Method Article
L’identification du type de cellule responsable de la sécrétion de cytokines est nécessaire pour comprendre la pathobiologie de la maladie rénale. Ici, nous décrivons une méthode pour colorer quantitativement le tissu rénal pour les cytokines produites par les cellules épithéliales ou interstitielles rénales à l’aide de la bréfeldine A, un inhibiteur de sécrétion, et de marqueurs spécifiques au type de cellule.
L’insuffisance rénale chronique (IRC) est l’une des dix principales causes de décès aux États-Unis. L’insuffisance rénale aiguë (IRA), bien que souvent guérissable, prédispose les patients à l’IRC plus tard dans la vie. Les cellules épithéliales rénales ont été identifiées comme des nœuds de signalisation clés dans l’IRA et l’IRC, par lesquels les cellules peuvent déterminer l’évolution de la maladie grâce à la sécrétion de cytokines et d’autres protéines. Dans l’IRC en particulier, plusieurs éléments de preuve ont démontré que les cellules tubulaires mal réparées entraînent la progression de la maladie par la sécrétion du facteur de croissance transformant bêta (TGF-β), du facteur de croissance du tissu conjonctif (CTGF) et d’autres cytokines profibrotiques. Cependant, l’identification de la source et du nombre relatif de protéines sécrétées par différents types de cellules in vivo reste difficile.
Cet article décrit une technique utilisant la brefeldine A (BFA) pour empêcher la sécrétion de cytokines, permettant la coloration des cytokines dans le tissu rénal à l’aide de techniques d’immunofluorescence standard. Le BFA inhibe le transport du réticulum endoplasmique (RE) vers l’appareil de Golgi, qui est nécessaire à la sécrétion de cytokines et d’autres protéines. L’injection de BFA 6 h avant le sacrifice entraîne une accumulation de TGF-β, de PDGF et de CTGF à l’intérieur des cellules des tubules proximaux (PTC) dans un modèle murin de cisplatine de l’IRA et du TGF-β dans un modèle murin d’acide aristolochique (AA) de l’IRC. L’analyse a révélé que BFA + cisplatine ou BFA + AA augmentait significativement le signal positif TGF-β par rapport à BFA + solution saline, cisplatine ou AA seul. Ces données suggèrent que la BFA peut être utilisée pour identifier le type de cellule produisant des cytokines spécifiques et quantifier les quantités relatives et/ou les différents types de cytokines produites.
On estime que >10 % de la population mondiale souffre d’une forme de maladie rénale1. Définie par son apparition rapide, l’IRA est en grande partie curable ; cependant, un épisode d’IRA peut prédisposer les patients à développer une MRC plus tard dans la vie 2,3. Contrairement à l’IRA, l’IRC est caractérisée par une fibrose progressive et une aggravation de la fonction rénale, conduisant à une insuffisance rénale terminale nécessitant un traitement de remplacement rénal. La plupart des lésions rénales ciblent les cellules épithéliales spécialisées, telles que les podocytes ou les cellules tubulaires proximales, qui composent le néphron 4,5. Après une blessure, les cellules épithéliales survivantes aident à coordonner la réponse de réparation par la sécrétion de cytokines et d’autres protéines. De cette façon, les cellules survivantes peuvent moduler la réponse immunitaire, diriger le remodelage de la matrice extracellulaire et aider à la récupération des organes.
Les cytokines sont de petites protéines sécrétées essentielles à la modulation de la maturation, de la croissance et de la réactivité des organismes multicellulaires 6,7. Ils fonctionnent comme des messagers de signaux entre divers types de cellules, y compris les cellules immunitaires et épithéliales8. Bien que l’on pense que les cytokines sont sécrétées principalement par les cellules immunitaires, des recherches de longue date ont démontré que les cellules épithéliales et interstitielles rénales sécrètent également des cytokines comme signaux pour d’autres cellules rénales résidentes, telles que les cellules tubulaires, les cellules interstitielles et les cellules immunitaires 9,10. Les PTC, en particulier, jouent un rôle important dans la phase d’initiation et de récupération après l’IRA11. Cependant, les PTC mal réparés sont connus pour sécréter des cytokines profibrotiques telles que le facteur de croissance transformant-β (TGF-β), le facteur de croissance dérivé des plaquettes-D (PDGF-D) et le facteur de croissance du tissu conjonctif (CTGF), contribuant à la progression de l’IRC12. Ainsi, les cellules épithéliales rénales utilisent des cytokines sécrétées pour moduler les lésions rénales.
