Name: assays to detect uv-reflecting structures and determine their importance in mate preference using the sailfin molly poecilia latipinna
Uploaded: 2016-09-14T12:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 41 s
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We are grateful to anonymous reviewers for comments and suggestions that greatly improved this manuscript. We thank R. Bowes, R. Carreno, and T. Panhuis for assistance in collecting the fish. We also thank M. Lee for assistance with male preference trials. We are grateful to the Ohio Wesleyan University Department of Zoology for helpful advice and suggestions throughout this study and Arizona State University (McGraw Lab) for software advice.

すべての実験は、オハイオウェスリアン大学の施設内動物管理使用委員会の承認を得て行きました。 分光光度計を使用して、魚の1.録音UV反射率<ol><li>楽器やソフトウェアの推奨に従って測定する波長範囲にわたって知られている標準的な白と分光光度計と光源を調整します。 </li><li>魚が応答しなくなるまで、炭酸水素ナトリウムの同量で緩衝3-アミノ安息香酸エチルメタンスルホン酸塩（MS-222）の0.5％溶液中に置くことによって、魚を麻酔。無応答たら、すぐに黒、無反射背景に魚を置きます。注：MS-222は、潜在的に毒性であり、そして手袋を常に着用します。 </li><li>分光計光源のそれを超えた過剰な光を最小限にするために暗い部屋でのすべての測定値を取ります。 </li><li>生物体に対して保持光ファイバプローブを用いて反射率を測定します。作りますいくつかのプローブの設計に組み込まれているように、光ファイバと本体との間の一貫性のある45°の角度を形成するようにしてください。注：測定の一貫性のためには、複数のスキャン（2 - 5）を横切って平均することが望ましいボディ領域当り。 </li><li>適切な反射率解析ソフトウェアとレコード反射率データ。注：ここで使用されるソフトウェアは次のように設定した= 2000秒、平均スキャン= 2積分時間、及び画素平滑= 5.データをスプレッドシートにコピー＆ペーストしました。 </li><li> UV反射率および生物横切って表現型の変化の範囲の有無を判断するために複数の身体領域に繰り返します。注：予備スキャンがあれば、ボディ領域は常にUVマークを表示する、決定することが必要であり得ます。 </li><li>完全に回復するまで、通常の蓋のビートと遊泳行動によって証明されるように、十分に酸素保持水槽に魚を返します。注：体に粘膜コーティングを復元するための商業的保護は、皮膚の回復を助けるために添加されてもよいです。 </li><li>代表必要であれば男女両方を含む、複数の個人渡って食べます。 </li><li>すべてのデータがX軸上のY軸と波長での反射率で、散布図を使用して、プロットデータコピーされたスプレッドシートに。 UV範囲における振幅のピーク（300から400 nm）は、魚へのUV反射率の存在を示します。 </li></ol> 2.二値交配トライアル注：焦点魚、UVフィルター、および不透明フィルタが適切に配置された制御観測を実行します。不透明なフィルタが削除され、これらの試験では、焦点魚がUV光の有無を表示するが、潜在的な交配パートナーを欠くタンクの部分にさらされます。この実験で二分選択テストの妥当性に関する詳細に関しては、これらのテストもあることに注意してくださいが、パーマーとHankison（2015）10は 、11の欠点。 <ol><li>焦点生物と性的受容個体を使用してください。女性P.を使用latipinna &lt;48時間産後5 AND男性は性的動機の可能性を向上させるために、試験前に少なくとも24時間、単離されました。 </li><li> 2選択肢の区画に隣接して中立領域に単焦点個人を置きます。 P.のための2つの等しいサイズの選択区画によって隣接焦点個々のための中央領域を形成し、透明なプレキシガラスパーティションによって3つのセクションに分かれ、latipinna、75.7 L試験水槽（ 図1 30.5センチメートルのx 30.5センチメートル×75センチ）を使用します。全く水や嗅覚は、個々のタンクのセクション間で共有されていないことを確認してください。各個人が観察されるのを繰り返します。 </li></ol><img alt="図1" src="/files/ftp_upload/54453/54453fig1.jpg" /> 図1.実験水族館のセットアップ 3つのセクションに分かれた矩形水族館：。（図は、両端のオブジェクトの男性と途中で女性を示している）オブジェクトのペアを開催焦点個人と二つの端区画を開催中央エリア。交換可能なフィルいずれかのブロックまたは許可紫外線反射率が水族館の男性と女性のセクションを分割ガラスパーティション上に配置することができメータ。この図は、パーマーとHankison（2015）10から変更されている。 <a href="https://ecsource-jove-com.bdigitaluss.remotexs.co/files/ftp_upload/54453/54453fig1large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a> <ol start="3"><li> （そのスペクトルUV-A領域内に延びている照明）フルスペクトル照明条件の下では、試験水槽の両端コンパートメント（選択肢の区画）内の1つの潜在的な交配パートナーを分離します。 2つの絶縁交配パートナーとの主な違いは、彼らは、UV光を透過するブロックまたはフィルタの背後に表示されるかどうかであるように、潜在的な交配パートナーは、サイズ、配色や表示特性にできるだけ密接にお互いに似ていることを確認してください。 注：アル可能な限り最高のカラーマッチングを可能にするために、可視スペクトル内の反射率を記録することが好ましい場合がありますここにかかわらず、マッチングは、目によって行われました。 </li><li> 15分間の視覚的分離の下で個人（不透明なフィルタ）を順応させます。フィルタ現時点では整備されている - UV +とがあることを確認してください。順化後、不透明なフィルタを削除します。各それぞれの試験のためにタンクの側面-その側バイアスが（関係なく、オブジェクトのタンクの一方の側のための固有の好み）が存在しないことを確認するには、ランダムにUV +とUVを割り当てます。 </li><li>焦点個人がストップウォッチを使って、特定の環境ゾーン（この場合の選択肢のコンパートメントに近い領域、約2標準ボディの長さ）内に費やす時間の量を記録します。女性の魚の場合、これは、2つの雄の各々の近くに費やす時間の量、および男性焦点魚その逆です。 注：イベントレコーダーソフトウェアは、記録のために使用することができます。 15分の試験は応答しないように少なくとも一回の結果から除外された各優先ゾーンを訪問していなかったこの実験や魚に使用しました。 </li><li>魚の交配の選択に影響を与える可能性がある特定の照明環境に向けて、固有のバイアスが存在しないことを確実にするためのコンパートメント-魚が空のUV +とUVの近くに費やした時間を記録し、分析します。個人が特定のUV条件を好むかどうかを判断するために対応のあるt検定を使用してください。 </li></ol>

