
따라서 본 연구의 전반적인 목표는 HSD를 먹인 염분에 민감한 쥐의 장내 미생물군에서 EV를 추출하고 그 물리적 특성, 구성 및 기능을 체계적으로 연구하는 효율적이고 신뢰할 수 있는 방법을 개발하는 것이었습니다. 고염 식단 후 혈압이 현저히 상승하는 특성으로 인해 염분에 민감한 쥐를 선정하여 효율적인 추출 방법을 구축하여 HSD가 장내 미생물총에 미치는 영향을 밝혔습니다. 이 방법은 밀도 구배 원심분리를 기반으로 하며 입자 크기 감지, LPS/BCA 측정, 투과 전자 현미경 및 단백질체 분석과 같은 다양한 동적 식별 기술을 결합했습니다. 이 프로토콜은 HSD가 장내 미생물총(microbiota EV)에 미치는 영향과 심혈관 질환에 대한 HSD의 메커니즘을 밝히는 것을 목표로 합니다. 높은 효율성, 재현성 및 광범위한 적용 가능성을 갖춘 이 접근 방식은 염분 유발 고혈압에서 장내 미생물군 EV의 메커니즘을 탐구하는 데 중요한 도구를 제공할 뿐만 아니라 EV를 기반으로 질병 중재 전략을 개발하기 위한 이론적 토대를 마련합니다. 이 연구를 통해 고혈압과 같은 심혈관 질환의 예방과 치료를 위한 새로운 길을 열 수 있기를 희망한다27,28.
이 동물 실험 연구는 관련 윤리 지침 및 국제 표준을 준수합니다. 동물을 대상으로 한 연구는 청두중의과대학 실험동물복지윤리위원회(기관: Chengdu University of Chinese Medicine, 프로토콜 번호: 2018-21)의 승인을 받았다.
1. 동물 준비 및 식단 체계
2. 혈압 모니터링
참고: 꼬리 커프 혈량측정은 혈압 측정을 위한 비침습적 방법으로 사용되었으며, 꼬리 혈액량에서 혈압을 측정할 때 체적 압력 기록(VPR)이 사용되었습니다.
3. EV 추출
4. EV 식별
EV의 농도는 서로 다른 분획으로 측정되었습니다(그림 2A). 실험 결과는 EV의 농도가 일련의 밀도 구배 솔루션에서 일반적인 정규 분포 패턴을 나타내는 것으로 나타났습니다(그림 2B). 구체적으로, 분수 9에서 EV의 농도가 최고점(3.85 x 109)에 도달했으며, 이는 EV의 주분포 분율이 936일 수 있음을 시사합니다.
단백질 함량을 측정하기 위해 BCA 키트를 사용하여 다양한 분획의 단백질 함량을 평가했습니다(그림 2C). 이 방법에서 분획 9의 단백질 함량은 0.417μg/μL였으며, 이는 EV의 분포를 더욱 입증합니다. LPS는 그람 음성 박테리아 37,38의 고유한 구성 요소이기 때문에 내독소 검출 키트를 사용하여 LPS의 발현을 결정하고(그림 2D) 다른 분획의 EV 분포를 평가했습니다. 실험 결과 분수 9와 10에서 LPS 발현이 다른 분획보다 유의하게 높았고(분수 9에 대한 흡광도 = 0.8086, 분수 10에 대한 흡광도 = 0.8515), 분포가 정규 분포를 보였으며, 이는 EV가 주로 분수 9에 분포되어 있음을 증명했습니다. 분획 9에서 상대적으로 더 많은 양의 단백질이 다른 분획에서 분리된 EV의 SDS-PAGE 겔 전기영동에서도 관찰되었습니다(그림 2E).
이 연구는 투과전자현미경(TEM; 그림 2F). TEM의 고해상도 이미징을 통해 EV의 생물학을 이해하는 데 중요한 원형 멤브레인과 같은 구조를 특징으로 하는 EV의 형태학적 구조를 명확하게 시각화할 수 있었습니다.
혈압 변화는 쥐의 NSD 및 HSD에서 사육 2개월 후 NSD 및 HSD 그룹에서 결정되었습니다. HSD 그룹에서 SBP(그림 3A), DBP(그림 3B) 및 MBP(그림 3C)가 유의하게 증가한 것을 볼 수 있으며, 이는 본 연구의 고혈압 모델이 성공적으로 구축되었음을 나타냅니다.