Bien que l’on sache que les cellules épithéliales rénales sécrètent des cytokines, la source exacte et la contribution relative de chaque type de cellule ont été difficiles à déterminer en raison des défis techniques liés à l’étude des protéines sécrétées13. La cytométrie en flux, une approche couramment utilisée pour mesurer les cytokines, est difficile à réaliser sur les reins lésés, en particulier chez les reins très fibreux. Avec la recombinase Cre pilotée par un promoteur de cytokines, les souris rapporteures de cytokines sont souvent utilisées pour identifier le type de cellule qui exprime une cytokine donnée. Cependant, l’utilisation de souris rapporteures est limitée en raison de la nécessité de croiser des souris rapporteures dans divers contextes de knock-out, du manque de rapporteurs appropriés et du fait qu’une seule cytokine peut être analysée à la fois. Ainsi, il est nécessaire de développer une technique simple, polyvalente et abordable pour détecter les cellules rénales libérant des cytokines.
Nous avons émis l’hypothèse que l’injection de BFA, un inhibiteur de sécrétion qui bloque le transport du réticulum endoplasmique-Golgi in vivo, permettrait la coloration des protéines sécrétées dans le tissu rénal (Figure 1A,B), comme le montrent les tests basés sur la cytométrie en flux14,15. Avec des fabricants spécifiques de type de cellule, cette technique pourrait être utilisée pour identifier la source et la contribution relative des cellules productrices de cytokines dans les reins lésés. Contrairement aux échantillons de cytométrie en flux, les tissus fixes peuvent être conservés à long terme avec la préservation des protéines et des structures cellulaires, ce qui permet une étude plus approfondie des cellules sécrétoires. Pour tester cette hypothèse, des reins de souris ont été blessés avec un modèle d’IRA (cisplatine) et un modèle de CKD (néphropathie acide aristolochique (NAA)), injectés avec BFA et colorés à l’aide de techniques immunofluorescentes standard.
Toutes les expériences sur les animaux ont été réalisées conformément au protocole d’utilisation des animaux approuvé par le comité institutionnel de soins et d’utilisation des animaux du centre médical de l’Université Vanderbilt.
1. Animaux
2. Injection de cisplatine
3. Injection d’acide aristolochique (AA)
4. Préparation de la solution BFA
5. Injection de BFA dans la veine caudale
6. Sacrifice et récolte des reins
7. Perfusion et ablation des reins
8. Tissu inclus en paraffine pour la coloration TGF-β et PDGF-D
9. Déparaffinisation et réhydratation
10. Préparation de tissus congelés pour la coloration CTGF
11. Section congelée
12. Coloration par immunofluorescence
13. Acquisition d’images
14. Analyse d’images
15. Alternative : Analyse d’images avec un logiciel libre (ImageJ)
16. En option : Imagerie avec microscope confocal à balayage laser
REMARQUE : Pour obtenir des images à plus haute résolution pour la publication, la microscopie confocale à balayage fournit des images plus claires et un bruit de fond réduit dans le tissu rénal.
17. Taux plasmatique d’azote urétique
Pour examiner le rôle des cellules épithéliales tubulaires dans la production de cytokines après l’IRA induite par le cisplatine, le cisplatine a été injecté à une concentration de 20 mg/kg suivi d’une injection intraveineuse de 0,25 mg de BFA le jour 3 après l’injection de cisplatine. Les reins ont été prélevés 6 h plus tard. Des reins inclus dans de la paraffine ont été sectionnés et colorés avec du TGF-β, du PDGF-D et du CTGF, des cytokines représentatives responsables de la réparation tissulaire de l’IRA. Comme le montre la figure 2A, des vésicules TGF-β+ sont observées dans les PTC marqués avec LTL dans les reins traités au cisplatine en présence de BFA. Pendant ce temps, les vésicules TGF-β+ n’ont pas été observées dans les reins non blessés ou non traités par BFA.