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The authors have nothing to disclose.

分光光度計は、PにUVマーキングを同定することに成功しましたlatipinna。 P.の男女ともlatipinnaはその辺に沿ってUVマーキングを有します。また、いくつかの男性は、彼らの背びれにあらかじめ雌嵌合優先7において重要であることが見出さ形質をUVマーキングを有していました。 私たちは、UVマーキングの存在を検出するためのメカニズムとして、UV分光光度計を使用することをお勧めします。さらなる試験は、相手の嗜好（ここでは詳述）を含む社会的相互作用、におけるその役割を決定することができます。また、UV特性は浅水、個人、性別、または種の認識、またはintrasexual相互作用3、12月15日に影響を与える可能性があります。 より自分の社会的行動に特に関連する生物のUV特性を理解する上で、分光光度法の有用性にもかかわらず、B、できることには完全に行動を理解するために必要ないくつかの重要なステップ、およびいくつかの制限がありますeは結論付けました。特に生物が観察「明るさ」や輝度の変化を引き起こす可能性があり、UVを遮断するように、隣接する選択肢タンク内の無テスト個人とコントロールを含めることによって環境-すべての実験は、焦点個人がUV +またはUVための好みを持っているかどうかをテストする必要があります。輝度は密接Pに関連した種の女性の好みに影響を与えることが示されていないが明るさや好みテストの役割を詳細にlatipinna 16-18追加データは、以前の研究19で対処し、輝度の変化に基づいていないこと好みを確保する上で重要なステップである可能性があります。代替的に、照明フラックス（単位時間当たりの全体の輝度）の違いは、これが懸念2,20であるシステムにおける照明条件の一層の制御を可能に等しくすることができます。 また、配偶者選択のテストのために、選択肢の個人がにできるだけ密接に一致させる必要がありますサイズや着色（魅力別名）ので、その選択はより強く、UV +または紫外線に対する選好を反映しています- 。単一の個体は、UV +及びUVの両方で見ることを可能にする代替技術は、 -いくつかの生物21のために有用であり得ます。 （ -同時に条件同じ個体は、UV +と紫外線下で観察されるように）これらの研究は、個人の行動の違いの制御を可能にすることができます。我々は我々の実験デザインで私たちの魚間の動作の違いを見ていないが、この点は、他の生物や実験的なデザインのために重要であり得ます。また、個々のテストを介してUVフィルター2、またはそのスイッチフィルタ途中の側面を切り替えながら、個々の女性を再テストした研究は、個々の側バイアスを制御するための両方に有用であろう。最後に、分光光度法と相手の嗜好試験は生物の表現型のこれらの側面を明らかにすることができますが、ここでプロトコルが行いますエスは、完全に紫外線特性と彼らが焦点個人に明らかにすることができるの意味を決定する能力を持っていません。 UV形質を開発、相続、（そのような食品や捕食者の予測可能性など）環境条件、またはその他の要因によって影響されるかを理解するためのフィットネスの試験では、さらにUV特性の意味や役割を理解する上で有用であろう。