본 연구에서는 서로 다른 그룹에서 EV의 농도를 감지했으며(그림 3D), 그 결과 HSD 그룹의 EV의 농도가 NSD 그룹의 쥐보다 유의하게 높은 것으로 나타났습니다. 이는 HSD가 EV의 수준에 영향을 미치며, 이는 잠재적으로 EV가 유래한 장내 미생물총(microbiota)의 구성 변화로 인한 것임을 시사합니다.
그런 다음 이 연구에서 EV의 입자 크기를 측정했습니다. 측정 결과에 따르면 EV의 입자 크기는 주로 약 60nm이며(그림 3E), HSD 그룹의 입자 크기는 NSD 그룹의 입자 크기보다 약간 낮습니다. 측정된 데이터는 EV의 크기 분포와 균질성을 평가하기 위한 중요한 정보를 제공하여 후속 실험 설계 및 애플리케이션 개발을 용이하게 합니다.
그런 다음 본 연구에서는 HSD 그룹과 NSD 그룹에서 EV의 LPS 발현량을 조사했습니다(그림 3F). 그 결과, HSD 그룹에서 EV에 의한 LPS 발현도 NSD 그룹보다 유의하게 높은 것으로 나타났습니다. 이는 엑소베시클 유래 장내 미생물총(exovesicle-derived gut microbiota)에서 그람 음성 박테리아(Gram-negative bacteria)가 증가하거나 NSD 그룹보다 HSD 그룹에서 EV의 농도가 더 높기 때문일 수 있습니다.
HSD군과 NSD 군의 EV의 차이를 더욱 뒷받침하기 위해 본 연구는 유래된 장내 미생물군을 조사하고 NSD 및 HSD 그룹의 EV 샘플에 대해 16S rRNA 염기서열분석을 수행하여 생쥐의 장내 미생물군에서 EV에 대한 HSD의 영향을 더욱 명확히 했습니다.
α-다양성 분석은 HSD 그룹에서 장내 미생물총의 다양성이 크게 감소했으며 Shannon 및 ACE 지수가 모두 감소하는 것으로 나타났습니다(그림 4A). β - PCoA(그림 4B)를 기반으로 한 다양성 분석은 ASV 수준에서 그룹 간의 미생물 표현형을 구별했습니다. 고염도 중재는 장내 미생물군의 표현형 변화를 부분적으로 역전시켰고 그룹 간 외부 소포 유래 장내 미생물총(microbiota)의 구성에서 상당한 차이를 발견했습니다(p = 0.001).
저농도 박테리아를 필터링하고 데이터를 표준화한 후 분류학 주석은 샘플에서 다양한 범위의 미생물 군집을 식별했습니다. 엑소베시클 유래 장내 미생물군은 주로 프로테오박테리아(Proteobacteria, 93.19%), 피르미쿠테스(Firmicutes, 4.57%), 박테로이도타(Bacteroidota, 1.19%)로 구성되었다. 그림 4C). HSD 그룹은 Firmicutes 외부 소포의 풍부도를 유의하게 증가시켰습니다(그림 4D). 속 수준에서는 Nevskia 및 Acinetobacter와 같은 속이 NSD 그룹에서 더 풍부했던 반면, Delftia, Burkholderia_Ca 및 Clostridium_sen 속은 HSD 그룹에서 더 풍부했습니다(그림 4E). 또한 이 연구에서는 히트맵을 사용하여 HSD 그룹과 NSD 그룹 간의 장내 미생물총 EV의 차이를 보여주었습니다(그림 4F). 고염분 중재 후 일부 박테리아인 Delftia 및 Burkholderia_Ca의 풍부함은 크게 증가했으며 Nevskia와 Acinetobacter는 크게 감소했습니다(그림 4G). 결론적으로, 높은 염분 개입은 주로 부모 박테리아의 분포를 변화시켰기 때문에 장내 미생물 유래 EV의 생산 차이를 크게 변화시켰으며, 주요 특징은 다양성의 감소, 평형 구조의 변화, 다른 박테리아의 풍부도의 변화였습니다.