La quantification a révélé une augmentation de la zone TGF-β1+ avec le traitement BFA dans l’IRA induite par le cisplatine (Figure 2B). À l’instar du TGF-β, les vésicules PDGF-D+ ou CTGF+ se sont également accumulées avec le traitement BFA dans l’IRA induite par le cisplatine (Figure 2C et Figure 2E). La quantification a démontré que les surfaces PDGF-D+ et CTGF+ étaient significativement augmentées avec la BFA dans les PTC LTL+ (Figure 2D et Figure 2F). Pour étudier l’effet du traitement par BFA sur la fonction rénale, les taux plasmatiques d’BUN ont été mesurés le jour 3 après l’injection de cisplatine. Comme le montre la figure 2G, l’injection de BFA n’a pas augmenté de manière significative les taux plasmatiques d’urée.
Ensuite, pour déterminer quelles cytokines sont sécrétées par les cellules interstitielles dans l’IRA induite par le cisplatine, les reins ont été colorés pour le TGF-β ou le CTGF, et les myofibroblastes interstitiels ont été marqués par le α-SMA. Comme le montre la figure 3A, des vésicules TGF-β+ ont été observées dans des cellules interstitielles marquées au α-SMA dans le cisplatine-IRA avec traitement BFA (Figure 3A). Pour quantifier le signal à l’intérieur des cellules α-SMA+ , la zone α-SMA+ a été décrite et les signaux positifs des cytokines et des α-SMA ont été quantifiés à l’intérieur de la zone. La quantification a révélé que la zone TGF-β+ dans la zone α-SMA+ était significativement augmentée avec le traitement par BFA dans l’IRA au cisplatine (Figure 3B). Les vésicules CTGF+ ont également augmenté avec le traitement BFA (Figure 3C), et la quantification a démontré que le traitement BFA augmentait le rapport entre la surface CTGF+ et la zone α-SMA+ dans l’IRA induite par le cisplatine (Figure 3D).
Pour déterminer si le traitement BFA peut être utilisé dans des modèles d’insuffisance rénale chronique, l’insuffisance rénale a été induite par trois doses d’AA, ce qui induit une IRA qui se transforme en une lésion chronique avec fibrose rénale mature et est cliniquement pertinente pour l’IRC humaine. Le BFA a été injecté le 42e jour après l’injection d’AA, et les reins ont été prélevés 6 h plus tard. Par rapport aux lésions induites par le cisplatine, les vésicules TGF-β+ dans les PTC étaient beaucoup plus petites dans la phase chronique de l’AA. Il y avait une coloration positive minime dans les PTC LTL+ ; cependant, l’intensité du signal du TGF-β dans les PTC positives pour les lésions rénales (KIM-1+) a été augmentée avec le traitement BFA (Figure 3E). Le niveau d’intensité moyen du TGF-β était 3 fois plus élevé avec l’injection de BFA qu’en l’absence de BFA (Figure 3F). Cette découverte indique que l’injection in vivo de BFA peut être utilisée pour la coloration par immunofluorescence et en combinaison avec d’autres marqueurs pour évaluer la production de cytokines d’une manière spécifique au type de cellule.
Figure 1 : Représentation schématique du mode d’action BFA. (A) BFA bloque le transport ER-Golgi des vésicules contenant des protéines à sécréter, telles que le TGF-β. (B) BFA induit une accumulation de cytokines intracellulaires, telles que le TGF-β, dans les cellules épithéliales tubulaires rénales. (C) Coupe transversale schématique d’une queue de souris. Les veines latérales sont les plus accessibles pour l’injection. Abréviations : BFA = brefeldin A ; RE = réticulum endoplasmique ; TGF-β = facteur de croissance transformant-bêta ; BFA- = BFA-négatif ; BFA+ = BFA-positif. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 2 : L’immunofluorescence avec injection de BFA détecte les vésicules riches en cytokines dans les cellules épithéliales tubulaires après une lésion rénale aiguë induite par le cisplatine. (A) Images représentatives des vésicules TGF-β+ au jour 3 après administration de cisplatine (20 mg/kg) ou de solution saline. Barre d’échelle = 20 μm. Les flèches indiquent les vésicules TGF-β+ dans les CTP. (B) Quantification des vésicules/tubules TGF-β+ dans les salines (n = 5), salines + BFA (n = 5), Cis (n = 5), Cis + BFA (n = 5). (C) Images représentatives des vésicules PDGF-D au jour 3 après l’administration de cisplatine (20 mg/kg) ou d’une solution saline. Barre d’échelle = 20 μm. (D) Quantification des vésicules/tubules PDGF-D+ dans une solution saline (n = 4), saline + BFA (n = 4), Cis (n = 4), Cis + BFA (n = 4). (E) Images représentatives des vésicules CTGF+ au jour 3 après administration de cisplatine (20 mg/kg) ou de solution saline. Barre d’échelle = 20 μm. (F) Quantification des vésicules/tubules CTGF+ dans une solution saline (n = 4), saline + BFA (n = 4), Cis (n = 4), Cis + BFA (n = 4). (G) Taux plasmatique d’azote uréique le jour 3 après l’administration de cisplatine (20 mg/kg) : cisplatine (Cis) (n = 7) et cisplatine + BFA (Cis + BFA) (n = 3). Les données sont présentées sous forme de moyennes ± écart-type. * p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0,001, ****p < 0,0001. Les régions délimitées par des cases blanches en pointillés sont affichées dans le panneau inséré à fort grossissement. Abréviations : BFA = brefeldin A ; TGF-β = facteur de croissance transformant-bêta ; Cis = cisplatine ; PDGF-D = facteur de croissance dérivé des plaquettes-D ; CTGF = facteur de croissance du tissu conjonctif ; BUN = azote uréique du sang ; LTL = lectine de lotus tetragonolobus ; DAPI = 4',6-diamidino-2-phénylindole ; HM = Grossissement élevé. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 3 : Vésicules riches en cytokines observées dans les myofibroblastes après une lésion rénale aiguë induite par le cisplatine et les cellules épithéliales tubulaires dans la phase chronique de la néphropathie acide aristolochique. (A) Images représentatives des vésicules TGF-β+ au jour 3 après administration de cisplatine (20 mg/kg) ou de solution saline. Barre d’échelle = 20 μm. Les flèches indiquent les vésicules TGF-β+ dans les cellules interstitielles a-SMA+. (B) Quantification de la surface TGF-β+/α-SMA+ dans une solution saline (n = 4), une solution saline + BFA (n = 4), Cis (n = 4), Cis + BFA (n = 4). (C) Images représentatives des vésicules CTGF+ au jour 3 après administration de cisplatine (20 mg/kg) ou de solution saline. Barre d’échelle = 20 μm. Les flèches indiquent les vésicules CTGF+ dans les cellules interstitielles a-SMA+. (D) Quantification de l’aire CTGF+/α-SMA+ dans une solution saline (n = 4), saline + BFA (n = 4), Cis (n = 4), Cis + BFA (n = 4). (E) Images représentatives d’un rein (rouge) coloré au TGF-β dans la néphropathie acide aristolochique chronique. Barre d’échelle = 20 μm. (F) Quantification de l’intensité du signal TGF-β+ / PTC KIM-1+ en AAN (n = 6) et AAN + BFA (n = 6). Données présentées en moyens ± écart-type. * p < 0,05, ***p < 0,001, ****p < 0,0001. Les régions délimitées par des cases blanches en pointillés sont affichées dans le panneau inséré à fort grossissement. Abréviations : BFA = brefeldin A ; TGF-β = facteur de croissance transformant-bêta ; α-SMA = actine musculaire alpha-lisse ; Cis = cisplatine ; CTGF = facteur de croissance du tissu conjonctif ; KIM-1 = molécule de lésion rénale-1 ; LTL = lectine de lotus tetragonolobus ; AAN = néphropathie acide aristolochique ; DAPI = 4',6-diamidino-2-phénylindole ; HM = fort grossissement. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les PTC rénaux sont connus pour réguler l’IRA et l’IRC par la sécrétion de TGF-β, TNF-α, CTGF, PDGF, facteur de croissance de l’endothélium vasculaire, ainsi que de nombreuses autres protéines 20,21,22,23. De même, les glomérules, les tubules distaux et d’autres cellules épithéliales rénales, ainsi que les cellules interstitielles, sécrètent ces protéines et/ou d’autres protéines lors d’une lésion 24,25,26. La contribution relative de chacun de ces types de cellules dans la sécrétion de cytokines est difficile à élucider car les cytokines sont sécrétées peu de temps après leur production. Bien que l’hybridation in situ et d’autres techniques de coloration de l’ARN puissent être utilisées pour colorer l’ARN des protéines sécrétées, il est difficile de combiner ces techniques avec la coloration pour des marqueurs spécifiques au type de cellule ou des marqueurs de blessures. Alternativement, de nombreuses études combinent des résultats in vivo avec des expériences in vitro réalisées sur des cellules rénales en culture. Dans ce cas, les données sur les lésions rénales sont associées aux données sur la sécrétion de cytokines à partir de cellules cultivées pour tirer des conclusions, ce qui a une translatibilité limitée à la situation in vivo.