手がかりと動物の社会的相互作用に使用される信号を理解することは、私たちは内および種間の両方の表現型の変化を把握することができます。この変化は、人口の発散性選択、および分化のような進化の過程において重要な役割を果たしています。多くの場合、しかし、研究者たちは、人間の感覚系、視覚や聴覚のレルム内の特にへの最も明白な手がかりを模索に限定されています。分光光度計の使用は、しかし、私たちは人間の可視スペクトルを越えて他の種における社会的相互作用に重要である可能性が波長に我々の調査を拡張することができます。 具体的には、紫外線によってもたらされる近距離通信（UV; 300から400 nm）の感度は、配偶者選択1の間に非常に有利になる可能性があります。鳥や魚の多くは視覚的に狩り捕食者は、例えば、紫外線放射を検出することができません。男性は精巧に表示するシステムでUVスペクトルを利用するのではなく、可視スペクトル2,3で検出可能な手がかりを開発することによって、仲間を誘致する能力を維持しながら、一つは生物はそれぞれと通信している可能性を検討するために失敗した場合、女性のために、これらの男性は..捕食のリスクを減少させるであろう他のこれらの「プライベート通信チャネル」を使用して、行動と進化の重要なドライバーを見逃す可能性があります。 このプロトコルはのSailFinモリー、Poecilia latipinna、全く以前にUVを検出またはUVマーキングを利用する能力を知らなかった一夫多妻魚類の配偶者選択のためのUVキューの使用調査を概説します。この魚種の他のUV感受性ライブベアリング魚に近い系統発生的近接4を有しており、そのP.顕微証拠がありますこのようなP.などの他のモリーの種と一緒にlatipinna、 メキシカーナとP.フォルモサ 、共同の責任コーン（光受容細胞のクラスを持っていますUV波長5に対して最も敏感であるLORビジョン）。この性的二型種では、女性の選択肢は男性&#39;明るく着色された拡大フィン6-9の進化において大きな役割を果たしてきました。この方法論は、私たちは、UVは女性が男性の品質を評価することによって、追加の媒体があるかどうかを探索することができます。 P.のUVマークの検出及び測定latipinna光ファイバープローブを分光光度計を使用して、ここに詳述されています。さらに、受容女性モリーズは差動、UV-Aを含むフルスペクトルの光を透過する光学フィルタを通して見た男性に関連付けるかどうか（[UV +]; 320から700ナノメートル）と紫外線遮断フィルターを通して見た男性（[紫外線]; 400 - 700 nm）が議論されています。この方法は、UVと行動におけるその役割に関わるさまざまな質問への研究を可能にすること、魚や他の生物にUV感度と色のパターンを発見するための広範なアプリケーションを持っています。

<table><tbody><tr><td>Spectrophotometer, P1000</td><td>Ocean Optics</td><td></td><td>newer models are availabe</td></tr><tr><td>DT 1000 xenon UV light source</td><td>Ocean Optics</td><td></td><td>newer models are availabe</td></tr><tr><td>Ocean Optics Overture Software</td><td>Ocean Optics</td><td></td><td>newer software is available</td></tr><tr><td>R200-Angle-UV bifurcated fiber-optic probe (Guided Wave)</td><td>Ocean Optics</td><td></td><td>newer models are availabe</td></tr><tr><td>Certified reflectance standard, white</td><td>labsphere</td><td></td><td></td></tr><tr><td>75.7 L Aquarium, divided</td><td>Experimental Builder</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Full Spectrum Bulb</td><td>Nature&#039;s Sunlight</td><td></td><td></td></tr><tr><td>UV blocking sheet</td><td>GAM UV Sheet</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

assays to detect uv-reflecting structures and determine their importance in mate preference using the sailfin molly poecilia latipinna

多くの生物は、社会的相互作用の間に人間の感性を越え手がかりと信号を使用します。彼らの行動や生態を理解しようとしたときの生物は自分の世界を知覚する方法を考慮することが重要です。紫外スペクトル（UV; 300から400ナノメートル）への感度は、鳥類、魚類、爬虫類、両生類、さらに哺乳類の複数の属全体で発見されました。このプロトコルは、UV反射構造の存在と、これらの手がかりは、仲間の選択のコンテキスト内での社会的信号として使用されているかどうかを試験するための方法のための生物を検査するための技術が記載されています。分光光度計は、個人や男女間の反射強度の紫外線の反射率変動の存在を検出するために使用されます。この技術の例は、二分の配偶者選択のテストは、視覚的な外観フルスペクトルやブロックUV波長を透過いずれかのフィルタによって操作することができる異性の個人への性的受容個人を露出するに提示されています。このこのシステムは、女性が、男性ではないのSailFinモリーズ（Poecilia latipinna）は、その相手方の決定の一部としてUVマーキングを使用していた決意を可能にしました。研究のこれらのタイプは、UVを利用する生物の範囲の知識を拡大し、紫外線が生活の中で役割を果たしているかについての洞察を提供するのに役立ちます。

