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Questo protocollo utilizza la crusca di frumento in un sistema di fermentazione rotatorio allo stato solido per migliorare la produzione di enzimi. Il substrato, integrato con induttori come la chitina, supporta la crescita fungina in condizioni controllate. I risultati dimostrano che le rese enzimatiche sono 4-6 volte superiori rispetto alla fermentazione sommersa, dimostrando l'adattabilità e l'efficacia del metodo per diverse applicazioni biotecnologiche.
La fermentazione allo stato solido (SSF) è un processo di bioconversione che utilizza un substrato solido che non si dissolve in un mezzo acquoso. I microrganismi crescono sulla superficie del substrato e penetrano nella sua matrice solida per estrarre i nutrienti essenziali per il loro sviluppo. La SSF è caratterizzata da una minima quantità di acqua libera, con un contenuto di umidità del substrato mantenuto superiore al 70%, e coinvolge tre fasi interconnesse: gassosa, liquida e solida. Questo protocollo descrive l'uso della crusca di frumento, un sottoprodotto agroindustriale, come substrato di base per la produzione di enzimi in un sistema rotativo. Il substrato è integrato con un induttore, come la chitina, il chitosano, l'amido o la cellulosa, per promuovere la sintesi delle proteine idrolitiche. Il sistema è altamente adattabile e consente l'uso di diverse forme fungine, tra cui micelio, spore o pellet. Nella metodologia descritta, l'induttore e il substrato vengono miscelati in un rapporto di 1:100 (p/p), sterilizzati in autoclave e regolati al livello di umidità desiderato con acqua sterile. Viene quindi aggiunto l'inoculo fungino e il sistema rotante funziona a 10 giri/min per garantire un'adeguata miscelazione e ossigenazione. Il sistema viene incubato per 6-8 giorni in condizioni di crescita ottimali per funghi mesofili o termofili/termotolleranti, migliorandone la versatilità. Dopo l'incubazione, l'enzima viene facilmente estratto utilizzando un tampone freddo appropriato (ad esempio, acetato, citrato o fosfato), a seconda del tipo di enzima. L'estratto viene chiarificato attraverso la centrifugazione e la filtrazione per ottenere un surnatante privo di cellule. L'enzima può quindi essere ulteriormente concentrato o purificato secondo necessità. I risultati hanno dimostrato un aumento di 4-6 volte dell'attività enzimatica rispetto alla fermentazione sommersa (SmF), evidenziando l'efficacia del sistema. La sua adattabilità a diversi substrati, induttori e specie fungine lo rende uno strumento prezioso per varie applicazioni biotecnologiche.
La fermentazione allo stato solido (SSF) è emersa come una tecnologia di bioconversione promettente e sostenibile per la produzione di enzimi, composti bioattivi e metaboliti secondari di alto valore. Questa tecnica prevede la crescita di microrganismi su substrati solidi con una quantità minima di acqua libera, simulando il loro ambiente naturale e consentendo un'efficiente attività metabolica1. L'obiettivo principale di questo protocollo è ottimizzare la produzione di enzimi attraverso un sistema SSF rotante che garantisca un migliore utilizzo del substrato, la diffusione dell'ossigeno e la scalabilità del processo. L'impiego della crusca di frumento, un abbondante sottoprodotto agroindustriale, come substrato di base, contribuisce alla valorizzazione dei residui agricoli e promuove pratiche di bioeconomia circolare2.