L’avènement du séquençage de nouvelle génération et du RNAseq unicellulaire a permis la classification des types cellulaires par expression génique et l’identification d’autres gènes exprimés par chaque type de cellule27. Bien que cela fournisse des détails exquis sur une base de population, il omet souvent une grande partie des données anatomiques et pathologiques qui peuvent être glanées à partir de coupes de reins. De plus, le séquençage unicellulaire n’identifie souvent que les 3 000 à 7 000 premiers gènes exprimés dans chaque cellule, ce qui peut ne pas fournir suffisamment de profondeur pour cribler toutes les cytokines d’intérêt28. Cet article propose une alternative à ces approches. En utilisant la BFA pour bloquer la sécrétion de protéines, le tissu rénal peut être directement coloré pour les cytokines et d’autres protéines d’intérêt, y compris les marqueurs de type cellulaire à l’aide de techniques d’immunofluorescence standard.
Le TGF-β, le PDGF-D et le CTGF sont parmi les cytokines les plus étudiées dans les lésions rénales. Tous les trois sont connus pour agir comme des épées à double tranchant, favorisant la récupération après l’IRA tout en contribuant à la progression de la fibrose dans l’IRC29,30. Bien que l’on sache que les cellules épithéliales des tubules rénaux et les cellules interstitielles peuvent potentiellement sécréter du TGF-β, du PDGF-D et du CTGF dans les lésions rénales, l’identification directe du type de cellule et de la production relative reste difficile. Dans la présente étude, nous avons choisi de colorer le TGF-β, le PDGF-D et le CTGF dans les reins pendant l’IRA induite par le cisplatine, et le TGF-β dans le modèle AAN CKD, ainsi que le marqueur PTC LTL, le marqueur de lésion PTC KIM-1 ou le marqueur myofibroblastique α-SMA. Cela permettra de déterminer si les PTC ou les myofibroblastes produisent ces cytokines et les niveaux d’expression relatifs entre les groupes expérimentaux.
Chez les souris traitées avec BFA seul, il y avait peu ou pas de coloration positive de l’une ou l’autre cytokine. De même, le traitement au cisplatine n’a induit qu’une augmentation marginale de la coloration des cytokines. La combinaison d’une lésion au cisplatine et d’un traitement par BFA pendant 6 heures a entraîné une augmentation spectaculaire des signaux positifs intracellulaires des trois cytokines, indiquant que ces cytokines sont normalement sécrétées. De même, seul le groupe cisplatine + BFA a montré une augmentation significative du signal TGF-β et CTGF dans les cellules interstitielles α-SMA+. Dans le modèle AAN chronique, dans lequel le TGF-β est associé à une réponse pathologique, l’injection d’AA seule a induit une coloration du TGF-β, en particulier chez les PTC KIM-1+ lésés. Le traitement BFA a augmenté le signal intracellulaire positif dans les PTC KIM-1+ (les PTC sont les seules cellules de tubule rénal connues pour exprimer KIM-131). Il est intéressant de noter que les PTC LTL+ KIM-1+ ou LTL+ KIM-1- n’ont pas montré de coloration significative au TGF-β, tandis que les PTC LTL-KIM-1+ avaient une positivité au TGF-β plus élevée. La perte de coloration LTL suggère que les PTC exprimant des niveaux plus élevés de TGF-β sont à la fois endommagés et dédifférenciés dans la phase chronique de la lésion. Ce phénotype est probablement la réparation inadaptée décrite précédemment 32,33. Ainsi, le traitement BFA démontre que le TGF-β est exprimé dans les PTC après l’IRA et pendant l’IRC.
