Method Article
* These authors contributed equally
הפרוטוקול מתאר בידוד של EVs מיקרוביאליים במעיים מחולדות רגישות למלח המוזנות ב-HSD באמצעות צנטריפוגה של שיפוע צפיפות. EVs אופיינו במעקב אחר ננו-חלקיקים, מבחני TEM, LPS/BCA וריצוף 16S rRNA כדי לנתח את הגודל, המורפולוגיה, ההרכב ומקור המיקרוביוטה.
צריכת מלח גבוהה היא גורם סיכון עיקרי ליתר לחץ דם, והמנגנון הבסיסי שלו עשוי להיות קשור קשר הדוק לשלפוחיות חוץ-תאיות (EVs) המופרשות על ידי מיקרוביוטת המעיים. EVs אלה, המיוצרים על ידי מיקרוביוטת המעיים, נושאים רכיבים ביו-אקטיביים שונים שעשויים למלא תפקיד מכריע בהתפתחות יתר לחץ דם הנגרם על ידי תזונה עתירת מלח (HSD). כדי לחקור את המנגנון הזה, פיתחנו שיטת מיצוי יעילה המבוססת על צנטריפוגה של שיפוע צפיפות כדי לבודד EVs ממיקרוביוטת המעיים של חולדות רגישות למלח שניזונו מ-HSD. באמצעות ניתוח גודל חלקיקים, מיקרוסקופ אלקטרונים הולכה (TEM) וזיהוי ליפופוליסכריד (LPS), זיהינו את התפלגות השיפוע של EVs של מיקרוביוטת המעיים והשגנו מיצוי מדויק. יתר על כן, ריצוף גנים 16S rRNA שימש לניתוח המקור וההבדלים בהרכב של EVs בין הקבוצה הנורמלית לקבוצת HSD, וחשף את ההשפעה של צריכת מלח גבוהה על המאפיינים הגנטיים של EVs של מיקרוביוטת המעיים. מחקר זה מספק כלים חשובים ותובנות מדעיות לגבי מנגנוני המיקרוביוטה של המעיים העומדים בבסיס יתר לחץ דם המושרה על ידי מלח ומציע נקודות מבט חדשות למניעה וטיפול במחלות קשורות.
מיקרוביוטת המעיים, הידועה גם בשם מיקרוביוטת המעיים או מיקרואקולוגיה של המעיים, היא קומפלקס של עשרות אלפי מיקרואורגניזמים הממוקמים במערכת העיכול הביולוגית וממלאת תפקיד מכריע בשמירה על בריאות האדם1. בשנים האחרונות, עם מחקר נוסף, נמצא כי מיקרוביוטת המעיים יכולה לייצר שלפוחיות חוץ-תאיות (EVs)2. EVs הם שלפוחיות קטנות המשתחררות על ידי תאים, הנושאות מולקולות שונות בתא, כגון חלבונים, חומצות גרעין ושומנים 3,4. הם יכולים לקיים אינטראקציה עם חיידקים אחרים5, תאי אפיתל במעי ואפילו רקמות ואיברים מרוחקים6, ובכך להשפיע על בריאות גוף האדם 7,8. קיים קשר הדוק בין ה-EVs המיוצרים על ידי מיקרוביוטת המעיים הללו לבין דיאטה9.
EVs המיוצרים על ידי מיקרוביוטת המעיים עשויים להיות גורמים משמעותיים שדרכם תזונה עתירת מלח (HSD) משפיעה על בריאות הגוף. HSD לא רק משבש באופן ישיר את האיזון של חיידקי המעיים10, מה שמוביל להפחתה משמעותית במספר החיידקים המועילים (כגון לקטובצילוס)11, אלא גם מקדם התפשטות של חיידקים מזיקים (כגון בקטרואידים וכו').12. חוסר איזון זה מפחית את תפקוד מחסום המעי ומגביר את הסיכון לדלקת מעיים. בנוסף, HSD משפיע עוד יותר על איזון החומצה-בסיס וספיגת החומרים המזינים במעי על ידי שינוי הפעילויות המטבוליות13 של מיקרוביוטת המעי, כגון הפחתת ייצור חומצות שומן קצרות שרשרת 14,15 עם פונקציות פיזיולוגיות מרובות.