그림 1: 장내 미생물 유래 외소포의 추출 및 특성화. (A) 외소포 추출의 흐름도. (B) 외부 소포의 특성화. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2: EV의 기본 특성화 및 국소 밀도 구배 분석. (A) 다양한 밀도 구배(nm, 입자/mL)를 사용한 소포외 농도 및 입자 크기 측정. (B) 밀도 구배 3 - 16(입자수/mL)에 의한 용액 외부 소포 농도 비교. (C) BCA 키트에 의한 밀도 구배 6-12에 대한 용액 단백질 함량 측정(μg/mL). (D) 용액: 내독소 검출 키트(Abs)를 사용한 밀도 구배 7-11에 의한 LPS 발현 측정. (E) 밀도 구배가 6 - 12인 용액을 SDS-PAGE 겔 전기영동을 실시하고 Coomassie brilliant blue로 염색했습니다. (F) TEM : 스케일 바는 100nm입니다. 개별 소포가 이미지에 표시되어 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3: 다양한 식단에 따른 혈압 및 EV의 변화 분석. (A) SBP; (B) DBP; (C) MBP; (D) HSD 및 NSD 그룹의 외부 소포 농도 비교; (E) HSD 및 NSD 그룹의 외부 소포 크기 비교. (F) 분광 광도계에 의해 결정된 NSD 및 HSD 샘플의 LPS. *p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001, NS는 유의성 없음을 의미하며, t-검정입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 4: 다양한 식단에서 16s rRNA 테스트 분석. (A) α 다양성 분석; (B) 주요 좌표 분석; (C) 문(phyla) 수준에서 장내 미생물총(microbiota)의 풍부함; (D) 문 수준 박테리아의 변화; (E) LEfSe 결과; (F) 차등 박테리아 속을 기반으로 한 클러스터 히트맵 분석; (G) 속 수준 박테리아의 변화. *p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001, NS는 유의성 없음을 의미하며, t-검정입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
이 연구에서는 HSD에서 염분에 민감한 쥐의 장내 미생물군 EV에 초점을 맞추고 일련의 주요 성과를 달성했습니다. 첫째, HSD의 염분에 민감한 쥐의 장내 미생물군으로부터 EV를 분리하기 위해 밀도 구배 원심분리를 기반으로 하는 효율적인 추출 방법을 성공적으로 구축했으며, 세심하고 표준화된 동물 실험 조작 및 샘플 처리 프로세스를 통해 대부분의 비 EV 구성 요소를 분리했습니다. 밀도 구배 원심분리의 EV 추출 방법은 매우 효율적이고 재현성이 뛰어나 기존의 초원심분리 방법보다 우수하며 EV의 무결성과 기능을 더 잘 유지할 수 있어 시료 품질과 연구 타당성을 보장할 수 있습니다.
둘째, EV는 다양한 동적 기술을 통해 종합적으로 식별되었습니다: 입자 크기 및 농도 감지는 EV가 특정 크기 분포를 가지고 있음을 나타냅니다. LPS 및 BCA 측정은 EV의 단백질 함량과 LPS 발현을 정량화합니다. TEM은 EV의 형태학적 구조를 명확하게 보여줍니다. 그리고 단백질 특성은 단백질 스펙트럼을 정의합니다. 이러한 식별 결과는 EV의 물리적 및 생화학적 특성을 종합적으로 밝혀 후속 연구를 위한 신뢰할 수 있는 데이터 지원을 제공합니다.
또한, 정상 EV와 HSD EV의 기원과 구성 차이에 대한 심층 분석, α-다양성 분석 및 β-다양성 분석을 이용한 16S rRNA 유전자 염기서열 분석 기술을 통해 높은 염분 섭취가 미생물 군집 구조, 종 풍부도, 다양성 등 장내 미생물 EV의 유전적 특성에 유의한 영향을 미친다는 것을 보여주었으며, 이를 통해 고염 식단이 장내 미생물군 EV에 미치는 영향을 보다 종합적으로 해결할 수 있었습니다. 기계론적 연구를 위한 여러 수준의 증거를 제공합니다.
