Mesure de la longueur de la queue Poly A à partir du cerveau et de la lignée cellulaire des larves de drosophile

La polyadénylation est une modification post-transcription. Cela ajoute des queues poly-A à l’extrémité trois primes des molécules d’ARNm. La dérégulation de la polyadénylation a été associée à une expression génique anormale et à diverses maladies, y compris des troubles neurologiques.

Notre méthode fournit une analyse rentable et haute résolution pour mesurer les longueurs poly-A. Les méthodes à haut débit pour l’analyse de queue poly-A, comme le séquençage de nouvelle génération, et un séquençage à haut débit fournissent des informations à haut contenu. Cependant, l’analyse de transcrits rares peut être extrêmement difficile avec ces méthodes.

Les méthodes basées sur la PCR sont généralement à faible débit. Cependant, ils peuvent être facilement utilisés pour analyser un petit nombre de transcriptions. La méthode GI-tailing est l’une d’entre elles.

Avec cette méthode, nous avons découvert que les ARNm de Dscam contiennent de courtes queues poly-A. Dscam est une molécule d’adhésion cellulaire neuronale. Il est impliqué dans de nombreux processus neurodéveloppementaux importants.

Parce que l’ARNm Dscam contient de courtes queues poly-A contrairement à la plupart des ARNm, la traduction de l’ARNm Dscam est soumise à une régulation génétique unique, ce qui est l’une des questions auxquelles nous essayons de répondre.