שינויים אלה לא רק משפיעים על בריאות המעיים אלא גם עשויים לווסת בעקיפין את הייצור והשחרור של רכבים חשמליים ולשנות את הרכב ותפקוד ה-EV. סביבת המלח הגבוהה עלולה להשפיע על התפקודים הפיזיולוגיים הרגילים של תאי המעי, כולל שחרור והובלה של EVs, ובכך להפריע לתפקידם של EVs בהעברת מידע בין-תאי ובוויסות חיסוני. יחד עם זאת, דלקת מעיים עלולה לקדם מגוון EVs בעלי פונקציות מיוחדות16 ולהתפשט לכל הגוף דרך ציר המעי-איבר ודרכים אחרות17,18, הקשור קשר הדוק להתרחשות והתפתחות יתר לחץ דם19,20, לב וכלי דם21 ומחלות כלי דם במוח22,23, השמנת יתר24,25, סוכרת26 ומחלות כרוניות אחרות.
לכן, המטרה הכוללת של מחקר זה הייתה לפתח שיטה יעילה ואמינה לחלץ EVs ממיקרוביוטת המעיים של חולדות רגישות למלח שניזונו מ-HSD ולחקור באופן שיטתי את התכונות הפיזיקליות, ההרכב והתפקודים שלהן. בשל המאפיינים של העלייה המשמעותית בלחץ הדם לאחר דיאטה עתירת מלח, נבחרו חולדות רגישות למלח וחשפו את השפעת HSD על חיידקי המעיים EV על ידי בניית שיטת מיצוי יעילה. השיטה התבססה על צנטריפוגה של שיפוע צפיפות ושילבה טכניקות זיהוי דינמיות שונות כגון זיהוי גודל חלקיקים, מדידת LPS/BCA, מיקרוסקופ אלקטרונים הולכה וניתוח פרוטאומי. הפרוטוקול נועד לחשוף את ההשפעות של HSD על מיקרוביוטת המעיים EV והמנגנונים שלה במחלות לב וכלי דם. עם היעילות הגבוהה, יכולת השחזור והיישום הרחב שלה, גישה זו לא רק מספקת כלי חשוב לחקר המנגנון של חיידקי המעיים EVs ביתר לחץ דם המושרה על ידי מלח, אלא גם מניחה את הבסיס התיאורטי לפיתוח אסטרטגיות התערבות במחלות המבוססות על EVs. באמצעות מחקר זה, אנו מקווים לפתוח אפיקים חדשים למניעה וטיפול במחלות לב וכלי דם, כגון יתר לחץ דם27,28.
מחקר ניסיוני זה בבעלי חיים עומד בהנחיות האתיות הרלוונטיות ובתקנים הבינלאומיים. מחקרים הכוללים בעלי חיים אושרו על ידי ועדת רווחת חיות מעבדה ואתיקה של אוניברסיטת צ'נגדו לרפואה סינית (מוסד: אוניברסיטת צ'נגדו לרפואה סינית; מספר פרוטוקול: 2018-21).
1. הכנת בעלי חיים ומשטר תזונה
2. ניטור לחץ דם
הערה: פלתיסמוגרפיה של שרוול הזנב שימשה כשיטה לא פולשנית למדידת לחץ דם, ונעשה שימוש ברישום לחץ נפחי (VPR) כאשר לחץ הדם נמדד מנפח הדם של הזנב.
3. חילוץ רכבים חשמליים
4. זיהוי רכבים חשמליים
ריכוזי EVs נקבעו בשברים שונים (איור 2A). תוצאות הניסוי הראו שריכוז ה-EVs הציג דפוס התפלגות נורמלי טיפוסי בסדרה של פתרונות שיפוע צפיפות (איור 2B). באופן ספציפי, בשבר 9, ריכוז הרכבים החשמליים הגיע לנקודה הגבוהה ביותר שלו (3.85 x 109), מה שמצביע על כך שחלק ההפצה העיקרי של רכבים חשמליים עשוי להיות 936.