L'SSF presenta vantaggi significativi rispetto alla fermentazione sommersa (SmF), tra cui un minor consumo di energia e acqua, una maggiore concentrazione di prodotto e la compatibilità con un'ampia gamma di residui agricoli economici come crusca di frumento, lolla di riso e bagassa di canna da zucchero3. A differenza dell'SmF, che richiede grandi volumi di acqua e costosi mezzi nutritivi, i sistemi SSF sfruttano matrici solide che non solo fungono da superfici di crescita microbica, ma forniscono anche nutrienti essenziali per l'attività microbica. Inoltre, l'acqua libera limitata nell'SSF riduce al minimo i rischi di contaminazione, rendendola un'opzione più robusta per la produzione di enzimi in ambienti industriali4. Oltre ai suoi vantaggi operativi, la CSS presenta significativi vantaggi ambientali ed economici rispetto alla fermentazione sommersa (SmF). Gli studi hanno riportato che il CSS riduce il consumo di acqua del 50%-70% e abbassa i costi energetici di oltre il 30% a causa dell'assenza di grandi volumi d'acqua che richiedono un'agitazione e un'aerazione costanti. Inoltre, l'uso di residui agroindustriali come substrati riduce al minimo i costi delle materie prime e promuove pratiche di economia circolare attraverso il riutilizzo dei sottoprodotti agricoli 2,4.
SSF è stato ampiamente convalidato per la sua efficienza e scalabilità. Ad esempio, gli studi hanno riportato un aumento di 4-6 volte dell'attività enzimatica utilizzando SSF rispetto a SmF, evidenziando i vantaggi economici e ambientali di questa tecnica 2,5. Inoltre, il processo a valle è semplificato, poiché l'estrazione enzimatica richiede in genere meno acqua e meno fasi di purificazione. Ciò rende l'SSF particolarmente interessante per le industrie che mirano a ridurre i costi operativi e l'impatto ambientale6.
Il sistema SSF rotativo descritto in questo protocollo offre diversi miglioramenti rispetto ai tradizionali metodi SSF statici. Mentre i sistemi statici spesso affrontano sfide come la colonizzazione irregolare del substrato e la limitazione dell'ossigeno, la configurazione rotante garantisce una miscelazione e un'aerazione accurate, promuovendo una crescita microbica uniforme 7,8,9. Ad esempio, questo sistema è stato impiegato con successo per produrre enzimi idrolitici come chitinasi, amilasi e proteasi utilizzando specie fungine come Aspergillus e Trichoderma2.
Una caratteristica fondamentale di questo sistema SSF è la sua adattabilità. L'uso della crusca di frumento come substrato di base dimostra il potenziale dei residui agroindustriali per una bioconversione economicamente vantaggiosa3. Inoltre, l'integrazione del substrato con induttori come chitina, chitosano e amido migliora ulteriormente la sintesi enzimatica stimolando specifiche vie metaboliche 2,10. Il sistema è inoltre compatibile con diverse forme fungine, tra cui spore, micelio e pellet, consentendo agli utenti di adattare il processo alle proprie esigenze specifiche2.
La SSF offre un ampio potenziale di applicazione in vari campi come la biotecnologia alimentare, la produzione di biocarburanti e il risanamento ambientale11. L'integrazione di substrati economici, le rese enzimatiche eccezionali e l'elevata flessibilità del processo rendono la SSF un approccio essenziale per le innovazioni biotecnologiche su scala industriale.
I reagenti e le attrezzature utilizzate in questo studio sono elencati nella Tabella dei materiali.
1. Preparazione del substrato
NOTA: Utilizzare una marca commerciale di crusca di frumento per ridurre al minimo le variazioni significative nelle caratteristiche del substrato. Ogni lotto di crusca di frumento varia a causa di molteplici fattori, il che lo rende un materiale eterogeneo difficile da standardizzare, con conseguenti fluttuazioni nel suo contenuto costitutivo. Se è necessario un materiale standardizzato, scegliere una matrice alternativa o eseguire un'analisi chimica immediata di ciascun lotto di crusca di frumento per regolarla in base alle esigenze.
2. Preparazione dell'inoculo
NOTA: Questo protocollo descrive tre metodi per la preparazione dell'inoculo: sospensione di spore, inoculazione diretta con dischi di micelio e sospensione cellulare. Stabilisci la concentrazione iniziale dell'inoculo e quantifica i livelli proteici per calcolare accuratamente la resa.
