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L'adesione è un primo passo importante nella colonizzazione e nella patogenesi della Candida. Qui, viene descritto un test in vitro per misurare l'adesione degli isolati di C. parapsilosis alle proteine immobilizzate sotto taglio fluido. Un dispositivo microfluidico multicanale viene utilizzato per confrontare più campioni in parallelo, seguito dalla quantificazione utilizzando l'imaging a fluorescenza.
C. parapsilosis (Cp) è una causa emergente di infezioni del flusso sanguigno in alcune popolazioni. Il clade della Candida , incluso il Cp, sta sviluppando sempre più resistenza alla prima e alla seconda linea di antimicotici. La CP è spesso isolata dalle mani e dalle superfici cutanee, nonché dal tratto gastrointestinale. La colonizzazione da Candida predispone gli individui a infezioni invasive del flusso sanguigno. Per colonizzare o invadere con successo l'ospite, il lievito deve essere in grado di aderire rapidamente alle superfici corporee per prevenire l'eliminazione da parte dei meccanismi di difesa dell'ospite. Qui descriviamo un metodo per misurare l'adesione di Cp alle proteine immobilizzate sotto taglio fisiologico del fluido, utilizzando un saggio di adesione end-point in un dispositivo microfluidico multicanale disponibile in commercio. Questo metodo è ottimizzato per migliorare la riproducibilità, ridurre al minimo la soggettività e consentire la quantificazione fluorescente dei singoli isolati. Dimostriamo anche che alcuni isolati clinici di Cp mostrano una maggiore adesione quando vengono coltivati in condizioni che imitano un ospite mammifero, mentre un ceppo di laboratorio usato frequentemente, CDC317, non è adesivo sotto taglio fluido.
Sono organismi commensali comuni sulla pelle e sulle mucose umane che possono portare a malattie invasive tra gli immunocompromessi con sostanziale morbilità, mortalità e costo associati 1,2,3. Sebbene C. albicans rimanga una causa importante di queste infezioni, le specie non albicans come C. parapsilosis, C. glabrata, C. krusei, C. tropicalis e C. auris sono sempre più riconosciute, soprattutto nelle popolazioni vulnerabili e con frequente resistenza ai farmaci antifungini disponibili4. Le specie non albicans presentano elementi distinti di biologia e patogenesi che sono oggetto di indagine attiva.
L'adesione è un primo passo importante nella colonizzazione e nella patogenesi. L'interferenza con questa fase può quindi offrire l'opportunità di arrestare la progressione della malattia in una fase precoce. Gli studi sull'adesione e l'invasione della Candida si sono concentrati prevalentemente sulle condizioni statiche 5,6. Questi studi hanno contribuito a definire la struttura e le funzioni delle adesine fungine nella malattia 7,8,9. Tuttavia, l'adesione nel flusso sanguigno, nei tratti gastrointestinali (GI) e nelle vie urinarie e nei cateteri deve avvenire in condizioni di flusso di taglio del fluido che pone vincoli unici all'adesione. L'adesione sotto taglio richiede una rapida formazione di legami di cattura e la capacità di resistere a forti forze di trazione prodotte a causa del movimento dei liquidi10,11. L'adesina di C. albicans, Als5, ha dimostrato di facilitare l'adesione dipendente dal taglio12,13. CpAls7 (CpALS4800) ha precedentemente dimostrato di mediare l'adesione di Cp alle cellule epiteliali e un knockout ha mostrato una diminuzione della virulenza in un modello di infezione del tratto urinario14. Abbiamo dimostrato che CpALS4800 promuove l'adesione in condizioni di taglio del fluido fisiologicamente rilevanti15.
La colonizzazione e la patogenesi della candida sono state ampiamente studiate nei modelli animali 16,17,18. I modelli più frequentemente utilizzati sono le infezioni della mucosa murina e del flusso sanguigno, ma i modelli di invertebrati, come le larve di Galleria, sono sempre più utilizzati a causa del basso costo, della rapidità di produzione e della semplicità. I modelli animali ricapitolano molte fasi del processo patologico umano sia nel patogeno che nell'ospite, comprese le risposte immunitarie adattative e innate dell'ospite, le interazioni del lievito con i tessuti e il microbiota e le risposte del lievito all'ambiente ospite. Al contrario, i saggi di adesione in vitro consentono di concentrarsi specificamente sulla fase di adesione e sulla manipolazione sperimentale di variabili come la forza di taglio, le condizioni di crescita del lievito e l'adesione a substrati specifici.