<html> 図1と図 2は、設定交配選好水族館、我々の実験のためのUV測定部位を示します。 P.決意に許さ測定紫外線反射率latipinnaは、これらの特性には個人差に加えて、特に自分の体（ 図3）の側面に沿って、UV特性を有しております。 UV形質が発見された後、テストはその女性ではなく男性、P.を明らかにしましたその交配決定にこれらの特性を使用しlatipinna（女性：15トン = 4.08、P = 0.001;男性：トン14 = 0.67、P = 0.517; 図4）。男女ともは、UV特性を有しているが、特性がメイトの好みの一環として、女性のみで使用されていることは、P。で、このような浅水や採餌などの他の社会的相互作用におけるこれらの形質の役割を示すことができることlatipinna。 1 &quot;&gt;：&quot; =キープtogether.within-ページFO」ontent <img alt="図2" src="/files/ftp_upload/54453/54453fig2.jpg" /> UV反射率を測定したPoeciliaのlatipinna上図2.場所が。領域は、最初は全体のほぼすべてのボディ領域から採取された反射サンプルを用いた予備反射率試験から決定しました。 1から3、DF（背びれ）とCF（尾びれ）、図3に示したボディ領域を参照してください。この図はパーマーとHankison（2015）10から変更されている。 <a href="https://ecsource-jove-com.bdigitaluss.remotexs.co/files/ftp_upload/54453/54453fig2large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a> <img alt="図3" src="/files/ftp_upload/54453/54453fig3.jpg" /> 図3.男性の平均スペクトルと女性Poeciliaはlatipinna。グラフは、平均秒を表示しますpectral反射率が5箇所（サイドエリア、尾びれ、背びれ）SEで測定しました。ボックス内の領域は、UVスペクトルにおける反射率を表しています。この図は、パーマーとHankison（2015）10から変更されている。 <a href="https://ecsource-jove-com.bdigitaluss.remotexs.co/files/ftp_upload/54453/54453fig3large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a> <img alt="図4" src="/files/ftp_upload/54453/54453fig4.jpg" /> 男性と女性の図4.平均准タイムズ。グラフは、女性と男性は対照及び実験試験中のUV +と紫外線フィルターを通して見た男性の区画の近くに費やした平均時間SEを示します。この図は、パーマーとHankison（2015）10から変更されている。 <a href="https://ecsource-jove-com.bdigitaluss.remotexs.co/files/ftp_upload/54453/54453fig4large.jpg" target="_blank">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。</a>

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Assays to Detect UV-reflecting Structures and Determine their Importance in Mate Preference using the Sailfin Molly Poecilia latipinna

このプロトコルは、（この例では、のSailFinモリーPoecilia latipinna）生物に紫外線反射構造を検出するための分光光度計の使用を概説し、推論が配偶者選択中の紫外線手がかりの役割に行うことを可能にする魚用の二分の選択テストを説明しています。

UV反射構造を検出してのSailFinモリーを使用して、メイト優先でその重要性を決定するためのアッセイ<em&gt; Poecilia latipinna</em

Many organisms use cues and signals beyond human sensitivity during social interactions. It is important to take into account how organisms perceive their ...

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Assays to Detect UV-reflecting Structures and Determine their Importance in Mate Preference using the Sailfin Molly Poecilia latipinna

6.5K ビュー.  Ohio Wesleyan University. このプロトコルは、（この例では、のSailFinモリーPoecilia latipinna）生物に紫外線反射構造を検出するための分光光度計の使用を概説し、推論が配偶者選択中の紫外線手がかりの役割に行うことを可能にする魚用の二分の選択テストを説明しています。 

ビデオ: Assays to Detect UV-reflecting Structures and Determine their Importance in Mate Preference using the Sailfin Molly Poecilia latipinna

Multimodal Optical Microscopy Methods Reveal Polyp Tissue Morphology and Structure in Caribbean Reef Building Corals