Bien que l’étude actuelle se concentre sur la coloration immunofluorescente, il est important de noter que le traitement BFA peut être combiné avec d’autres tests. Par exemple, si l’expérience ne nécessite pas d’identifier le type de cellule sécrétant la protéine d’intérêt, on pourrait injecter du BFA et effectuer un immunoblot ou un ELISA sur des lysats de rein entier dans des groupes témoins par rapport à des groupes expérimentaux. Un autre test qui pourrait être envisagé est la cytométrie en flux. Le traitement BFA a été combiné à la cytométrie en flux dans des études immunologiques pour déterminer la production relative de cytokines dans différents types de cellules15. Bien qu’il puisse être difficile de séparer les cellules épithéliales rénales du tissu rénal en cellules uniques, la cytométrie en flux peut être une alternative dans les laboratoires qui ont établi la technique. De plus, le traitement BFA peut être utilisé pour des études de culture cellulaire in vitro dans tous les tests énumérés ci-dessus.
L’étude actuelle décrit deux des méthodes de préparation des tissus les plus courantes, les tissus fixés inclus dans la paraffine et les tissus congelés, qui fonctionnent bien pour les anticorps utilisés dans l’étude. Cependant, étant donné la nature variable des anticorps, il est probable que les chercheurs adoptant cette technique devront normaliser davantage les protocoles de coloration ou le traitement des tissus, en fonction de l’anticorps. Comme les cytokines sont normalement sécrétées, peu d’anticorps anti-cytokines sont testés pour la coloration dans les tissus. Pour accélérer la standardisation du protocole, nous recommandons de générer des contrôles positifs dans lesquels les organes connus pour sécréter les cytokines d’intérêt sont prélevés après le traitement BFA. Par exemple, les rates d’animaux traités par des lipopolysaccharides et des BFA pourraient servir de tissu de contrôle positif pour de nombreuses cytokines différentes. Le prélèvement de la rate et son traitement sous forme de tissu enrobé de paraffine ou congelé permettraient une normalisation plus rapide de la concentration d’anticorps et des tampons. De plus, si les anticorps anti-cytokines ont été caractérisés pour colorer les cytokines dans leur conformation native in vitro, ces anticorps sont plus susceptibles de reconnaître leur cible dans le tissu congelé moins traité.
Bien que le traitement BFA puisse être un outil puissant pour mesurer les protéines sécrétées, il n’est pas sans limites. La limitation la plus apparente est que la protéine sécrétée analysée doit suivre la voie de sécrétion ER-Golgi ; sinon, la BFA peut avoir un effet limité. Une autre limitation est que les animaux traités avec BFA peuvent avoir des résultats modifiés dans d’autres tests expérimentaux. Par exemple, certains biomarqueurs de lésions rénales, tels que KIM-1, reposent sur le transport ER-Golgi pour être présentés à la surface de la cellule. Ainsi, les niveaux de KIM-1 dans l’urine seront probablement réduits chez les animaux traités à l’ABF. De plus, on craint que l’AMF n’entraîne une augmentation du stress cellulaire. Bien que cette préoccupation puisse être atténuée en réduisant la durée du traitement par BFA, elle devrait être prise en considération. Aucune augmentation significative de l’urne n’a été observée dans cette étude ; Cependant, il y a eu une augmentation de ~10 %. Ainsi, il faut faire attention lors du choix d’autres cibles ou marqueurs à analyser chez les animaux traités par BFA.
Cette étude démontre que la BFA peut être utilisée pour bloquer la sécrétion de protéines, conduisant à l’accumulation intracellulaire de cytokines, qui peuvent être colorées par des techniques d’immunofluorescence standard. Cela permet d’identifier les types de cellules sécrétant des cytokines spécifiques ou d’autres protéines, et de quantifier la production de cytokines par ces cellules. L’autre avantage de ce protocole est que les données histologiques et pathologiques peuvent être conservées et analysées dans les mêmes coupes en série ou dans des coupes en série voisines. Ainsi, le traitement BFA offre une approche rentable et relativement simple pour étudier la production de cytokines dans le tissu rénal.
Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.