Poiché il Cp è in grado di crescere sia negli esseri umani che nelle fonti ambientali, è probabile che sia in grado di percepire e rispondere a diversi ambienti. A sostegno di questa nozione, diversi isolati clinici di Cp mostrano una bassa adesione al taglio fluido quando vengono coltivati nel terreno di crescita standard del lievito, lievito-peptone-destrosio (YPD), ma passano a una forte adesione quando vengono coltivati per alcune ore a 37 °C nel terreno di coltura tissutale 199 (M199)15,19. Qui viene fornito un protocollo dettagliato per un saggio a media produttività che consente la misurazione dell'adesione di più campioni di lievito eseguiti in parallelo, in condizioni definite di crescita, taglio del fluido, temperatura e substrato. Il test è stato progettato per massimizzare la riproducibilità e per consentire l'uso di isolati clinici di Cp, nonché di ceppi che sono stati manipolati sperimentalmente in laboratorio. Il test qui descritto, per l'adesione di Cp a un substrato di albumina sierica bovina (BSA), dimostra che gli isolati clinici mostrano un intervallo di adesione, mentre due ceppi di laboratorio comunemente usati, CDC317 e CLIB214 mostrano una scarsa adesione.
La Candida spp. è classificata come organismo di livello di biosicurezza 2 e deve essere maneggiata utilizzando le opportune precauzioni.
1. Crescita e induzione di ceppi clinici
2. Rivestimento di canali microfluidici
Figura 1. Layout del saggio di microfluidica. (A) Una coppia di canali, che mostrano il flusso inverso del fluido dall'"uscita" all'"ingresso". I campi tassellati consecutivi catturati dal microscopio sono mostrati da linee tratteggiate (1-10 per il canale superiore e 11-20 per quello inferiore). (B) Configurazione del software di controllo della microfluidica per il flusso inverso durante il rivestimento BSA (Passaggio 2.10). Screenshot riprodotti qui con il permesso del produttore. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
3. Saggio di adesione
4. Imaging e quantificazione
Utilizzando i metodi descritti nella sezione Protocollo, è stata confrontata l'adesione di 6 ceppi di Cp (Tabella 1)
Sforzo | Descrizione | Riferimento/Fonte |
JMB81 | Isolato clinico invasivo da emocoltura infantile | 30 |
JMB77 | Isolato clinico invasivo da emocoltura infantile | 30 |
Ro75 | Isolato clinico commensale da neonato colonizzato | 29 |
WIH04 | Isolato clinico invasivo da emocoltura infantile | locale |
CLIB214 | Caso di Sprue, Porto Rico | ATCC (#22019) |
CDC317 | Mano dell'operatore sanitario | Codice ATCC (#MYA-4646) |
Tabella 1. Ceppi di parapsilosi da Candida utilizzati in questo studio.
Quattro dei ceppi erano isolati clinici recenti con un numero di passaggio bassodi 29,30 e CLIB214 e CDC317 sono ceppi comunemente usati che sono stati in coltura di laboratorio per molti anni. È stata osservata un'ampia gamma di indici di adesione, dallo 0,2% al 91% (Figura 2). Tre isolati clinici (JMB81, JMB77 e Ro75) hanno mostrato una forte adesione quando sono cresciuti in M199. È interessante notare che entrambi i ceppi di laboratorio hanno mostrato un'adesione relativamente scarsa in entrambi i mezzi di crescita. Il terzo isolato clinico, WIH04, assomigliava ai ceppi di laboratorio con un'adesione relativamente scarsa.