An integrated suite of imaging techniques has been applied to determine the three-dimensional (3D) morphology and cellular structure of polyp tissues comprising the Caribbean reef building corals Montastraeaannularis and M. faveolata. These approaches include fluorescence microscopy (FM), serial block face imaging (SBFI), and two-photon confocal laser scanning microscopy (TPLSM). SBFI provides deep tissue imaging after physical sectioning; it details the tissue surface texture and 3D visualization to tissue depths of more than 2 mm. Complementary FM and TPLSM yield ultra-high resolution images of tissue cellular structure. Results have: (1) identified previously unreported lobate tissue morphologies on the outer wall of individual coral polyps&#160;and (2) created the first surface maps of the 3D distribution and tissue density of chromatophores and algae-like dinoflagellate zooxanthellae endosymbionts. Spectral absorption peaks of 500 nm and 675 nm, respectively, suggest that M. annularis and M. faveolata contain similar types of chlorophyll and chromatophores. However, M. annularis and M. faveolata exhibit significant differences in the tissue density and 3D distribution of these key cellular components. This study focusing on imaging methods indicates that SBFI is extremely useful for analysis of large mm-scale samples of decalcified coral tissues. Complimentary FM and TPLSM reveal subtle submillimeter&#160;scale changes in cellular distribution and density in nondecalcified coral tissue samples. The TPLSM technique affords: (1) minimally invasive sample preparation,&#160;(2) superior optical sectioning ability,&#160;and (3) minimal light absorption and scattering, while still permitting deep tissue imaging.

An integrated suite of imaging techniques has been applied to determine polyp morphology and tissue structure in the Caribbean corals Montastraeaannularis and M. faveolata. Fluorescence, serial block face,&#160;and two-photon confocal laser scanning microscopy have identified lobate structure, polyp walls, and estimated chromatophore and zooxanthellae densities and distributions.

マルチモーダル光学顕微鏡法カリビアン·リーフビルサンゴにポリープの組織形態と構造を明らかに

An integrated suite of imaging techniques has been applied to determine the three-dimensional (3D) morphology and cellular structure of polyp tissues ...

環境学

Individual Culturing of Tigriopus Copepods and Quantitative Analysis of Their Mate-guarding Behavior

Copepods of the genus Tigriopus, which are common zooplankton in rocky tide pools, show precopulatory mate-guarding behavior where a male clasps a potential mate to form a pair. While this phenomenon has attracted interest of researchers, methods for its analysis have not been well described. Here we describe procedures for: 1) individual culturing and staging of Tigriopus juveniles and adults, and 2) video-based analysis of their mate-guarding behavior. The culturing method enables experimental control of paring experience of animals as well as the ability to track their development before behavioral tests. The analysis method allows quantitative evaluation of several aspects of the mate-guarding behavior, including capturing attempts by males and swimming trajectory of mate-guarding pairs. Although these methods were originally established for ethological studies on Tigriopus, with proper modifications they can also be applied to studies of other zooplankton in different research fields, such as physiology, toxicology, and ecological genetics.

Individual Culturing of Tigriopus Copepods and Quantitative Analysis of Their Mate-guarding Behavior

Mate-guarding behavior plays an important role in reproduction of intertidal copepods of the genus Tigriopus. However, methods for studying this behavior have not been well described. Here we describe methods for: 1) individual culture of virgin Tigriopus animals, and 2) quantitative analysis of their mate-guarding behavior.

Tigriopusカイアシ類と仲間を守る行動の定量分析の個別培養

Copepods of the genus Tigriopus, which are common zooplankton in rocky tide pools, show precopulatory mate-guarding behavior where a male clasps a ...

Using the FishSim Animation Toolchain to Investigate Fish Behavior: A Case Study on Mate-Choice Copying In Sailfin Mollies

Over the last decade, employing computer animations for animal behavior research has increased due to its ability to non-invasively manipulate the appearance and behavior of visual stimuli, compared to manipulating live animals. Here, we present the FishSim Animation Toolchain, a software framework developed to provide researchers with an easy-to-use method for implementing 3D computer animations in behavioral experiments with fish. The toolchain offers templates to create virtual 3D stimuli of five different fish species. Stimuli are customizable in both appearance and size, based on photographs taken of live fish. Multiple stimuli can be animated by recording swimming paths in a virtual environment using a video game controller. To increase standardization of the simulated behavior, the prerecorded swimming path may be replayed with different stimuli. Multiple animations can later be organized into playlists and presented on monitors during experiments with live fish.
In a case study with sailfin mollies (Poecilia latipinna), we provide a protocol on how to conduct a mate-choice copying experiment with FishSim. We utilized this method to create and animate virtual males and virtual model females, and then presented these to live focal females in a binary choice experiment. Our results demonstrate that computer animation may be used to simulate virtual fish in a mate-choice copying experiment to investigate the role of female gravid spots as an indication of quality for a model female in mate-choice copying.
Applying this method is not limited to mate-choice copying experiments but can be used in various experimental designs. Still, its usability depends on the visual capabilities of the study species and first needs validation. Overall, computer animations offer a high degree of control and standardization in experiments and bear the potential to &#39;reduce&#39; and &#39;replace&#39; live stimulus animals as well as to &#39;refine&#39; experimental procedures.