לקביעת תכולת החלבון, ערכות BCA שימשו להערכת תכולת החלבון בשברים שונים (איור 2C). בשיטה זו, תכולת החלבון בשבר 9 הייתה 0.417 מיקרוגרם/מיקרוליטר, מה שמדגים עוד יותר את התפלגות ה-EVs. מכיוון ש-LPS הוא מרכיב ייחודי של חיידקים גראם-שליליים 37,38, ערכות זיהוי אנדוטוקסין שימשו גם לקביעת הביטוי של LPS (איור 2D) על מנת להעריך את התפלגות ה-EVs בשברים שונים. תוצאות הניסוי הראו כי בשברים 9 ו-10, ביטוי LPS היה גבוה משמעותית מהשברים האחרים (ספיגה עבור שבר 9 = 0.8086, עבור שבר 10 = 0.8515), והתפלגותו הראתה התפלגות נורמלית, שהוכיחה כי ה-EVs מפוזרים בעיקר בשבר 9. כמויות גדולות יחסית של חלבון בשבר 9 נצפו גם באלקטרופורזה של ג'ל SDS-PAGE של EVs שבודדו משברים שונים (איור 2E).
מחקר זה בדק רכבים חשמליים באמצעות מיקרוסקופ אלקטרונים הולכה (TEM; איור 2F). באמצעות הדמיה ברזולוציה גבוהה על ידי TEM, הוא הצליח לדמיין בבירור את המבנה המורפולוגי של EVs, הכולל מבנים דמויי ממברנה עגולים, שהוא חיוני להבנת הביולוגיה של EVs.
שינויים בלחץ הדם נקבעו בקבוצות NSD ו-HSD לאחר חודשיים של גידול ב-NSD ו-HSD של החולדות. אנו יכולים לראות ש-SBP (איור 3A), DBP (איור 3B) ו-MBP (איור 3C) גדלו באופן משמעותי בקבוצת HSD, מה שמצביע על כך שמודל יתר לחץ הדם של מחקר זה נבנה בהצלחה.
במחקר הזה, ריכוז ה-EVs זוהה בקבוצות שונות (איור 3D), והתוצאות הראו שריכוז ה-EVs בקבוצת ה-HSD היה גבוה משמעותית מזה של חולדות בקבוצת ה-NSD. זה מצביע על כך ש-HSD משפיע על רמת ה-EVs, אולי עקב שינויים בהרכב המיקרוביוטה של המעיים שממנה מקורם של ה-EVs.
לאחר מכן נמדד גודל החלקיקים של הרכבים החשמליים במחקר זה. תוצאות המדידה מצביעות על כך שגודל החלקיקים של ה-EVs הוא בעיקר בסביבות 60 ננומטר (איור 3E), וגודל החלקיקים של קבוצת HSD נמוך מעט מזה של קבוצת ה-NSD. הנתונים הנמדדים מספקים מידע חשוב להערכת התפלגות הגודל וההומוגניות של הרכבים החשמליים, מה שמקל על תכנון הניסוי ופיתוח היישומים שלאחר מכן.
לאחר מכן, במחקר זה, נבדקה כמות ביטוי ה-LPS של EVs בקבוצת HSD ובקבוצת NSD (איור 3F). התוצאות הראו כי הביטוי של LPS על ידי EVs בקבוצת HSD היה גם גבוה משמעותית מזה בקבוצת NSD. ייתכן שהסיבה לכך היא העלייה בחיידקים גראם-שליליים במיקרוביוטת המעיים שמקורה באקסובסיקל או מהריכוז הגבוה יותר של EVs בקבוצת HSD מאשר בקבוצת NSD.
כדי לתמוך עוד יותר בהבדלים בין EVs בקבוצות HSD ו-NSD, מחקר זה חקר את מיקרוביוטת המעיים הנגזרת וערך ריצוף 16S rRNA של דגימות EVs מקבוצות NSD ו-HSD כדי להבהיר עוד יותר את ההשפעה של HSD על EVs במיקרוביוטת המעיים בעכברים.