Figura 2. Saggio di adesione che confronta 6 isolati di Candida parapsilosis. Gli isolati sono stati coltivati per 3 ore in terreno YPD o M199 prima del test di adesione come descritto nel protocollo. Il grafico rappresenta la media e le barre di errore l'errore standard della media di quattro esperimenti consecutivi, con canali duplicati in ogni esperimento. L'indice di adesione rappresenta la percentuale della superficie del canale di flusso che è stata ricoperta di lievito. I confronti sono stati effettuati con l'analisi della varianza (ANOVA). I confronti tra i gruppi sono stati effettuati con il test di Holm-Sidak. *, P < 0,001. I confronti YPD-M199 non sono significativi per WIH04, CLIB214 e CDC317. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
I risultati mostrati qui provengono da quattro esperimenti consecutivi, eseguiti in giorni diversi. Dimostrano la riproducibilità del test di adesione.
I dati risultanti dal protocollo di cui sopra possono essere analizzati utilizzando un software per fogli di calcolo standard. I dati sono espressi come "indice di adesione", che viene calcolato come segue: il valore BinaryArea per ogni set di 10 immagini (che rappresenta la copertura del lievito per un singolo canale) viene sommato tra le immagini e la media e la deviazione standard vengono calcolate per l'area sommata di ciascuna coppia di canali. L'area del canale misurata nel passaggio 4.2 rappresenta l'area massima possibile in un singolo campo visivo che potrebbe mai essere coperta da lievito. In questo protocollo, l'intera lunghezza del canale viene registrata in 10 immagini consecutive, che rappresentano un'area di quasi 2,5 mm2. Quest'area del passaggio 4.2 viene moltiplicata per 10 per rappresentare la lunghezza del canale e il valore viene utilizzato per normalizzare le medie e le deviazioni standard per esprimerle come percentuali dell'indice di adesione. In pratica, questo misura la superficie di un canale che è ricoperto di lievito, con un indice di adesione del 100% che indica che l'intera lunghezza del canale è stata tappezzata di lievito da un bordo all'altro, un'area di quasi 2,5 mm2. Un indice di adesione dello 0% indicherebbe che non un singolo pixel ha raggiunto la soglia di fluorescenza. Questa condizione suggerirebbe che il bianco calcofluor non è stato aggiunto, o che il canale è stato ostruito e le cellule di lievito non sono riuscite ad entrare.
L'adesione delle celle sotto il taglio del fluido definito è stata misurata per la prima volta utilizzando camere di flusso a piastre parallele20. Queste camere di flusso costruite su misura utilizzavano tipicamente vetrini da microscopio o vetrini coprioggetti come basi e offrivano un unico canale per la misurazione 21,22,23. Utilizzando una versione commerciale di tale camera di flusso, si è scoperto che la forma di lievito di due ceppi di C. albicans si lega più fortemente all'endotelio rispetto alla forma ifale o pseudoifa24.
Lo sviluppo di un sistema di camere a flusso multicanale ha aperto la possibilità di saggi di adesione a più alta produttività. L'hardware della camera di flusso e le forniture monouso sono costosi, ma offrono un'uniformità di produzione che riduce la variabilità sperimentale. Finkel et al. hanno utilizzato questo sistema per misurare l'adesione di C. albicans al materiale siliconico utilizzato per realizzare una faccia del canale come modello di malattia associata al catetere endovenoso25. Un altro gruppo lo ha utilizzato per misurare l'adesione di C. albicans e Saccharomyces cerevisiae ai canali rivestiti di BSA, seguito dall'imaging a contrasto di fase (campo chiaro) di un singolo campo visivo, seguito dal conteggio delle cellule12 basato su software. Un terzo gruppo ha utilizzato lo stesso sistema multicanale per valutare la formazione di biofilm in C. albicans che interagisce con i canali non rivestiti, utilizzando anche l'imaging in campo chiaro per diverse ore26.