Using the FishSim Animation Toolchain to Investigate Fish Behavior: A Case Study on Mate-Choice Copying In Sailfin Mollies

Using the novel FishSim Animation Toolchain, we present a protocol for non-invasive visual manipulation of public information in the context of mate-choice copying in sailfin mollies. FishSim Animation Toolchain provides an easy-to-use framework for the design, animation and presentation of computer-animated fish stimuli for behavioral experiments with live test fish.

FishSimアニメーション ツールを使用して、魚の行動を調査する: 配偶者選択コピー八角 Mollies に関する事例

Over the last decade, employing computer animations for animal behavior research has increased due to its ability to non-invasively manipulate the ...

行動学

Behavioral Tracking and Neuromast Imaging of Mexican Cavefish

Cave-dwelling animals have evolved a series of morphological and behavioral traits to adapt to their perpetually dark and food-sparse environments. Among these traits, foraging behavior is one of the useful windows into functional advantages of behavioral trait evolution. Presented herein are updated methods for analyzing vibration attraction behavior (VAB: an adaptive foraging behavior) and imaging of associated mechanosensors of cave-adapted tetra, Astyanax mexicanus. In addition, methods are presented for high-throughput tracking of a series of additional cavefish behaviors including hyperactivity and sleep-loss. Cavefish also show asociality, repetitive behavior and higher anxiety. Therefore, cavefish serve as an animal model for evolved behaviors. These methods use free-software and custom-made scripts that can be applied to other types of behavior. These methods provide practical and cost-effective alternatives to commercially available tracking software.

Here, we present methods for high-throughput study of a series of the Mexican cavefish behaviors and vital staining of a mechanosensory system. These methods use free-software and custom-made scripts, providing a practical and cost-effective method for the studies of behaviors.

行動追跡とメキシコの血脈の Neuromast イメージング

Cave-dwelling animals have evolved a series of morphological and behavioral traits to adapt to their perpetually dark and food-sparse environments. Among ...

Fluorimetric Techniques for the Assessment of Sperm Membranes

Standard spermiograms describing sperm quality are mostly based on the physiological and visual parameters, such as ejaculate volume and concentration, motility and progressive motility, and sperm morphology and viability. However, none of these assessments is good enough to predict the semen quality. Given that maintenance of sperm viability and fertilization potential depends on membrane integrity and intracellular functionality, evaluation of these parameters might enable a better prediction of sperm fertilization competence. Here, we describe three feasible methods to evaluate sperm quality using specific fluorescent probes combined with fluorescence microscopy or flow cytometry analyses. Analyses assessed plasma membrane integrity using 4&#39;,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) and propidium iodide (PI), acrosomal membrane integrity using fluorescein isothiocyanate-conjugated Pisum sativum agglutinin (FITC-PSA) and mitochondrial membrane integrity using 5,5&#39;,6,6&#39;-tetra-chloro-1,1&#39;,3,3&#39;-tetraethylbenzimidazolyl carbocyanine iodide (JC-1). Combinations of these methods are also presented. For instance, use of annexin V combined with PI fluorochromes enables assessing apoptosis and calculating the proportion of apoptotic sperm (apoptotic index). We believe that these methodologies, which are based on examining spermatozoon membranes, are very useful for the evaluation of sperm quality.

Here, we present methodologies to evaluate spermatozoan membrane integrity, a cellular feature associated with sperm fertilization competence. We describe three techniques for the fluorimetric assessment of sperm membranes: simultaneous staining with specific fluorescent probes, fluorescence microscopy, and advanced sperm-dedicated flow cytometry. Examples of combining the methodologies are also presented.

蛍光光度法による精子膜評価技術

Standard spermiograms describing sperm quality are mostly based on the physiological and visual parameters, such as ejaculate volume and concentration, ...

発生生物学

A Simple Behavioral Assay for Testing Visual Function in Xenopus laevis

Measurement of the visual function in the tadpoles of the frog, Xenopus laevis, allows screening for blindness in live animals. The optokinetic response is a vision-based, reflexive behavior that has been observed in all vertebrates tested. Tadpole eyes are small so the tail flip response was used as alternative measure, which requires a trained technician to record the subtle response. We developed an alternative behavior assay based on the fact that tadpoles prefer to swim on the white side of a tank when placed in a tank with both black and white sides. The assay presented here is an inexpensive, simple alternative that creates a response that is easily measured. The setup consists of a tripod, webcam and nested testing tanks, readily available in most Xenopus laboratories. This article includes a movie showing the behavior of tadpoles, before and after severing the optic nerve. In order to test the function of one eye, we also include representative results of a tadpole in which each eye underwent retinal axotomy on consecutive days. Future studies could develop an automated version of this assay for testing the vision of many tadpoles at once.

A Simple Behavioral Assay for Testing Visual Function in Xenopus laevis

Xenopus laevis tadpoles prefer swimming on the white side of a black/white tank. This behavior is guided by their vision. Based on this behavior, we present a simple assay to test the visual function of tadpoles.