ניתוח α-Diversity הראה כי המגוון של מיקרוביוטת המעיים הצטמצם באופן משמעותי בקבוצת HSD, כאשר מדדי שאנון ו-ACE ירדו (איור 4A). β -ניתוח גיוון, המבוסס על PCoA (איור 4B), הבחין בין הפנוטיפים המיקרוביאליים בין הקבוצות ברמת ASV. התערבות המלח הגבוהה הפכה חלקית את השינויים הפנוטיפיים במיקרופלורת המעי ומצאה הבדלים משמעותיים בהרכב מיקרוביוטת המעי שמקורה בשלפוחית החיצונית בין הקבוצות (p = 0.001).
לאחר סינון חיידקים בשפע נמוך וסטנדרטיזציה של הנתונים, הערות טקסונומיות זיהו טווחים שונים של קהילות מיקרוביאליות בדגימות. מיקרוביוטת המעיים שמקורה באקסובסיקל כללה בעיקר פרוטאובקטריה (93.19%), Firmicutes (4.57%) ובקטרואידוטה (1.19%; איור 4C). קבוצת HSD הגדילה משמעותית את שפע השלפוחיות החיצוניות של Firmicutes (איור 4D). ברמת הסוג, התוצאות הראו שסוגים כמו Nevskia ו-Acinetobacter היו נפוצים יותר בקבוצת NSD, בעוד ש-Delftia, Burkholderia_Ca ו-Clostridium_sen היו נפוצים יותר בקבוצת HSD (איור 4E). נוסף על כך, המחקר הזה גם השתמש במפות חום כדי להראות את ההבדלים במיקרוביוטה של המעיים בין קבוצת HSD לקבוצת NSD (איור 4F). לאחר ההתערבות העשירה במלח, השפע של חלק מהחיידקים, Delftia ו-Burkholderia_Ca, גדל באופן משמעותי, ו-Nevskia ו-Acinetobacter פחתו באופן משמעותי (איור 4G). לסיכום, ההתערבות הגבוהה במלח שינתה באופן משמעותי את ההבדל בייצור EVs שמקורם במיקרופלורה במעי, בעיקר מכיוון שהיא שינתה את התפלגות החיידקים ההורים שלהם, והמאפיינים העיקריים היו ירידה במגוון, שינויים במבנה שיווי המשקל ושינויים בשפע החיידקים השונים.
איור 1: מיצוי ואפיון של שלפוחיות חיצוניות שמקורן בחיידקי מעיים. (A) תרשים זרימה של מיצוי שלפוחית חיצונית. (ב) אפיון השלפוחיות החיצוניות. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: אפיון בסיסי של ה-EVs וניתוח שיפוע הצפיפות המקומית. (A) מדידות ריכוז חוץ-שלפוחית וגודל חלקיקים עם שיפועי צפיפות שונים (nm; חלקיקים/מ"ל). (B) השוואה של ריכוזי השלפוחית החיצונית של התמיסה לפי שיפוע צפיפות 3 - 16 (חלקיקים/מ"ל). (C) קביעת תכולת חלבון התמיסה בשיפוע צפיפות 6-12 על ידי ערכת BCA (מיקרוגרם/מ"ל). (D) מדידת ביטוי LPS תמיסה על ידי שיפוע צפיפות 7-11 עם ערכת זיהוי אנדוטוקסין (Abs). (E) תמיסות עם שיפוע צפיפות של 6 - 12 עברו אלקטרופורזה של ג'ל SDS-PAGE ונצבעו בכחול מבריק של Coomassie. (F) TEM: סרגל קנה המידה הוא 100 ננומטר; שלפוחיות בודדות מוצגות בתמונה. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: ניתוח השינויים בלחץ הדם וב-EVs תחת דיאטות שונות. (א) SBP; (ב) DBP; (ג) MBP; (ד) השוואה של ריכוזי שלפוחית חיצונית בקבוצות HSD ו-NSD; (E) השוואה של גודל השלפוחית החיצונית בקבוצות HSD ו-NSD. (F) LPS בדגימות NSD ו-HSD שנקבעו על ידי ספקטרופוטומטריה. *p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001, ו-NS פירושו אין מובהקות, מבחן t. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: ניתוח מבחן ה-rRNA של 16 שניות תחת הדיאטות השונות. (A) ניתוח α-diversity; (ב) ניתוח קואורדינטות עיקריות; (C) שפע המיקרוביוטה של המעיים ברמת הפילה; (D) שינויים בחיידקים ברמת פילום; (ה) תוצאת LEfSe; (F) ניתוח מפת החום של האשכול המבוסס על סוגי חיידקים דיפרנציאליים; (G) שינויים בחיידקים ברמת הסוג. *p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001, ו-NS פירושו אין מובהקות, מבחן t. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
במחקר זה, התמקדנו במיקרוביוטת המעיים EVs בחולדות רגישות למלח ב-HSD והשגנו סדרה של הישגים מרכזיים. ראשית, שיטת מיצוי יעילה המבוססת על צנטריפוגה של שיפוע צפיפות נבנתה בהצלחה כדי לבודד EVs ממיקרוביוטת מעיים של חולדות רגישה למלח ב-HSD, ורוב הרכיבים שאינם EV בודדו באמצעות מניפולציה ניסויית קפדנית וסטנדרטית של בעלי חיים ותהליך עיבוד דגימות. שיטת מיצוי הרכבים החשמליים של צנטריפוגת שיפוע צפיפות יעילה ביותר וניתנת לשחזור, טובה יותר משיטת האולטרה-צנטריפוגה הקונבנציונלית, ויכולה לשמור טוב יותר על השלמות והפונקציונליות של רכבים חשמליים, מה שמבטיח את איכות הדגימה והיתכנות המחקר.
שנית, רכבים חשמליים זוהו באופן מקיף באמצעות טכנולוגיות דינמיות שונות: גודל חלקיקים וזיהוי ריכוז מצביעים על כך שלרכבים חשמליים יש התפלגות גודל ספציפית; מדידות LPS ו-BCA מכמתות את תכולת החלבון וביטוי ה-LPS של EVs; TEM מראה בבירור את המבנה המורפולוגי של EVs; ומאפייני החלבון מגדירים את ספקטרום החלבונים. תוצאות זיהוי אלה חושפות באופן מקיף את התכונות הפיזיקליות והביוכימיות של רכבים חשמליים, ומספקות תמיכה אמינה בנתונים למחקרים הבאים.
בנוסף, טכנולוגיית ריצוף גנים 16S rRNA המשתמשת בניתוח מעמיק של ההבדלים בין המקור וההרכב של EVs נורמליים ו-HSD, וניתוח גיוון α וניתוח מגוון β הראו כי צריכת מלח גבוהה משפיעה באופן משמעותי על המאפיינים הגנטיים של EVs מיקרוביאליים במעיים, כולל מבנה הקהילה המיקרוביאלית, עושר המינים והמגוון, כדי לפתור באופן מקיף יותר את ההשפעות של תזונה עתירת מלח על חיידקי המעיים. מספק רמות מרובות של ראיות למחקרים מכניסטיים.
למרות שלשיטה זו יש כמה יתרונות על פני שיטת הצנטריפוגה הקונבנציונלית במהירות יתר מבחינת התאוששות ושלמות אקסוזומים, עדיין ישנן כמה מגבלות, כגון ביקוש גבוה לדגימה וקושי להבחין בין המארח למקור המיקרופלורה. עם זאת, בהשוואה לשיטות הקיימות, לצנטריפוגה בשיפוע צפיפות יש יתרונות ייחודיים בשמירה על השלמות התפקודית של אקסוזומים, מה שמספק תמיכה טכנית אמינה לחקירה נוספת של המנגנון שבאמצעותו דיאטה עתירת מלח משפיעה על לחץ הדם של המארח דרך פלורת המעיים. יתר על כן, עבור ריבוד השיפוע הלא ברור שנתקלנו בו במהלך הניסוי, שיפרנו גם על ידי הארכת זמן הצנטריפוגה או החלפת הרוטור בעל הביצועים הגבוהים יותר.