Nel protocollo attuale, il sistema di flusso multicanale è stato utilizzato per misurare in modo specifico la fase di adesione di Cp. Diverse modifiche aiutano ad aumentare l'accuratezza della quantificazione, massimizzare la gamma dinamica, ridurre il potenziale di fuoriuscite di rischio biologico e ridurre la variazione. È importante sottolineare che il sistema fluidico viene solitamente eseguito con l'orientamento in avanti, con il fluido che scorre da "ingresso" a "uscita". Oltre alla sezione di osservazione del canale, c'è anche una regione a serpentina più stretta del percorso del flusso che viene utilizzata per offrire resistenza idraulica al flusso. Questa regione tende a intrappolare il lievito. Nell'approccio attuale, le sospensioni di lievito vengono fatte funzionare con orientamento inverso, da "uscita" a "ingresso" (Figura 1A). In questo orientamento, la regione serpentina cade a valle della sezione di osservazione, riducendo la preoccupazione di intrappolare le cellule di lievito.
Le condizioni di crescita della Cp immediatamente prima del test di adesione influenzano fortemente l'adesione, così come il rivestimento del canale con BSA o proteine della matrice extracellulare13. In precedenza è stato dimostrato che il Cp aderisce alla BSA, al collagene, alla gelatina, alla fibronectina e anche ai canali15 rivestiti di siero. È stato osservato che l'adesione alla superficie del canale non rivestita è molto debole. La crescita nel terreno cellulare di mammifero (M199) o nel siero ha portato ad un aumento dell'adesione. È importante notare che, a differenza di C. albicans, Cp non ha mostrato una morfologia filamentosa nella durata di 5 ore di questo test. La velocità di taglio influenza fortemente l'adesione, con un taglio massimo osservato a 5 dine/cm2, che è simile a quello del sangue nei capillari e nelle venule post-capillari27,28.
Per ridurre il rischio biologico, le fasi di crescita del lievito, adesione sotto il taglio del fluido e lavaggio vengono eseguite utilizzando le precauzioni microbiologiche di livello 2 di biosicurezza al banco di laboratorio. Dopo questi passaggi, la piastra microfluidica viene svincolata dall'hardware, l'esterno della piastra viene pulito e coperto e la piastra chiusa viene ripresa al microscopio. Questo approccio riduce il rischio di contaminazione dell'area del microscopio.
Questo protocollo utilizza il bianco di calcofluor per colorare le pareti cellulari del lievito. Questo approccio è progettato per consentire l'imaging fluorescente di isolati clinici, senza la necessità di manipolazione genetica per aggiungere tag proteici fluorescenti come la GFP. La soglia fluorescente consente di misurare la superficie ricoperta di cellule di lievito. Per ridurre la potenziale interferenza con l'adesione, il colorante viene aggiunto dopo la fase di adesione, durante il lavaggio. La colorazione della chitina è la più intensa in corrispondenza delle cicatrici delle gemme, tuttavia, per la maggior parte dei ceppi di Cp, la colorazione diffusa è presente intorno all'intera periferia. Nell'attuale sistema di analisi, l'uso dell'ingrandimento inferiore, del pixel binning e di un'attenta regolazione della soglia di fluorescenza consentono di misurare l'intera cellula di lievito. Tuttavia, è importante tenere conto dell'efficienza di colorazione per i ceppi che variano notevolmente nel contenuto di chitina. Questo dovrebbe essere determinato in esperimenti preliminari o esaminando una porzione del canale con un ingrandimento maggiore prima dell'acquisizione dell'immagine.
L'adesione lungo la lunghezza del canale di visualizzazione può variare. Sommando la fluorescenza lungo la lunghezza del canale, si riduce la variabilità e la soggettività offerte da uno o da un piccolo numero di campi visivi. L'approccio attuale invece estrae la massima informazione disponibile dalla piastra microfluidica catturando l'intero canale. L'imaging è notevolmente facilitato da un tavolino motorizzato e da un meccanismo di messa a fuoco automatica per l'imaging rapido affiancato della lunghezza del canale (Figura 1A) con un input manuale relativamente ridotto. L'uso di obiettivi di potenza inferiore si traduce in un aumento del campo visivo, che a sua volta consente la leggera deviazione della posizione quando il canale viene scansionato dallo stadio motorizzato. Poiché le tolleranze della produzione della lastra comportano lievi variazioni nelle posizioni precise dei canali, non è possibile visualizzare tutte le immagini a 24 canali/240 in un'unica operazione. L'approccio utilizzato qui (2 canali e 20 immagini alla volta) è un compromesso. Tuttavia, utilizzando questo approccio, è possibile completare la procedura di imaging e quantificazione (passaggi 4.1-4.11) in circa 15 minuti.