이 방법은 엑소좀 회수율 및 무결성 측면에서 기존의 과속 원심분리 방법에 비해 몇 가지 장점이 있지만, 샘플 수요가 많고 미생물 소스와 숙주를 구별하기 어려운 등 여전히 몇 가지 제한 사항이 있습니다. 그러나 밀도 구배 원심분리는 기존 방법과 비교했을 때 엑소좀의 기능적 무결성을 유지하는 데 있어 고유한 장점이 있으며, 이는 고염분 식단이 장내 세균총을 통해 숙주 혈압에 영향을 미치는 메커니즘에 대한 추가 연구를 위한 신뢰할 수 있는 기술 지원을 제공합니다. 또한, 실험 중에 발생한 불분명한 구배 층화에 대해서는 원심분리 시간을 연장하거나 고성능 로터를 교체하여 개선했습니다.
미래에는 고염 식단에 의해 유발된 고혈압에서 장내 미생물군 EV의 메커니즘, 특히 전염증성 T 세포와 같은 면역 체계와의 상호 작용에 대해 더 자세히 탐구할 수 있습니다39,40; 또는 식물 유래 제품을 사용하여 장내 미생물 EVs41,42에 개입하고, 질병에 더 나아가 개입하고, 숙주 대사 및 면역 반응을 조절하는 역할을 탐구합니다.
결론적으로, 본 연구는 염분에 민감한 쥐 모델을 통해 장내 미생물총(microbiota)의 염분 유발 고혈압 기전을 규명할 수 있는 중요한 도구를 제공할 뿐만 아니라, HSD, 장내 미생물군 및 EV의 관계에 대한 이해를 심화시킬 뿐만 아니라, 고혈압과 같은 심혈관 질환의 예방 및 치료를 위한 새로운 길을 열었으며, 식이-미생물-숙주 상호작용 연구를 위한 독특한 관점을 제공합니다.
저자들은 이 논문에 보고된 연구에 영향을 미칠 수 있는 경쟁적인 재정적 이해관계나 개인적 관계를 알려진 바가 없다고 선언합니다.
이 연구는 중국 국립자연과학재단(82205240), 쓰촨성 자연과학재단(2025ZNSFSC1836), 쓰촨성 정형외과 병원의 임상 기초 프로젝트(PY202414)의 지원을 받았다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Essential Supplies | |||
Centrifugal Filter (10nkDa 2 mL) | Millipore | UFC903096 | |
Centrifuge Tude(50 mL) | BKMAN | 20220404 | |
Centrifuge Tudes | BECKMAN COULTER | Z30815SCA | |
Vacuum Filtration System | Biosharp | 24902581 | |
Reagents | |||
Chromogenic LAL Endotoxin Assay Kit | Beyotime | 022124240705 | |
Coomassie Blue Fast Staining Solution | Beyotime | Z972241010 | |
EDTA | Damas-beta | P3117308 | |
Enhanced BCA Protein Assay Kit | Beyotime | A006241112 | |
Ethanol | KESH | ||
HCl | |||
OptiPrep (60% wt/vol, iodixanol) | Serumwerk | 00124 | |
PBS | Labshark | 130114005 | |
phosphotungstic acid | RUIXIN | ||
Sucrose | Damas-beta | P1917057 | |
Tris (VWR) | Damas-beta | P3061764 | |
Trypan blue staining solution (0.4%) | Beyotime | BD07242904 | |
Equipment | |||
Absorbance Microplate Reader | SpectraMax | ABP01690 | |
Biomicroscope | Motic | BA210Digital | |
Desk centrifuge | Cence | CHT210R | |
Desktop high-speed micro centrifuge | DLAB | D3024 | |
Fixed Angle Aluminum Rotor + 500 mL Centrifugal Cup | Cence | ||
High precision electronic balance | SKR | BN-200 | |
Laminar flow cabinet | Nantong Hunan Scientific Instrument Co., Ltd. | SW-CJ-2FDS | |
SW 32.1 Ti Swing bucket turn+ SW 32.1 Ti Rotor bucket | BECKMAN COULTER | ||
Transmission electron microscope | JEOL | JEM-1400FLASH | |
Tube rotator | |||
Ultracentrifuge | BECKMAN COULTER | Optima XE-100 | |
Ultra-pure water system | ULPHW | UPR-II-15TNZ | |
Water-Cieculation Multifunction Vacuum Pump | Qiang Qiang | SHZ-D(III) |
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