3. Predisposizione del sistema SSF
NOTA: Gli induttori possono essere naturali o commerciali. Gli induttori commerciali purificati sono preferiti per ridurre al minimo le impurità che potrebbero alterare l'efficienza della fermentazione. Regolare le aggiunte di acqua per mantenere un'umidità relativa di almeno il 90%.
4. Procedura di fermentazione allo stato solido (SSF)
NOTA: Per studi cinetici o valutazioni dei parametri in momenti diversi, preparare provette separate per ogni punto temporale per garantire la rappresentatività.
5. Estrazione di enzimi
NOTA: I fondamenti dell'estrazione si basano sulla solubilità e sull'attività del pH massimo dell'enzima extracellulare. Poiché l'SSF evita il mezzo acquoso, l'enzima extracellulare è coinvolto nell'acqua che circonda la matrice solida, il che significa che la concentrazione è superiore a quella dell'SmF. In questo contesto, la selezione del miglior buffer di estrazione dipende dalla conoscenza dell'attività desiderata. L'ottimizzazione delle estrazioni dipende dalla concentrazione enzimatica finale e dal tipo di tampone di estrazione utilizzato.
6. Processo di ottimizzazione
NOTA: Ottimizza questo protocollo valutando e regolando la qualità e la concentrazione degli induttori, nonché il tipo e la concentrazione dell'inoculo.
La Figura 1A presenta la rappresentazione schematica del miscelatore rotativo utilizzato in questo sistema, che ha una capacità di sei provette coniche da 50 mL. La Figura 2B illustra i cambiamenti che si verificano nella crusca di frumento durante il condizionamento prima di entrare nel processo di fermentazione allo stato solido. Come visto, non sono stati osservati cambiamenti strutturali significativi.
La Figura 2 mostra la saturazione della crusca di frumento dopo 6 giorni di fermentazione allo stato solido per la produzione di chitinasi da parte del fungo Trichoderma harzianum in questo sistema, utilizzando la chitina commerciale come induttore. La Figura 2A mostra il materiale originale prima del processo di fermentazione. Le micrografie confermano l'utilizzo del substrato da parte del fungo, che si riflette anche nelle modificazioni che subisce, perdendo la sua struttura frattale a causa dell'interazione con il fungo.
I risultati nella Figura 3 mostrano un aumento significativo dell'attività della chitinasi (Figura 3A) e dell'attività dell'amilasi (Figura 3B) ottenute rispettivamente da T. harzianum e Aspergillus lentulus, confrontando i sistemi di fermentazione allo stato solido (SSF) e di fermentazione sommersa (SmF). I dati sono stati convalidati mediante un test ANOVA e Tukey a una via con p < 0,05 utilizzando il software SigmaPlot. In questo contesto, si osserva che questo sistema è applicabile a diverse attività enzimatiche e funghi. A. lentulus è stato caratterizzato come un fungo termotollerante, incubato a 40 °C, mostrando un aumento significativo della sua attività amilasi. I risultati dell'attività della chitinasi di T. harzianum sia nella fermentazione liquida che in quella solida sono stati precedentemente riportati separatamente dal nostro gruppo di ricerca 2,5, con questo lavoro che conferma e confronta un aumento significativo di SSF rispetto a SmF, simile all'attività dell'amilasi. Il nostro gruppo ha lavorato con più di 50 ceppi fungini per la produzione di proteasi e amilasi in condizioni mesofile e termofile, e i risultati sono coerenti.
I risultati confermano il successo del protocollo dimostrando aumenti significativi dell'attività enzimatica, con la fermentazione allo stato solido che produce rendimenti più elevati rispetto alla fermentazione sommersa. Ciò indica l'efficacia dell'SSF nel migliorare la produzione di chitinasi e amilasi. I dati pubblicati in precedenza sono stati riutilizzati con il permesso di ristampa.