Utilizzando questa configurazione per misurare l'adesione degli isolati clinici, è stata osservata un'ampia gamma di indici di adesione dallo 0,2% al 91%. È interessante notare che due ceppi di Cp utilizzati frequentemente, CLIB214 e CDC317, hanno mostrato una debole adesione (Figura 2). Queste osservazioni indicano che esiste una variazione significativa tra gli isolati di Cp e che il test può fornire dati di adesione in un ampio intervallo dinamico.
Potenziali variazioni o modifiche di questo test includono l'uso di diverse specie di funghi. Praticamente qualsiasi specie che colora in modo fluorescente con calcofluor può potenzialmente essere utilizzata in questo saggio, sebbene possa richiedere substrati o condizioni di crescita diversi. I funghi che differiscono in modo significativo nella forza di adesione possono essere sistemati modificando la forza di taglio o la durata delle fasi di adesione o lavaggio. È anche possibile far crescere monostrati di cellule endoteliali o cellule epiteliali nei canali di flusso e misurare l'adesione del lievito alle cellule ospiti. Le cellule di mammifero tendono ad escludere il calcofluor e generalmente offrono un basso fondo fluorescente, in modo che sia ancora possibile la rilevazione specifica del lievito. Tuttavia, va notato che i saggi di adesione tra due tipi di cellule richiedono uno sforzo sostanzialmente maggiore per mantenere sia le cellule fungine che quelle di mammifero in condizioni fisiologiche ottimali.
I limiti del test includono la difficoltà di analisi dei ceppi iperadesivi. I ceppi fungini che formano grandi grumi possono non riuscire a entrare nel microcanale, oppure ostruire il flusso all'interno del canale. Questa difficoltà si incontra con le ife di C. albicans. Se lasciati crescere a lungo, i filamenti ifali formano stuoie appiccicose che intasano il canale. Un altro limite è l'identificazione delle condizioni di crescita che favoriscono l'adesione. Questi possono variare per diverse specie, forme di crescita o anche per specifiche vie di adesione. Infine, alcune molecole di adesione possono richiedere un contatto prolungato con i ligandi affinché si verifichi un forte legame. In tali casi, può essere preferibile un saggio di adesione statica, come quello spesso eseguito in piastre a 96 pozzetti.
Nessuna divulgazione.
Questo lavoro è stato sostenuto da una sovvenzione della cattedra William e Mary Oh-William e Elsa Zopfi in Pediatria per la ricerca perinatale, dal Kilguss Research Core e da un Institutional Development Award (IDeA) dal National Institute of General Medical Sciences del National Institutes of Health con il numero di sovvenzione P30GM114750.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Bioflux 200 | Fluxion | Bioflux 200 | |
Bioflux Microfluidics plates, 48 well, low shear | Fluxion | 910-0004 | |
Bovine Serum Albumin (BSA) Fraction V | Fisher Scientific | BP1605 | |
Calcofluor Fluorescent Brightener | Sigma-Aldrich | F3543 | |
DAPI filter set 440/40 | Nikon | ||
Dulbecco’s Phosphate-Buffered Saline (DPBS+) | Corning Cellgro | 21-030-CM | With calcium and magnesium |
Hank’s Balanced Salt Solution, 1X (HBSS+) | Corning Cellgro | 21-023-CM | With calcium and magnesium, without phenol red |
Inverted microscope with Perfect Focus | Nikon | Ti-E | |
M199 medium | Lonza | 12-117Q | With Earle's salts and HEPES |
Motorized Stage | Nikon | Ti-S-E | |
Nikon 20x lambda Plan-Apo objective | Nikon | ||
NIS-Elements software 5.02 | Nikon | ||
Spectra fluorescent LED light source | Lumencor | SPECTRA-X3 | |
Zyla 4.2 sCMOS camera | Andor | Zyla 4.2 |
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