テスト視機能のための簡単​​な行動アッセイ<em&gt;アフリカツメガエル</em

Measurement of the visual function in the tadpoles of the frog, Xenopus laevis, allows screening for blindness in live animals. The optokinetic response ...

神経科学

Swimming Performance Assessment in Fishes

Swimming performance tests of fish have been integral to studies of muscle energetics, swimming mechanics, gas exchange, cardiac physiology, disease, pollution, hypoxia and temperature. This paper describes a flexible protocol to assess fish swimming performance using equipment in which water velocity can be controlled. The protocol involves one to several stepped increases in flow speed that are intended to cause fish to fatigue. Step speeds and their duration can be set to capture swimming abilities of different physiological and ecological relevance. Most frequently step size is set to determine critical swimming velocity (Ucrit), which is intended to capture maximum sustained swimming ability. Traditionally this test has consisted of approximately ten steps each of 20 min duration. However, steps of shorter duration (e.g. 1 min) are increasingly being utilized to capture acceleration ability or burst swimming performance. Regardless of step size, swimming tests can be repeated over time to gauge individual variation and recovery ability. Endpoints related to swimming such as measures of metabolic rate, fin use, ventilation rate, and of behavior, such as the distance between schooling fish, are often included before, during and after swimming tests. Given the diversity of fish species, the number of unexplored research questions, and the importance of many species to global ecology and economic health, studies of fish swimming performance will remain popular and invaluable for the foreseeable future.

The lives of the majority of fish are predicated on swimming. This protocol describes techniques for capturing a range of swimming modes available to individual and schooling fish, and includes metrics associated with swimming physiology and behaviour.

魚類の遊泳性能評価

Swimming performance tests of fish have been integral to studies of muscle energetics, swimming mechanics, gas exchange, cardiac physiology, disease, ...

生物学

Visualization of Caenorhabditis elegans Cuticular Structures Using the Lipophilic Vital Dye DiI

The cuticle of C. elegans is a highly resistant structure that surrounds the exterior of the animal1-4. The cuticle not only protects the animal from the environment, but also determines body shape and plays a role in motility4-6. Several layers secreted by epidermal cells comprise the cuticle, including an outermost lipid layer7.
Circumferential ridges in the cuticle called annuli pattern the length of the animal and are present during all stages of development8. Alae are longitudinal ridges that are present during specific stages of development, including L1, dauer, and adult stages2,9. Mutations in genes that affect cuticular collagen organization can alter cuticular structure and animal body morphology5,6,10,11. While cuticular imaging using compound microscopy with DIC optics is possible, current methods that highlight cuticular structures include fluorescent transgene expression12, antibody staining13, and electron microscopy1. Labeled wheat germ agglutinin (WGA) has also been used to visualize cuticular glycoproteins, but is limited in resolving finer cuticular structures14. Staining of cuticular surface using fluorescent dye has been observed, but never characterized in detail15. We present a method to visualize cuticle in live C. elegans using the red fluorescent lipophilic dye DiI (1,1'-dioctadecyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanine perchlorate), which is commonly used in C. elegans to visualize environmentally exposed neurons. This optimized protocol for DiI staining is a simple, robust method for high resolution fluorescent visualization of annuli, alae, vulva, male tail, and hermaphrodite tail spike in C. elegans.

Visualization of Caenorhabditis elegans Cuticular Structures Using the Lipophilic Vital Dye DiI

We present a method to visualize cuticle in live C. elegans using the red fluorescent lipophilic dye DiI (1,1'-dioctadecyl-3,3,3',3'-tetramethylindocarbocyanine perchlorate), which is commonly used in C. elegans to visualize environmentally exposed neurons. With this optimized protocol, alae and annular cuticular structures are stained by DiI and observed using compound microscopy.

の可視化線虫（Caenorhabditis elegans）</em親油性生体染色色素、DIIを使用する>キューティクルの構造

The cuticle of C. elegans is a highly resistant structure that surrounds the exterior of the animal1-4. The cuticle not only protects the animal from the ...

Analysis of Skeletal Muscle Defects in Larval Zebrafish by Birefringence and Touch-evoke Escape Response Assays