Association américaine du cœur (AHA) : Kensei Taguchi, 20POST35200221 ; Le HHS | NIH | Institut national du diabète et des maladies digestives et rénales (NIDDK) : Craig Brooks, DK114809-01 DK121101-01.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 mL Insulin syringes | BD | 329654 | |
10 mL Syringe | BD | 302995 | |
2 mL tube | Fisher brand | 05-408-138 | |
20 mL Syringe | BD | 302830 | |
25 G needles | BD | 305125 | |
28 G needles | BD | 329424 | |
96-well-plate | Corning | 9017 | |
Aristolochic acid-I | Sigma-Aldrich | A9461 | |
α-SMA antibody conjugated with Cy3 | Sigma-Aldrich | C6198 | RRID:AB_476856 |
Blade for cryostat | C.L. Sturkey. Inc | DT315R50 | |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A7906 | |
Brefeldin A | Sigma-Aldrich | B6542 | |
Cisplatin | Sigma-Aldrich | P4394 | |
Citric acid | Sigma-Aldrich | 791725 | |
Confocal microscope | ZEISS | LSM710 | |
Confocal microscopy objectives | ZEISS | 40x / 1.10 LD C-Apochromat WATER | |
Confocal software | ZEISS | ZEN | |
Coplin jar | Fisher Scientific | 19-4 | |
Cover glass | Fisher brand | 12545F | |
Cryostat | Leica | CM1850 | |
CTGF antibody | Genetex | GTX124232 | RRID:AB_11169640 |
Cy3-AffiniPure Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson immunoresearch | 711-165-152 | RRID: AB_2307443 |
Cy5-AffiniPure Donkey Anti-Goat IgG (H+L) | Jackson immunoresearch | 705-175-147 | RRID: AB_2340415 |
DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D8418 | |
Disposable base molds | Fisher brand | 22-363-553 | |
donkey serum | Jackson immunoresearch | 017-000-121 | |
Ethanol | Decon Labs, Inc. | 2701 | |
Forceps | VETUS | ESD-13 | |
Glycine | Fisher brand | 12007-0050 | |
Heating pads | Kent scientific | DCT-20 | |
Heparin sodium salt | ACROS organics | 41121-0010 | 100mg/15ml of dH2O |
Humidified chamber | Invitrogen | 44040410 | A plastic box covered in foil can be used as an alternative humidified chamber. |
Insulin syringes | BD | 329461 | |
Inverted microscope | NIKON | Eclipse Ti-E2 | immunofluorescence |
KIM-1 antibody | R & D | AF1817 | RRID: AB_2116446 |
Lemozole (Histo-clear) | National diagnostics | HS-200 | |
lotus tetragonolobus lectin | Vector | FL-13212 | |
Microscope slide | Fisher scientific | 12-550-343 | |
Microtome | Reichert | Jung 820 II | |
monochrome CMOS camera | NIKON | DS-Qi-2 | |
Mouse surgical kit | Kent scientific | INSMOUSEKIT | |
NIS Elements | NIKON | ||
Objectives | NIKON | Plan Apo 20x/0.75 | image acquisition software linked to Eclipse Ti-E2 (invertd microscope) |
OCT compound | Scigen | 4586 | |
Pap pen | Vector | H-4000 | |
PBS with calcium and magnesium | Corning | 21-030-CV | |
PBS without calcium and magnesium | Corning | 21-031-CV | |
PDGF-D antibody | Thermo-Fisher scientific | 40-2100 | |
PFA | Electron Microscopy Science | 15710 | RRID: AB_2533455 |
Plate reader | Promega | GloMax® Discover Microplate Reader | 4% PFA is diluted from 16% in PBS. |
povidone-iodine (Betadine) | Avrio Health L.P. | NDC 67618-151-17 | |
Pressure cooker | Tristar 8 | Qt. Power Cooker Plus | |
ProLong Gold Antifade Reagent | Invitrogen | P36930 | |
Quantichrom Urea (BUN) assay Kit II | BioAssay Systems | DUR2-100 | |
Single-edge razor blade for kidney dissection (.009", 0.23 mm) | IDL tools | 521013 | |
Slide warmer | Lab Scientific Inc., | XH-2001 | |
Software | NIKON | NIS elements | |
Sucrose | RPI | S24060 | |
TGF-b1 anitbody | Sigma-Aldrich | SAB4502954 | |
Tris EDTA buffer | Corning | 46-009-CM | RRID: AB_10747473 |
Trisodium citrate dihydrate | Sigma-Aldrich | SLBR6660V | |
Trisodium citrate dihydrate | Sigma-Aldrich | SLBR6660V | |
Triton | Sigma-Aldrich | 9002-93-1 | |
Tween 20 | Sigma-Aldrich | P1379 | |
White Glass Charged Microscope Slide, 25 x 75 mm Size, Ground Edges, Blue Frosted | Globe Scientific | 1358D |
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