Автоматизация скрининга криоэлектронной микроскопии в нескольких сетях с помощью Smart Leginon

В Центре электронной микроскопии им. Саймонса мы стремимся предоставлять превосходные услуги электронной микроскопии, экспертные знания и обучение местным и национальным исследователям, а также разрабатывать инновационные методы для оптимизации рабочих процессов. Наша сфера деятельности охватывает сервис, разработку, машинное обучение и биомедицинские исследования. Мы пытаемся ответить на вопрос, как мы можем лучше оптимизировать наши услуги?

Машинное обучение меняет область электронной микроскопии. Сбор данных становится автоматизированным. Инструменты анализа данных стремительно становятся все более эффективными.

Это включает в себя шумоподавление, отбор частиц, анализ гибкости 3G и построение моделей. Мы регулярно обновляем программное обеспечение, чтобы учесть различные ситуации, такие как различные отверстия в сетке, наклонная коллекция или ошибки, выявленные в ходе бета-тестирования программного обеспечения в нашей производственной среде. Мы также интегрируем отзывы наших пользователей, поэтому мы постоянно предоставляем полезные для них функции.

Smart Leginon решает трудоемкие и трудоемкие задачи скрининга одной или нескольких сеток на криоTEM. Это позволяет операторам и исследователям быстрее проверять и анализировать сетки, высвобождая время для параллельной оптимизации состояния сетки и образца. Это также сокращает время и стоимость работы микроскопа.

Smart Leginon autoscreen предлагает полностью автоматический многосеточный скрининг, который занимает около 10 минут для настройки скрининга для 12 сеток. По сравнению с ручным скринингом, наш протокол экономит несколько часов в день. С момента появления Smart Leginon было разработано другое бесплатное и коммерческое программное обеспечение для аналогичной автоматизации.