Zebrafish (Danio rerio) have become a particularly effective tool for modeling human diseases affecting skeletal muscle, including muscular dystrophies1-3, congenital myopathies4,5, and disruptions in sarcomeric assembly6,7, due to high genomic and structural conservation with mammals8. Muscular disorganization and locomotive impairment can be quickly assessed in the zebrafish over the first few days post-fertilization. Two assays to help characterize skeletal muscle defects in zebrafish are birefringence (structural) and touch-evoked escape response (behavioral).
Birefringence is a physical property in which light is rotated as it passes through ordered matter, such as the pseudo-crystalline array of muscle sarcomeres9. It is a simple, noninvasive approach to assess muscle integrity in translucent zebrafish larvae early in development. Wild-type zebrafish with highly organized skeletal muscle appear very bright amidst a dark background when visualized between two polarized light filters, whereas muscle mutants have birefringence patterns specific to the primary muscular disorder they model. Zebrafish modeling muscular dystrophies, diseases characterized by myofiber degeneration followed by repeated rounds of regeneration, exhibit degenerative dark patches in skeletal muscle under polarized light. Nondystrophic myopathies are not associated with necrosis or regenerative changes, but result in disorganized myofibers and skeletal muscle weakness. Myopathic zebrafish typically show an overall reduction in birefringence, reflecting the disorganization of sarcomeres.
The touch-evoked escape assay involves observing an embryo&#39;s swimming behavior in response to tactile stimulation10-12. In comparison to wild-type larvae, mutant larvae frequently display a weak escape contraction, followed by slow swimming or other type of impaired motion that fails to propel the larvae more than a short distance12. The advantage of these assays is that disease progression in the same fish type can be monitored in vivo for several days, and that large numbers of fish can be analyzed in a short time relative to higher vertebrates.

The zebrafish is now an established and powerful tool for modeling muscular dystrophies, congenital myopathies, and related neuromuscular diseases. Birefringence and touch-evoked escape behavior are two common noninvasive assays used to determine the degree of muscular disorganization and locomotive impairment of zebrafish embryos during early development.

複屈折およびタッチ呼び起こすエスケープ応答アッセイによる幼虫のゼブラフィッシュ骨格筋の欠陥の分析

Zebrafish (Danio rerio) have become a particularly effective tool for modeling human diseases affecting skeletal muscle, including muscular ...

Optimized Griess Reaction for UV-Vis and Naked-eye Determination of Anti-malarial Primaquine

Primaquine (PMQ), an important anti-malarial drug, has been recommended by the World Health Organization (WHO) for the treatment of life-threatening infections caused by P. vivax and ovale. However, PMQ has unwanted adverse effects that lead&#160;to acute hemolysis in patients with glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) deficiency. There is a need to develop simple and reliable methods for PMQ determination with the purpose of dosage monitoring. In early 2019, we have reported an UV-Vis and naked-eye based approach for PMQ colorimetric quantification. The detection was based on a Griess-like reaction between PMQ and anilines, which can generate colored azo products. The detection limit for direct measurement of PMQ in synthetic urine is in the nanomolar range. Moreover, this method has shown great potential for PMQ quantification from human serum samples at clinically relevant concentrations. In this protocol, we will describe the technical details regarding the syntheses and characterization of colored azo products, the reagent preparation, and the procedures for PMQ determination.

This protocol describes a novel colorimetric method for antimalarial primaquine (PMQ) detection in synthetic urines and human serums.

UV-Visに対する最適化されたグリース反応と抗マラリアプリマキンの肉眼判定

Primaquine (PMQ), an important anti-malarial drug, has been recommended by the World Health Organization (WHO) for the treatment of life-threatening ...

UV反射構造を検出してのSailFinモリーを使用して、メイト優先でその重要性を決定するためのアッセイ

要約

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マルチモーダル光学顕微鏡法カリビアン·リーフビルサンゴにポリープの組織形態と構造を明らかに

Tigriopusカイアシ類と仲間を守る行動の定量分析の個別培養

FishSimアニメーションツールを使用して、魚の行動を調査する: 配偶者選択コピー八角 Mollies に関する事例

行動追跡とメキシコの血脈の Neuromast イメージング

蛍光光度法による精子膜評価技術

テスト視機能のための簡単な行動アッセイ

魚類の遊泳性能評価

の可視化線虫（Caenorhabditis elegans）キューティクルの構造

複屈折およびタッチ呼び起こすエスケープ応答アッセイによる幼虫のゼブラフィッシュ骨格筋の欠陥の分析

UV-Visに対する最適化されたグリース反応と抗マラリアプリマキンの肉眼判定

UV反射構造を検出してのSailFinモリーを使用して、メイト優先でその重要性を決定するためのアッセイ

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Tigriopusカイアシ類と仲間を守る行動の定量分析の個別培養

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行動追跡とメキシコの血脈の Neuromast イメージング

蛍光光度法による精子膜評価技術

テスト視機能のための簡単​​な行動アッセイ

魚類の遊泳性能評価

の可視化線虫（Caenorhabditis elegans）キューティクルの構造

複屈折およびタッチ呼び起こすエスケープ応答アッセイによる幼虫のゼブラフィッシュ骨格筋の欠陥の分析

UV-Visに対する最適化されたグリース反応と抗マラリアプリマキンの肉眼判定

FishSimアニメーションツールを使用して、魚の行動を調査する: 配偶者選択コピー八角 Mollies に関する事例

テスト視機能のための簡単な行動アッセイ