Figura 1: Panoramica del sistema rotativo di fermentazione allo stato solido (SSF) e del processo di pretrattamento della crusca di frumento. (A) Rappresentazione schematica del sistema rotativo SSF. (B) Modifiche nel processo di pretrattamento della crusca di frumento: (I) Materia prima iniziale, (II) Crusca di frumento umida dopo la fase di lavaggio, (III) Crusca di frumento essiccata. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: Saturazione del substrato da parte di Trichoderma harzianum. (A) Substrato prima dell'SSF. (B,C) Substrato saturo di micelio fungino a diversi ingrandimenti. Barre della scala: (A), 50 μm; (B), 200 μm; (C), 100 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 3: Attività enzimatica nella SSF e fermentazione sommersa (SmF) da parte di T. harzianum e A. lentulus. Confronto tra (A) la formazione di glucosamina attraverso l'idrolisi del chitosano da parte di enzimi prodotti da Trichoderma harzianum in SSF e SmF, e (B) l'attività dell'amilasi di Aspergillus lentulus ottenuta in SSF e SmF. Le barre di errore rappresentano la deviazione standard di tre repliche. Gli asterischi (*) indicano una differenza statisticamente significativa tra i dati. Si noti che la variazione statistica è specifica per ciascun tipo di enzima e non si applica ai confronti tra (A) e (B). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Questo studio delinea un protocollo rilevante per ottimizzare la produzione di enzimi attraverso sistemi di fermentazione allo stato solido (SSF), specificamente progettati per i funghi filamentosi. Di seguito, vengono discussi gli aspetti critici della metodologia, insieme al suo significato, ai limiti e alle potenziali applicazioni.
Il successo del protocollo dipende fortemente da passaggi chiave come la preparazione del substrato e dell'inoculo. Un corretto lavaggio e asciugatura della crusca di frumento sono essenziali per eliminare le impurità che possono interferire con la crescita dei funghi o la produzione di enzimi. Inoltre, l'attenta regolazione dell'umidità del substrato per mantenere l'umidità relativa al di sopra del 90% garantisce una colonizzazione e un'attività fungina ottimali13. Il funzionamento del sistema rotativo a 10 giri/min è un altro parametro cruciale, in quanto favorisce una miscelazione e un'ossigenazione uniformi, prevenendo l'aggregazione del substrato e garantendo una crescita fungina uniforme14.
L'adattabilità di questo protocollo risiede nella sua compatibilità con diverse specie fungine e induttori. Ad esempio, mentre la chitina commerciale e l'amido sono stati utilizzati come induttori in questo studio, altri substrati, come la lignina, la cellulosa o il chitosano, potrebbero essere sostituiti a seconda dell'enzima bersaglio. La risoluzione dei problemi comuni, come la colonizzazione irregolare del substrato, comporta il perfezionamento dei parametri di miscelazione o la regolazione della concentrazione dell'inoculo2. Inoltre, garantire la sterilità durante la preparazione del substrato e l'inoculazione è fondamentale per prevenire la contaminazione, soprattutto nelle applicazioni su scala industriale15.
Sebbene la SSF offra diversi vantaggi rispetto alla fermentazione sommersa (SmF), non è priva di limitazioni16. Una delle principali sfide è l'espansione del sistema SSF rotativo senza compromettere la miscelazione del substrato, la diffusione dell'ossigeno o la determinazione accurata della biomassa, un altro problema comune in SSF17,18. Inoltre, la dipendenza del protocollo da residui agroindustriali come la crusca di frumento può introdurre variabilità nei risultati a causa delle differenze nella composizione del substrato tra i lotti. Queste limitazioni evidenziano la necessità di un'ulteriore ottimizzazione quando si passa alla produzione su larga scala19,20.
Il sistema SSF rotativo descritto dimostra vantaggi significativi rispetto ai tradizionali metodi statici SSF e SmF. Rispetto all'SSF statico, il sistema rotante garantisce una crescita microbica più uniforme, riducendo i problemi legati alle limitazioni di ossigeno. Inoltre, l'adattabilità del sistema ne consente l'applicazione a varie forme fungine e tipi di enzimi, rendendolo altamente versatile18. I sistemi SSF possono avere varie configurazioni per migliorare la produttività dei metaboliti. Ogni tipo di impianto presenta vantaggi e svantaggi che devono essere analizzati in profondità per determinare la migliore configurazione. Il sistema SSF rotativo offre diversi vantaggi rispetto ai tradizionali SSF statici e SmF; tuttavia, deve affrontare sfide rispetto ad altri sistemi SSF, come i bioreattori a vassoio e a letto impaccato. I bioreattori a vassoio, comunemente utilizzati per SSF su larga scala, offrono semplicità e basso consumo energetico, ma devono affrontare sfide legate al trasferimento limitato di ossigeno e alla distribuzione dell'umidità, che portano a una crescita microbica irregolare e a una riduzione delle rese degli enzimi. I bioreattori a letto impaccato, d'altra parte, migliorano l'aerazione attraverso il flusso d'aria forzato, ma possono incontrare problemi con cadute di pressione e distribuzione irregolare della temperatura, in particolare nelle colonne alte. Al contrario, il sistema SSF rotante promuove una miscelazione continua e condizioni omogenee, riducendo le zone anaerobiche e migliorando la produttività degli enzimi. Tuttavia, il consumo di energia e l'usura meccanica dovuti alla rotazione continua possono aumentare i costi operativi21.
I sistemi di fermentazione statici allo stato solido, come i bioreattori a vassoio, sono limitati da un limitato trasferimento di calore e massa, che spesso porta a gradienti di temperatura interna superiori a 30 °C, con conseguenti prestazioni microbiche non ottimali. Questi sistemi di solito operano a piccoli volumi (0,15-0,25 m³) e soffrono di colonizzazione microbica eterogenea, con studi che indicano che solo circa il 34% dei pori del substrato viene utilizzato in modo efficace. Al contrario, i bioreattori rotanti offrono un'agitazione meccanica che migliora la distribuzione dell'ossigeno e l'omogeneità del substrato, supportando al contempo volumi operativi più ampi fino a 13 m³ e carichi di substrato che raggiungono il 40% (p/v). Un esempio notevole riguarda la produzione di cellulasi da parte di Thermoascus aurantiacus, dove un reattore SSF rotante mantenuto a 49 °C e ventilato a 5 L/min·kg ha prodotto 14.098 UI/g di attività enzimatica, oltre tre volte superiore alle 4.212 UI/g ottenute in condizioni statiche22.
L'aumento della fermentazione allo stato solido richiede un delicato equilibrio tra il mantenimento della cinetica microbica e la garanzia di un efficace trasferimento di massa e calore in sistemi progressivamente più grandi. L'approccio graduale tradizionale include fasi di laboratorio (5-20 kg), pilota (50-5.000 kg) e industriali (25-1.000 tonnellate). Una delle principali sfide durante lo scale-up è la dissipazione del calore metabolico, che può raggiungere fino a 3.200 kcal/kg di materiale secco, particolarmente problematica nei sistemi statici o scarsamente ventilati. Per risolvere questo problema, le strategie di scale-up spesso si basano sul controllo di parametri di progettazione adimensionali e sull'applicazione di approcci di modellazione matematica, comprese le equazioni di bilancio di massa ed energia, per preservare variabili chiave come la disponibilità di ossigeno e la ritenzione di umidità del substrato su scale diverse. I sistemi su scala pilota (ad esempio, 150 L e 6 m³) hanno incorporato con successo caratteristiche ingegneristiche come camicie d'acqua, pale di agitazione curve e umidità controllata per migliorare la riproducibilità del processo e garantire rese costanti del prodotto 18,21,22.
Il protocollo presentato ha dimostrato l'efficacia per la produzione di enzimi su piccola scala di laboratorio. Tuttavia, l'aumento del processo per le applicazioni industriali pone sfide significative, principalmente legate al mantenimento di una miscelazione e di un'aerazione efficienti in volumi maggiori. Un approccio promettente per affrontare queste limitazioni è l'uso di un reattore a vite continua, che imita la funzione di un miscelatore verticale promuovendo una miscelazione continua e una migliore ossigenazione in tutto il substrato solido. Questo design riduce la formazione di zone anaerobiche e migliora il trasferimento di massa, fattori critici per il successo della fermentazione allo stato solido su scala industriale 2,15. Tuttavia, le potenziali sfide includono il mantenimento dell'integrità strutturale della matrice solida e la prevenzione della formazione di gradienti di temperatura lungo il reattore. Ulteriori studi dovrebbero concentrarsi sull'ottimizzazione dei parametri operativi e sulla convalida delle rese enzimatiche in condizioni di aumento di scala per garantire la fattibilità e l'efficienza del processo.
Le potenziali applicazioni di questo protocollo si estendono a molteplici settori, tra cui le biotecnologie alimentari, le bioenergie e il risanamento ambientale. Ad esempio, l'aumento della produzione di enzimi idrolitici come le chitinasi e le amilasi può supportare i processi di bioconversione in agricoltura e nell'industria. Inoltre, l'uso di sottoprodotti agroindustriali come la crusca di frumento si allinea con pratiche sostenibili, promuovendo la valorizzazione dei rifiuti e contribuendo a una bioeconomia circolare20.
Gli autori dichiarano di non avere conflitti di interesse.
Questo lavoro è stato sostenuto dalla Secretaría de Investigación y Posgrado dell'Instituto Politécnico Nacional (SIP-IPN) attraverso i numeri di sovvenzione/progetto 20220487, 20230676, 20240793 e 20251269 assegnati a GGS e 20220492, 20230427, 20240335 e 20251139 assegnati a DROH. Gli autori desiderano esprimere la loro gratitudine a ENCB-IPN, alla Secretaría de Ciencia, Humanidades, Tecnología e Innovación de México (Secihti), precedentemente nota come Consejo Nacional de Ciencia, Humanidades y Tecnología (CONAHCyT), e BEIFI-program, nonché al Centro de Nanociencias y Micro y Nanotecnologías dell'Instituto Politécnico Nacional per il loro inestimabile supporto. López-García riconosce Secihti (precedentemente CONAHCyT) per la borsa di studio del master, così come IPN per la borsa di studio SIP-BEIFI. Legorreta-Castañeda ha ricevuto una borsa di studio post-dottorato dal programma "Estancias Posdoctorales por México" di Secihti, precedentemente noto come CONAHCyT.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
125 mL Erlenmeyer flask | Sigma-Aldrich | CLS431684 | For culturing mycelium in liquid medium. |
50 mL conical tube | Sigma-Aldrich | CLS430921 | For storing and preparing substrates and inoculum. |
Acetate buffer, pH 5.6 | Sigma-Aldrich | 320866 | For chitinase extraction. |
Centricon filters | Millipore | UFC905024 | For further purification of enzymes. |
Counting cells chamber | Sigma-Aldrich | Z359629 | Used to count spores under a microscope. |
Filter paper | Whatman | 1001-110 | For filtering the enzyme extract. |
Hygrometer | Todomicro | - | To measure relative humidity of the substrate. |
Inducer (e.g., commercial chitin) | Sigma-Aldrich | C9752 | Used to enhance enzyme production during fermentation. |
Phosphate buffer, pH 6.9 | Sigma-Aldrich | P5379 | For amylase extraction. |
Potato-dextrose agar | Sigma-Aldrich | P2182 | Culture medium for growing fungal mycelium. |
Potato-dextrose broth | Sigma-Aldrich | P6685 | Liquid culture medium for growing fungal mycelium. |
Rotary mixer | Thermo-Fisher Scientific | 88-861-051 | To keep substrate moving during fermentation. |
Salt solution components (e.g., KH2PO4, Na2SO4, KCl, etc.) | Sigma-Aldrich | Multiple | For preparing sterile salt solution, see detailed recipe in the protocol. |
Wheat bran | Comercial market | - | Substrate for solid-state fermentation. |
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