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* Estos autores han contribuido por igual
Las pequeñas vesículas extracelulares derivadas de células madre mesenquimales (MSC-sEVs) han sido subrayadas como una modalidad de tratamiento libre de células con efectos adversos mínimos. Este estudio proporciona un protocolo que combina la hemodiálisis con la ultracentrifugación, reduciendo significativamente el tiempo empleado en todo el proceso y asegurando el cumplimiento de las normas de buenas prácticas de fabricación (GMP).
Las pequeñas vesículas extracelulares (sEV) derivadas de células madre mesenquimales (MSC-sEVs) han sido subrayadas como una modalidad de tratamiento libre de células con efectos adversos mínimos. Por el contrario, los métodos de extracción tradicionales, como la ultracentrifugación y la cromatografía de exclusión por tamaño, están limitados por su intensidad de tiempo, costo y escalabilidad. Para superar estas limitaciones, proponemos un método que integra un hemodializador y ultracentrifugación. Este enfoque utiliza un dispositivo de hemodiálisis con una membrana de corte de peso molecular (MWCO) de 100 kDa, que concentra selectivamente los sEV mientras filtra una gran cantidad de proteínas, mejorando así el rendimiento y la pureza de los sEV. A este paso inicial de purificación le sigue la ultracentrifugación para refinar aún más la preparación del sEV. La integración de estas dos tecnologías no solo redujo significativamente el tiempo dedicado a todo el proceso, sino que también garantizó el cumplimiento de las normas de buenas prácticas de fabricación (GMP). El método aquí demuestra una alta eficiencia en el aislamiento de sEV de un gran volumen de muestras, lo que ofrece un avance significativo sobre los métodos tradicionales. Este protocolo es prometedor para acelerar la traslación de las terapias basadas en VE a la práctica clínica al proporcionar una solución escalable, rentable y que cumple con las GMP.
Las pequeñas vesículas extracelulares derivadas de células madre mesenquimales (MSC-sEVs) son vesículas heterogéneas enriquecidas con múltiples componentes como ARNm, micro-ARN, citocinas, lípidos y metabolitos1. En los últimos años, muchos estudios han subrayado el inmenso potencial terapéutico de los MSC-sEV como una modalidad de tratamiento libre de células con efectos adversos mínimos2, mostrándose prometedores para abordar un espectro de afecciones, incluido el envejecimiento, la degeneración de tejidos, el cáncer y el trastorno inflamatorio 3,4,5,6. Sin embargo, persiste un desafío crítico en la extracción a gran escala de sEV, ya que los métodos tradicionales demuestran ser laboriosamente lentos o económicamente inviables. Además, garantizar la reproducibilidad es primordial para la aplicación clínica y la traslación de las terapias basadas en VE7. Los investigadores necesitan urgentemente un método de purificación que no solo sea simple y eficiente, sino que también cumpla con los estándares de buenas prácticas de fabricación (GMP)8.
Los métodos convencionales de purificación, incluyendo la ultracentrifugación, la ultrafiltración, la cromatografía de exclusión por tamaño, la inmunoafinidad y la precipitación de polímeros, se han aplicado ampliamente en investigacionesprevias 9. En general, los métodos tradicionales para el aislamiento de sEV presentan limitaciones como una baja tasa de rendimiento, una pureza comprometida y desafíos para cumplir con los estrictos estándares asépticos. Además, investigaciones anteriores han informado del potencial de técnicas prometedoras como los sistemas microfluídicos10,11, el aislamiento magnético sin etiquetas12 y el aislamiento químico covalente13 para lograr un rendimiento excepcional. Sin embargo, la necesidad de equipos especializados hace que la adopción de estas técnicas avanzadas sea un reto para la mayoría de los equipos de investigación. En resumen, el método eficiente para aislar sEV de grado GMP de un gran volumen de muestras sigue siendo un obstáculo crítico, lo que limita el progreso de numerosos equipos tanto en investigación como en aplicaciones clínicas.
La ultracentrifugación es el método más ampliamente adoptado para el aislamiento de sEV y es reconocido como el método de referencia14,15. Es una técnica que aprovecha las diferencias de densidad y tamaño para aislar los sEV. Los SEV aislados se enjuagan comúnmente con solución salina tamponada con fosfato (PBS) para eliminar los contaminantes residuales. A continuación, se suele utilizar un volumen adecuado de PBS para resuspender los sEV enjuagados y se pueden cosechar diferentes concentraciones esperadas de sEV controlando el volumen de PBS. Además, se ha informado de que la pureza de los sEV de plasma obtenidos por ultracentrifugación parece ser mejor que la de los sEV de plasma aislados por cromatografía de exclusión por tamaño (SEC), y los sEV obtenidos por ultracentrifugación tienen menos impurezas de partículas extracelulares no vesiculares (NVEP). Esto también hace que la ultracentrifugación sea la más utilizada y difícil de reemplazar en muchos tratamientos que requieren altas concentraciones de sEV. Sin embargo, además de la calidad y la pureza, la eficiencia también es un factor que no se puede ignorar en la extracción de sEV de gran volumen. Hasta ahora, una sola ronda de ultracentrifugación puede soportar un volumen de muestra de hasta aproximadamente 600 mL, lo que determina que es difícil satisfacer la demanda de extracción a gran escala solo por ultracentrifugación16.
Un dispositivo de hemodiálisis consiste en un módulo basado en una membrana que alberga miles de fibras huecas. La sangre circula a través de estas fibras dentro de una cámara cilíndrica cerrada17. Los constituyentes de la sangre pueden pasar selectivamente a través de estas membranas en función de su tamaño molecular y concentración iónica. En la clínica, es ampliamente utilizado como riñón artificial para eliminar los productos de desecho y el exceso de líquidos de la sangre de los pacientes 18,19,20. En otras palabras, el hemodializador también tiene el potencial de concentrar muestras de gran volumen, basándose en un proceso similar a la filtración de flujo tangencial (TFF). En la reciente directriz emitida por la Sociedad Internacional de Vesículas Extracelulares (ISEV), los concentrados de sEV se consideran adecuados para muestras de gran volumen, como el medio de cultivo celular. Después de décadas de desarrollo, los hemodializadores han sido ampliamente adoptados en los hospitales, respaldados por una gran cantidad de consumibles maduros y un grupo de operadores calificados, lo que facilita mantener la muestra estéril.
En este estudio se presenta un método de purificación de sEV basado en un hemodializador y una ultracentrífuga compatibles con GMPs. En este caso, elegimos dializadores de corte de peso molecular (MWCO) de 100 kDa, que se ha demostrado que capturan eficazmente las sEV y filtran numerosas proteínas22. La ultracentrifugación también proporciona un paso para una mayor purificación. El trabajo demuestra que el hemodializador es igualmente adecuado para la concentración de sEVs. Este protocolo permite a los investigadores aislar sEV de muestras de gran volumen de manera eficiente. Hemos registrado el ensayo clínico en el Registro Chino de Ensayos Clínicos (ChiCTR, NO. ChiCTR2200059018), que aún está en curso y aún no se ha completado. Aunque los datos clínicos no están disponibles para su publicación en este momento, un método confiable, a gran escala, eficiente y compatible para producir sEV como se informa en este protocolo es un requisito previo para realizar ensayos preclínicos y clínicos.
El protocolo fue aprobado y llevado a cabo de acuerdo con el Comité de Ética de Investigación en Humanos del Southwest Hospital.
1. Eliminación de los restos celulares del medio de cultivo
NOTA: Los procedimientos a continuación deben operarse en un entorno que cumpla con las GMP, especialmente cuando las muestras pueden exponerse directamente al medio ambiente.
2. Concentración del medio de cultivo filtrado con un hemodializador
NOTA: Absténgase de usar el Medio Eagle Modificado (DMEM) de Dulbecco que contiene rojo de fenol en cultivo celular, ya que el detector de fugas de sangre en el hemodializador se activará o apagará el detector de fugas de sangre en la configuración del hemodializador.
3. Separación de los sEV con ultracentrífuga
4. Caracterización de los sEV obtenidos
Caracterización morfológica de los sEV
En la etapa final de concentración, también se recolectó el líquido desperdiciado como se describe. El medio concentrado y el fluido desperdiciado fueron ultracentrífugos, respectivamente. Se recolectaron las precipitaciones para el análisis de microscopía electrónica de transmisión (TEM). Como se anticipó, se observó un número significativo de nanovesículas en forma de copa en el grupo de medio concentrado (Figura 2A,B). Sin embargo, no se detectaron partículas típicas de sEV en el grupo de fluidos desperdiciados. Estos hallazgos proporcionan evidencia de que el protocolo es capaz de separar los sEV sin experimentar una pérdida significativa durante el paso crucial de concentración.
Caracterización de marcadores proteicos para sEVs
Además, se empleó el análisis de Western blot para caracterizar los marcadores proteicos (CD9, CD81, HSP70) de los sEV aislados. Se observaron bandas de proteínas claras en el grupo de medio concentrado, mientras que no se detectaron bandas correspondientes en las muestras de fluidos desperdiciados (Figura 2C). En conjunto, estos resultados validan la presencia de componentes sEV.
Tamaño, características y rendimiento de las vesículas extracelulares
Para caracterizar aún más la cantidad y el tamaño, se aplicó NTA a las muestras obtenidas por ultracentrifugación tradicional (UC tradicional) y a nuestro protocolo. Dado que ambos métodos utilizaron ultracentrifugación, se utilizaron como control los sEV aislados del medio de cultivo MSC por UC tradicional, que incluyó principalmente la centrifugación a 300 × g durante 15 min, luego 2.000 × g durante 15 min y una ultracentrífuga a 110.000 × g durante 70 min a 4 °C, y luego los pellets se lavaron en solución salina y se realizó la segunda ultracentrifugación durante 70 min a 110, 000 × g. Los resultados demostraron que el rango de tamaño de los sEV obtenidos por este protocolo fue de 48,1 nm a 166,2 nm con un tamaño medio de 103,6 nm, el rango de tamaño de los sEV obtenidos por UC tradicional fue de 51,8 nm a 186,7 nm con un tamaño medio de 112,6 nm (Figura 3A,B). Además, introdujimos la relación de dilución con los resultados de NTA para medir el total de partículas recolectadas por dos protocolos. El resultado también indicó que, aunque no se pudo evitar la pérdida, cosechamos una cantidad considerable de sEV. A continuación, se presentan aquí dos diagramas de patrones de protocolos de aislamiento que consumen mucho tiempo (Figura 3C). A continuación, cuantificamos el consumo de tiempo de los protocolos. El método tradicional de UC requirió alrededor de 2030 min, y este protocolo requirió 260 min (Figura 3D). El rendimiento fue mayor utilizando este protocolo (Figura 3E), lo que muestra la eficiencia del protocolo para muestras de gran volumen.
Pruebas de esterilidad de control de calidad
Las pruebas de esterilidad son fundamentales para garantizar que los productos sean seguros. Las detecciones de bacterias, hongos, virus y endotoxinas se aplicaron a los sEV que aislamos. Los resultados se ordenaron aquí (Tabla 1). Y los resultados indicaron que los sEV obtenidos por nuestro protocolo estaban bien protegidos de los contaminantes.
Figura 1: Ilustración esquemática del protocolo para la concentración y el aislamiento de MSC-sEVs del sobrenadante de cultivo MSC. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2: Imágenes representativas de TEM y Western blot de sEVs. (A,B) El protocolo tiene como objetivo obtener un medio concentrado (muestra). Después de la concentración y posterior ultracentrifugación, el fluido desperdiciado denota el residuo recogido. Los MSC-sEV "en forma de copa" se detectaron en las muestras objetivo (medio concentrado) y no se observaron en los residuos fluidos. Barras de escala: 200 nm. (C) Se observaron bandas claras de proteínas CD63, CD9 y HSP70 en el medio concentrado, mientras que no se detectaron bandas correspondientes en muestras de fluidos desperdiciados. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 3: Tamaño de nanopartícula y número de partícula detectados por NTA. (A,B) El tamaño y la concentración de los sEV aislados por UC tradicional y este protocolo. (C) El diagrama de flujo de la UC tradicional (arriba) y el Hemodializer + UC de una sola ronda (abajo). (D) El consumo de tiempo de la CU tradicional y el Hemodializador + CU de una sola ronda. (E) El rendimiento (partículas obtenidas por hora) de dos protocolos diferentes. Los datos se representaron como media ± desviación estándar (*p < 0,05). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Prueba | Resultado | Unidad | Referencia | |
Gérmenes | Negativo | No se observó crecimiento bacteriano después de 5 días de cultivo normal | ||
Hongos | Negativo | No se observó crecimiento de hongos después de 5 días de cultivo normal | ||
Endotoxina | <0.0050 | UE/mL | ||
Virus | Virus de la hepatitis B (VHB) | Por debajo del límite más bajo | UI/mL | Cuantificación de ADN HBV,Límite mínimo de detección 20 |
Virus de la hepatitis C (VHC) | Negativo | UI/mL | Cuantificación de ARN-VHC | |
Virus de Epstein-Barr (VEB) | Negativo | copias/mL | Detección de fluorescencia por PCR | |
Citomegalovirus (CMV) | Negativo | copias/mL | Detección de fluorescencia por PCR |
Tabla 1: Las pruebas de esterilidad de control de calidad.
Los métodos tradicionales para el aislamiento de sEV incluyen la ultracentrifugación diferencial, la cromatografía de exclusión por tamaño y la precipitación PEG, cada uno con sus propias ventajas y desventajas. Si bien la amalgama de estas técnicas dispares puede mejorar el rendimiento o la pureza de los sEV, los pasos adicionales a menudo introducen más oportunidades para la contaminación de la muestra. Han surgido en el mercado sistemas integrados que afirman extraer sEV a granel y cumplir con las normas GMP21. Sin embargo, su adopción generalizada plantea un importante reto económico, especialmente para el creciente número de equipos de investigación de vehículos eléctricos. Además, la ausencia de protocolos estandarizados y procedimientos reconocidos para estos nuevos dispositivos puede introducir un cierto nivel de riesgo. Las buenas prácticas de fabricación (GMP) requieren más intentos tanto en la metodología como en el equipo para garantizar el cumplimiento simultáneo del rendimiento y la pureza.
Según una revisión reciente de las aplicaciones clínicas de los sEV23, el 35% por ciento de los estudios emplearon exclusivamente este método; Un 12,5% adicional de los estudios utilizaron la ultracentrifugación en combinación con otras técnicas. Su aplicación generalizada también implica que las ultracentrífugas se han convertido en equipos accesibles para una parte considerable de los investigadores24.
En términos prácticos, el empleo de la ultracentrifugación ayuda a nuestro método a aislar con precisión derivados celulares precisos de otros elementos, como células más grandes, fragmentos de células y células muertas25. Además, cabe destacar que, aunque se ha informado de la eficacia de los sEV, la realización de una eficacia terapéutica satisfactoria suele requerir el uso de altas concentraciones de sEV, especialmente en experimentos con animales, estudios preclínicos con animales grandes y ensayos clínicos. La ultracentrifugación es actualmente el método más crucial para obtener sEV de alta concentración, lo que aumenta la relevancia del protocolo para los escenarios de aplicación antes mencionados. Y como método maduro, la ultracentrifugación posee las ventajas de ser aplicable a muestras de amplio alcance y ser rentable.
El hemodializador se ha utilizado de forma innovadora para el procesamiento de grandes volúmenes de muestras de sobrenadantes de cultivos celulares, lo que permite el posterior aislamiento de sEV mediante ultracentrifugación de una sola ronda. Como se describe en el paso 2.5.2, el modo utilizado en la ultrafiltración es ISO-UF. El hemodializador en este modo es el mismo que el TFF. Dado que no se utiliza dializado exógeno, solo pequeñas moléculas salen de la membrana del filtro, como elH2O. TFF ya es un protocolo de enriquecimiento de sEVs ampliamente probado y recomendado. Sin embargo, los equipos TFF que cumplen con las GMP para el aislamiento de sEV son costosos y, a menudo, carecen de estándares operativos. Este tipo de equipo está menos verificado, por lo que la calidad del producto es difícil de garantizar. Por el contrario, el hemodializador se complementa con consumibles establecidos, protocolos operativos estandarizados y personal capacitado. Este método ofrece una solución viable para concentrar muestras, especialmente para los equipos de investigación hospitalarios que participan en ensayos clínicos. Además, como extensión, debido a sus propiedades físicas cercanas, creemos que este protocolo es teóricamente adecuado para el aislamiento de sEV de todas las MSC de varios linajes, pero para asegurarse, se necesita una verificación experimental adicional.
Este protocolo proporciona un requisito de esterilidad más fácil de cumplir, que es un requisito crucial en entornos GMP. Hemos realizado pruebas exhaustivas al explorar el protocolo, incluidas bacterias, hongos, virus y endotoxinas en las muestras, y los resultados son todos negativos. (Tabla 1) La prueba aquí no es la clave para el funcionamiento del protocolo que informamos, por lo que elegimos no incluir los resultados. La esterilidad es un requisito a lo largo de un protocolo, incluida la muestra, la operación, el equipo, el entorno, etc. Las pruebas de esterilidad son esenciales, especialmente para los productos destinados a uso terapéutico. Además, se deben considerar otros controles de calidad (QC) para el cumplimiento de las GMP desde aspectos como la identidad y la potencia. Aquí, identificamos las características físicas y los marcadores proteicos de sEV. También se debe verificar la potencia de los sEV aislados si los investigadores tienen la intención de utilizar el producto para aplicaciones posteriores.
También hay que tener en cuenta que, en primer lugar, este protocolo incorpora una doble etapa de filtración con filtros de 0,45 μm y 0,22 μm para eliminar los restos celulares y las vesículas mayores de 220 nm26. Aunque los métodos alternativos, como la centrifugación a baja velocidad, podrían teóricamente preceder a la ultracentrifugación27, esto podría resultar en una disminución de la eficiencia durante las operaciones a gran escala. Si las muestras de sobrenadante celular contienen una cantidad excesiva de material particulado debido a las operaciones previas a la filtración, la membrana filtrante utilizada aquí tiene una mayor probabilidad de reducir la velocidad de filtración debido al bloqueo en el proceso. Por lo tanto, también se recomienda tener siempre membranas filtrantes estériles de repuesto preparadas para su reemplazo en caso de obstrucción. Además, la operación de la hemodiálisis no se considera compleja, especialmente para los profesionales capacitados. Sin embargo, es importante asegurarse de que el medio de cultivo celular no contenga rojo de fenol. Esta precaución se toma no solo porque la evidencia sugiere que el indicador puede afectar potencialmente las funciones biológicas de sEV, sino también debido a su capacidad para activar la alarma de fuga de sangre de la hemodiálisis.
Este protocolo no es adecuado para tareas con un pequeño volumen de muestras a procesar. Cuando el aislamiento se puede lograr mediante 2 rondas de ultracentrifugación, este protocolo no ofrece una ventaja de tiempo. Sin embargo, a medida que aumenta el volumen, este protocolo puede convertirse en un método de aislamiento eficiente. El paso de concentración de este protocolo utiliza únicamente ultrafiltración sin el uso de tampón de diálisis. Es concebible que mediante el empleo de diferentes tampones de diálisis, se pueda lograr una mayor descontaminación de las sustancias coaisladas de los sEV. No se excluye que el tampón de diálisis pueda afectar la estabilidad de la membrana externa del sEV; Por lo tanto, se necesita más investigación para verificar esto.
En resumen, hemos presentado un método para el aislamiento a gran escala de MSC-sEVs que cumple con los estándares GMP. Se basa principalmente en hemodializadores y ultracentrífugas, que son más accesibles para muchos equipos de investigación que algunos de los equipos especializados más nuevos disponibles en el mercado. Hemos caracterizado los sEV obtenidos y, además, hemos realizado un examen de los residuos de filtración para identificar los procesos críticos que pueden conducir a la pérdida de los sEV. Los resultados indican que no hay pérdidas significativas, lo que sugiere la eficiencia y estabilidad del protocolo. Al utilizar plenamente los equipos de laboratorio existentes para abordar las nuevas demandas, este enfoque también proporciona una perspectiva de investigación novedosa.
Los autores declaran no tener intereses financieros contrapuestos.
Este trabajo fue financiado por la Fundación Nacional de Ciencias de China (822101167, a BB) y la Fundación de Ciencias Naturales de Chongqing (CSTB2022NSCQ-MSX0020 a BB), el Proyecto de Investigación Científica "A través del tren" de Chongqing PhD de China (CSTB2022BSXM-JCX0031 a BB) y la Fundación Nacional de Ciencias de China (82271132 a YL). Agradecemos la asistencia del Departamento de Nefrología, el Primer Hospital afiliado, la Tercera Universidad Médica Militar (Universidad Médica del Ejército), el Instituto de Patología y el Centro Oncológico del Suroeste, el Hospital del Suroeste, la Tercera Universidad Médica Militar (Universidad Médica del Ejército) por el equipo y el apoyo técnico.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Anti-CD63 | SBI System Biosciences | EXOAB-CD63A-1 | 1:1000 dilution |
Anti-CD9 | SBI System Biosciences | EXOAB-CD9A-1 | 1:1000 dilution |
Anti-HSP70 | SBI System Biosciences | EXOAB-Hsp70A-1 | 1:1000 dilution |
Bicinchoninic Acid Protein Assay Kit | Beyotime | P0012 | |
Bloodlines | Fresenius Medical Care | AP16641 | |
Bovine serum albumin 5% | Solarbio | 9048-46-8 | |
Cell culture supplement | Helios | HPCPLCGL05 | 5% (v/v) in cell culture media |
Copper grid | Precise | RGRS GP-SMPG-1 | |
Dialyzer | Helixone | FX8 | 100 kDa MWCO |
Drainage bag | CZRUIDE | YLD-01 | |
Goat Anti-Rabbit HRP | SBI System Biosciences | EXOAB-CD63A-1 | 1:10000 dilution |
Goat Anti-Rabbit HRP | SBI System Biosciences | EXOAB-CD9A-1 | 1:10000 dilution |
Goat Anti-Rabbit HRP | SBI System Biosciences | EXOAB-Hsp70A-1 | 1:10000 dilution |
Mesenchymal Stem Cell Basal Medium (MSCBM) | Dakewe | DKW34-BM20500 | |
Microfiltration membrane | shanghaixingya | WKLM-50-10 | 0.45 μm and 0.22 μm |
Parafilm | Fisher Scientific | 1337416 | |
Peristaltic pump | LongerPump | YZ1515x | |
Phosphate buffer saline | Solarbio | P1022-500ml | |
Immun-Blot PVDF Membrane | BIO-RAD | 1620177 | |
SDS-PAGE Gel Quick Preparation Kit | Beyotime | P0012AC | |
SDS-PAGE Sample Loading Buffer | Beyotime | P0015A | |
Super ECL Plus Western Blotting Substrate | BIOGROUND | BG0001 | |
TBST buffer | Solarbio | T1081 | |
Ultracentrifuge tubes 38.5 mL | Beckman | 344058 | |
Bio-Rad ChemiDoc MP Imaging System | BIO-RAD | ||
Hemodialyzer | NIKKISO | DBB-27 | |
Nanoparticle Tracking Analysis | ZetaView | PMX120 | To measure particle size distribution and particle concentration |
Transmission Electron Microscopy | JEOL | JEM-1400PLUS | Recommended settings?Exposure: 1.0 s, HT Voltafe 100.00 kV, Beam Curr: 50 μA, Spot Size: 1, Mode: TEM. |
Ultracentrifuge | BECKMAN COULTER | OPTIMA XPN-100 | SW 28Ti SwingingBucket Rotor |
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