בעתיד, נוכל להמשיך ולחקור את המנגנון של חיידקי המעיים EVs ביתר לחץ דם הנגרם על ידי תזונה עתירת מלח, במיוחד האינטראקציה שלו עם מערכת החיסון, כגון תאי T פרו-דלקתיים39,40; או להשתמש במוצרים שמקורם בצמחים כדי להתערב במיקרוביוטה של המעיים41,42, להתערב עוד יותר במחלות ולחקור את תפקידם בוויסות חילוף החומרים של המארח והתגובה החיסונית.
לסיכום, מחקר זה לא רק מספק כלי חשוב לחקר המנגנון של יתר לחץ דם המושרה על ידי מלח של מיקרוביוטת המעיים, באמצעות מודל החולדות הרגישות למלח, מעמיק את ההבנה של הקשר בין HSD, מיקרוביוטת מעיים ו-EVs, וגם פותח דרך חדשה למניעה וטיפול במחלות לב וכלי דם כגון יתר לחץ דם, מספק נקודת מבט ייחודית לחקר האינטראקציה בין דיאטה-חיידק-מארח.
המחברים מצהירים כי לא ידוע על אינטרסים פיננסיים מתחרים או קשרים אישיים שיכולים היו להשפיע על העבודה המדווחת במאמר זה.
עבודה זו נתמכה על ידי הקרן הלאומית למדעי הטבע של סין (82205240), הקרן למדעי הטבע של מחוז סצ'ואן (2025ZNSFSC1836), והפרויקט הבסיסי הקליני של בית החולים האורתופדי המחוזי של סצ'ואן (PY202414).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Essential Supplies | |||
Centrifugal Filter (10nkDa 2 mL) | Millipore | UFC903096 | |
Centrifuge Tude(50 mL) | BKMAN | 20220404 | |
Centrifuge Tudes | BECKMAN COULTER | Z30815SCA | |
Vacuum Filtration System | Biosharp | 24902581 | |
Reagents | |||
Chromogenic LAL Endotoxin Assay Kit | Beyotime | 022124240705 | |
Coomassie Blue Fast Staining Solution | Beyotime | Z972241010 | |
EDTA | Damas-beta | P3117308 | |
Enhanced BCA Protein Assay Kit | Beyotime | A006241112 | |
Ethanol | KESH | ||
HCl | |||
OptiPrep (60% wt/vol, iodixanol) | Serumwerk | 00124 | |
PBS | Labshark | 130114005 | |
phosphotungstic acid | RUIXIN | ||
Sucrose | Damas-beta | P1917057 | |
Tris (VWR) | Damas-beta | P3061764 | |
Trypan blue staining solution (0.4%) | Beyotime | BD07242904 | |
Equipment | |||
Absorbance Microplate Reader | SpectraMax | ABP01690 | |
Biomicroscope | Motic | BA210Digital | |
Desk centrifuge | Cence | CHT210R | |
Desktop high-speed micro centrifuge | DLAB | D3024 | |
Fixed Angle Aluminum Rotor + 500 mL Centrifugal Cup | Cence | ||
High precision electronic balance | SKR | BN-200 | |
Laminar flow cabinet | Nantong Hunan Scientific Instrument Co., Ltd. | SW-CJ-2FDS | |
SW 32.1 Ti Swing bucket turn+ SW 32.1 Ti Rotor bucket | BECKMAN COULTER | ||
Transmission electron microscope | JEOL | JEM-1400FLASH | |
Tube rotator | |||
Ultracentrifuge | BECKMAN COULTER | Optima XE-100 | |
Ultra-pure water system | ULPHW | UPR-II-15TNZ | |
Water-Cieculation Multifunction Vacuum Pump | Qiang Qiang | SHZ-D(III) |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved