Name: targeting neuronal fiber tracts for deep brain stimulation therapy using interactive, patient-specific models
Uploaded: 2018-08-12T12:30:00.000+00:00
Duration: 14 min 14 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Targeting Neuronal Fiber Tracts for Deep Brain Stimulation Therapy Using Interactive, Patient-Specific Models at JoVE.com

이 프로젝트는 여는 국립 연구소의 건강 보조금 UH3, NS095554를 지원 했다. 기술 지원과 과학 컴퓨팅 및 이미징 연구소에 통합 생물 의학 컴퓨팅을 위한 센터에 의해 제공 된 가능한 부분에 의해 만들어진 소프트웨어 개발에서 NIH P41-GM103545, 센터의 통합 생물 의학 컴퓨팅.
감사를 통해 원고 준비 Lexie 바닥과 과학적 컴퓨팅 및 생산 및 제출, 비디오 편집을 위한 영상 연구소에서 네이 선 Galli을 또한 테레사 Lins 확장 됩니다.

1. 이미지 처리
<ol><li>T1 MRI 세분화<ol>
<li>다운로드 및 설치 FreeSurfer17. 그것은 가정 T1 MRI 획득은 DICOM 또는 NIFTI 형식입니다.</li>
		<li>환자 디렉터리를 만들고 FreeSurfer에서 그들의 T1 볼륨을 추가 하려면 다음 명령을 입력: 정찰-모든 s patientName-i /Full/Path/To/nii
</li>
		<li>명령을 입력 하 고 다음 FreeSurfer의 실행을 자동화 세분화: 정찰-모든 s patientName-모든
</li>
		<li>Mri_convert 를 사용 하 여 "aseg.auto.mgz" FreeSurfer의 독자적인.mgz 형식으로 변환.</li>
	</ol>
</li>
	<li>보급이 중 영상 (뒤)<ol>
<li>다운로드 및 설치 기계18. 그것은 가정 뒤 수집 수행 된 DICOM 파일의 스택을 사용할 수 있습니다. 참고:이 재건을 수행 하는 좋은 명령 라인 도구는 FMRIB 소프트웨어 라이브러리 (FSL)19. FSL 에코 평면, 수행 하기 위해이 프로토콜에 사용 된 모션, 및 재건 이전 에디 전류 왜곡 보정. 이 분석에 사용 되는 뒤 데이터 41 다른 보급 sensitizing 그라데이션 방향 위한 DICOM 파일의 시리즈 이다.</li>
		<li>슬라이서의 DWIConverter 모듈을 사용 하 여 단일 볼륨으로 41 별도 인수를 재구성. 뒤 데이터는 입력 Dicom 데이터 디렉터리 를 지정 합니다. DicomToNrrd 라디오 단추를 선택 하 고 출력 뒤 볼륨의 이름을 제공 합니다.</li>
		<li>DTI 추정에서 배경 잡음을 제거 하기 위해 보급 중 볼륨이 마스킹 모듈과 텐서 마스크를 만듭니다. 0.5의 기본 임계값 매개 변수를 두십시오.</li>
		<li>확산 텐서 마스크으로 이전 단계에서 만든 마스크를 사용 하 여 DTI 의견에 뒤 와 확산 텐서 (DTI)을이 단일 뒤 볼륨을 변환 합니다. 최소 자승법을 추정 매개 변수를 설정 하 고 시프트 부정적인 고유 옵션이 선택 되어 있는지 확인 하십시오.</li>
		<li>NRRD 형식에서 새로 만든된 DTI 볼륨을 저장 합니다.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. 유한 요소 모델 생성
<ol><li>SCIRun<ol>
<li>다운로드 및 설치 SCIRun 버전 5 (http://www.sci.utah.edu/software/scirun.html). SCIRun는 모델링, 시뮬레이션 및 시각화의 과학적 문제에 대 한 문제 해결 환경입니다. 이것은 전산 작업 대 만들고, 해결,이 프로젝트에서 개발 된 모델과 상호 작용 하는 데 사용입니다. 참고: SCIRun 네트워크 특정 작업을 수행 하는 개별 모듈의 시퀀스를 연결 하 여 만들어집니다. 더 복잡 한 처리 및 시뮬레이션 허용 간단한 모듈의 네트워크를 통해 데이터를 전달 합니다.</li>
	</ol>
</li>
	<li>전극 형상 건물 참고:이 프로젝트에서 모델링 전극 Medtronic 3387 DBS 리드20입니다. 그것은 4 개의 연락처 높이 1.5 m m, 직경에서 1.27 m m 간격된 1.5 m m 간격으로 원통형 리드입니다. 비 전도성 물질 4 개의 연락처를 분리합니다.<ol>
<li>나열 된 크기를 일치 하는 DBS 리드에 각 구성 요소에 대 한 닫힌된 표면 메쉬를 만듭니다. 두 개의 기본 형상, 실린더 및 구체를 사용 하 여 전체 지도 만듭니다. 참고: 납 형상 3D 모델링 프로그램의 다양 한에서 만들 수 있습니다.</li>
		<li>0.5 m m 두꺼운 전체 지도 둘러싼 캡슐화 레이어의 표면 메시를 만듭니다.</li>
	</ol>
</li>
	<li>전체 두뇌 메쉬 만들기<ol>
<li>로드는 FEM.의 외부 경계 역할을 파트 1에서 만든 뇌 표면</li>
		<li>DBS 이어질 전극 주위 메쉬 밀도 제어를 둘러싼 두 개의 동심 상자 표면을 작성 합니다. 참고:는 DBS 리드 및 상자 표면 근원에 있는 전극 샤프트의 하단 끝을 가진 긍정적인 z 축을 따라 정렬 한다. 이것은 나중에 회전 및 전극의 번역에 대 한 중요입니다.</li>
		<li>메시의 각 개별 지역에 위치한 단일 포인트 점 구름을 만듭니다. 메시의 영역은: 샤프트 세그먼트, 4 연락처, 상자, 및 뇌 표면. 이 지점에 연결 된 값에 그 지역에 대 한 메쉬 각 사면체 요소에 대 한 최대 볼륨 제약 조건을 나타냅니다. 이러한 제약 조건은 메쉬 밀도 전극 안팎을 제어 하도록 조정 됩니다.</li>
		<li>"InterfaceWithTetGen" 모듈을 사용 하 여 전체 뇌 메쉬 작성. 입력된 포트를 다음과 같이 설정: (1.1)에서 포트 1: 뇌 표면 포트 2: 지역 특성 포인트 클라우드, (2.3.3)에서 볼륨 제약 포트 3: 없음 (2.2)에서 포트 4: 전극 모델 표면</li>
	</ol>
</li>
	<li>인터랙티브 전극 배치 참고:이 단계의 목표를 어디 두뇌 내부 전극의 쉬운 운동을 활성화 하 여 자동으로 새로운 메쉬 및 시뮬레이션 업데이트 시스템입니다.<ol>
<li>두 개의 계단식 CreateGeometricTransform 모듈을 사용 하 여 전극 X 및 Y 평면에서 회전. 회전 에 클릭 하 고 축 Y 와 두 번째 축x 1.00 1.00 첫 번째 모듈을 설정 합니다. 회전 각도 아래쪽 슬라이더, 세타 회전 (도)로 설정 됩니다.</li>
		<li>모든 변환 변환 하는 개체에 대 한 TransformMeshWithTransform 모듈을 연결 합니다.</li>
		<li>GenerateSinglePointProbeFromField 모듈을 만들고 ViewScene 모듈의 형상을 포트에 연결 합니다. Shift 키를 누른 채 ViewScene 창에서 주변 영역을 이동 합니다. 포인트 프로브 모듈 출시에 따라 영역의 위치를 업데이트합니다. 참고:이 위치는 번역 변환 전극 형상에 적용 결정 하기 위해 사용 됩니다.</li>
		<li>TransformMeshWithTransform 모듈을 사용 하 여 포인트 프로브 위치와 전극 기하학의 각 부분을 번역.</li>
		<li>두 개의 회전 변환 및 변환 하는 포인트 프로브 위젯의 뇌 표면 제외 하 고 모든 개체에 적용 합니다. 참고: 이러한 변환의 모든 3 InterfaceWithTetGen 모듈에 파이프를 새로운 위치 및 방향에서 두뇌의 내부 전극 형상 메쉬 메시 알고리즘 알고 하기 전에 각 개체에 대해 수행 되어야 합니다. 전극은 뇌 내에서 이동 하는 때마다 새 메쉬 건설 된다.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. 생체 필드 계산
<ol><li>전도도 매개 변수 설정<ol>
<li>1 단계에서에서 만든 DTI 볼륨을 로드 하 고 InterfaceWithTetGen MapFieldDataFromSourceToDestination linear('weighted') 옵션 사용 하 여 2 단계에서에서 만든에서 사면체 메시 출력에 데이터를 설정 합니다. 참고: 모든 이방성 전도성 추정이이 단계에서 구현할 수 있습니다.</li>
		<li>1e-6와 CalculateFieldData를 사용 하 여 연락처 영역 1e6 샤프트 지역 전도도 설정 합니다. 전도도 값 모두 설정 되 면 BuildFEMatrix으로 필드 파이프.</li>
	</ol>
</li>
	<li>전류/전압 소스 및 경계 조건 설정<ol>
<li>파이프 뇌 표면 SetFieldDataToConstantValue 로 2 단계에서에서 메시 프로세스에 사용 되 고 값을 0으로 설정. 이것은 전체 뇌 표면에 전압 싱크를 만듭니다. 그런 다음 InsertVoltageSource 을 사용 하 여 InterfaceWithTetGen에서 사면체 메시 출력 전압 값을 배치.</li>
		<li>Monopolar 자극에 대 한 연락처 표면 중 하나에 ReportFieldInfo 모듈에서 FieldCenter 값을 계산 하 여 단일 지점 연락처 위치 중 한 곳의 센터에서 만듭니다. -1 볼트이 시점에서 필드 데이터를 설정 합니다. 그런 다음 InsertVoltageSource 를 사용 하 여 사면체 메시에서 포인트 소스를. 참고: 있습니다 이제 사면체 메시의 복사본 두 개가. 전압 값이 뇌 표면에 연락처를 내부 포인트 소스 하나 설정 하나.</li>
		<li>두 개의 InsertVoltageSource 모듈의 출력을 가입 하 고 BuildFEMatrix의 출력 ApplyFEMVoltageSource 로 출력을 파이프.</li>
	</ol>
</li>
	<li>앞으로 문제 해결 참고: ApplyFEMVoltageSource 의 출력 포트 1에서 강성 매트릭스와 포트 2에 오른쪽 매트릭스를 제공합니다. 이들은 시스템 방정식을 해결 하는 데 필요한 두 개의 구성 요소가 있습니다.<ol>
<li>SolveLinearSystem에 ApplyFEMVoltageSource 의 두 개의 출력을 파이프. 켤레 그라데이션 해결 방법과 야코비는 preconditioner로 선택 합니다. 이 모듈의 출력 솔루션 매트릭스, 사면체 메시의 각 노드에 전압 값입니다.</li>
		<li>SetFieldData 를 사용 하 여 전압 분포의 3 차원 표현에 대 한 사면체 메시에 전압 솔루션 매트릭스를.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Isosurface 시각화<ol>
<li>ExtractSimpleIsosurface에 SetFieldData 의 결과 파이프 합니다. UI 수량 탭을 열고 10 등치값 균등 하 게 간격 수를 설정 합니다.</li>
		<li>ShowField 모듈을 사용 하 고는 Isosurfaces 축소는 최소 및 최대 전압 솔루션의 레인 보우 컬러 지도 함께 투명으로 표시 하려면 ViewScene 모듈에 연결 합니다.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
	<li>Benabid, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chronic+electrical+stimulation+of+the+ventralis+intermedius+nucleus+of+the+thalamus+as+a+treatment+of+movement+disorders.">Chronic electrical stimulation of the ventralis intermedius nucleus of the thalamus as a treatment of movement disorders.</a> Journal of Neurosurgery. 84 (2), 203-214 (1996).</li><li>Limousin, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+parkinsonian+signs+and+symptoms+of+bilateral+subthalamic+nucleus+stimulation.">Effect of parkinsonian signs and symptoms of bilateral subthalamic nucleus stimulation.</a> The Lancet. 345 (8942), 91-95 (1995).</li><li>Schiff, N. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavioural+improvements+with+thalamic+stimulation+after+severe+traumatic+brain+injury.">Behavioural improvements with thalamic stimulation after severe traumatic brain injury.</a> Nature. 448 (7153), 600-603 (2007).</li><li>Vandewalle, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stereotactic+treatment+of+Gilles+de+la+Tourette+syndrome+by+high+frequency+stimulation+of+thalamus.">Stereotactic treatment of Gilles de la Tourette syndrome by high frequency stimulation of thalamus.</a> Lancet. 353 (9154), 724 (1999).</li><li>Mayberg, H. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deep+brain+stimulation+for+treatment-resistant+depression.">Deep brain stimulation for treatment-resistant depression.</a> Neuron. 45 (5), 651-660 (2005).</li><li>Hashimoto, T., Elder, C. M., Okun, M. S., Patrick, S. K., Vitek, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stimulation+of+the+subthalamic+nucleus+changes+the+firing+pattern+of+pallidal+neurons.">Stimulation of the subthalamic nucleus changes the firing pattern of pallidal neurons.</a> Journal of Neuroscience. 23 (5), 1916-1923 (2003).</li><li>York, M. K., Wilde, E. A., Simpson, R., Jankovic, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Relationship+between+Neuropsychological+Outcome+and+DBS+Surgical+Trajectory+and+Electrode+Location.">Relationship between Neuropsychological Outcome and DBS Surgical Trajectory and Electrode Location.</a> J. Neurol. Sci. 287 (1-2), 159-171 (2009).</li><li>Machado, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deep+brain+stimulation+for+Parkinson's+disease:+surgical+technique+and+perioperative+management.">Deep brain stimulation for Parkinson's disease: surgical technique and perioperative management.</a> Movement Disorders. 21, S247-S258 (2006).</li><li>Volkmann, J., Moro, E., Pahwa, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Basic+algorithms+for+the+programming+of+deep+brain+stimulation+in+Parkinson's+disease.">Basic algorithms for the programming of deep brain stimulation in Parkinson's disease.</a> Movement Disorders. 21 (S14), S284-S289 (2006).</li><li>Contarino, M. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Directional+steering:+A+novel+approach+to+deep+brain+stimulation.">Directional steering: A novel approach to deep brain stimulation.</a> Neurology. 83 (13), 1163-1169 (2014).</li><li>Pollo, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Directional+deep+brain+stimulation:+An+intraoperative+double-blind+pilot+study.">Directional deep brain stimulation: An intraoperative double-blind pilot study.</a> Brain. 137 (7), 2015-2026 (2014).</li><li>Willsie, A. C., Dorval, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fabrication+and+initial+testing+of+the+&#181;DBS:+a+novel+deep+brain+stimulation+electrode+with+thousands+of+individually+controllable+contacts.">Fabrication and initial testing of the &#181;DBS: a novel deep brain stimulation electrode with thousands of individually controllable contacts.</a> Biomedical Microdevices. 17 (56), 9961 (2015).</li><li>Oliveria, S. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Safety+and+efficacy+of+dual-lead+thalamic+deep+brain+stimulation+for+patients+with+treatment-refractory+multiple+sclerosis+tremor:+a+single-centre,+randomised,+single-blind,+pilot+trial.">Safety and efficacy of dual-lead thalamic deep brain stimulation for patients with treatment-refractory multiple sclerosis tremor: a single-centre, randomised, single-blind, pilot trial.</a> The Lancet Neurology. 16 (9), 691-700 (2017).</li><li>Butson, C. R., Cooper, S. E., Henderson, J. M., Wolgamuth, B., Mcintyre, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probabilistic+Analysis+of+Activation+Volumes+Generated+During+Deep+Brain+Stimulation.">Probabilistic Analysis of Activation Volumes Generated During Deep Brain Stimulation.</a> Neuroimage. 54 (3), 2096-2104 (2011).</li><li>Basser, P. J., Mattiello, J., LeBihan, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MR+diffusion+tensor+spectroscopy+and+imaging.">MR diffusion tensor spectroscopy and imaging.</a> Biophys. J. 66 (1), 259-267 (1994).</li><li>Gullmar, D., Haueisen, J., Reichenbach, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+anisotropic+electrical+conductivity+in+white+matter+tissue+on+the+EEG/MEG+forward+and+inverse+solution.+A+high-resolution+whole+head+simulation+study.">Influence of anisotropic electrical conductivity in white matter tissue on the EEG/MEG forward and inverse solution. A high-resolution whole head simulation study.</a> NeuroImage. 51 (1), 145-163 (2010).</li><li>Fischl, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=FreeSurfer.">FreeSurfer.</a> Neuroimage. 62 (2), 774-781 (2012).</li><li>Fedorov, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=3D+Slicer+as+an+Image+Computing+Platform+for+the+Quantitative+Imaging+Network.">3D Slicer as an Image Computing Platform for the Quantitative Imaging Network.</a> Magn. Reson. Imaging. 30 (9), 1323-1341 (2012).</li><li>Jenkinson, M., Beckmann, C. F., Behrens, T. E., Woolrich, M. W., Smith, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=FSL.">FSL.</a> Neuroimage. 62 (2), 782-790 (2012).</li><li>. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Medtronic DBS 3387/3389 Lead Kit Manual. , (2018).</li><li>Baker, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Robust+modulation+of+arousal+regulation,+performance+and+frontostriatal+activity+through+central+thalamic+deep+brain+stimulation+in+healthy+non-human+primates.">Robust modulation of arousal regulation, performance and frontostriatal activity through central thalamic deep brain stimulation in healthy non-human primates.</a> Journal of Neurophysiology. 116 (5), 2383-2404 (2016).</li><li>Fregni, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Treatment+of+major+depression+with+transcranial+direct+current+stimulation.">Treatment of major depression with transcranial direct current stimulation.</a> Bipolar Disorders. 8 (2), 203-204 (2006).</li><li>Hodaie, M., Wennberg, R. A., Dostrovsky, J. O., Lozano, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chronic+anterior+thalamus+stimulation+for+intractable+epilepsy.">Chronic anterior thalamus stimulation for intractable epilepsy.</a> Epilepsia. 43 (6), 603-608 (2002).</li><li>Rosenow, F., L&#252;ders, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Presurgical+evaluation+of+epilepsy.">Presurgical evaluation of epilepsy.</a> Brain. 124 (9), 1683-1700 (2001).</li></ol>

크리스토퍼 R. Butson, 박사 NeuroPace, 고급 공학, 보스턴 과학, Intelect 의료, 세인트 쥬 드 메디 칼, 및 기능 Neuromodulation 컨설턴트를 역임 했다.

이 프로토콜 시간 부담을 줄이기 위해 기술을 입증 했다 하며 그 정도에 환자 특정 모델 DBS에 대 한 건물의 계산 비용 시뮬레이션 결과의 실시간 피드백 근처 신속한 피드백의 매개 변수 변경 모델 결과 미치는 영향을 이해 하려면 큰 매개 변수 공간 탐험 수 있습니다. 이러한 매개 변수는 지도 위치, 활성 연락처의 진폭, 펄스 폭, 및 그 연락처에 자극 파형의 주파수를 포함합니다. 제안 된 도구의 주요 특징은: A 1) 간단한 사용자 인터페이스와 어떻게 이러한 매개 변수에 영향을 시뮬레이션, 그리고 2) 작은 일련의 입력에서 모델 생성의 자동화의 실시간 시각화 근처 모델 매개 변수를 조정: 뇌 표면 뇌 조직 전도도 tensors, 그리고 전극 형상의 표면 표현. 이 자동화 신속한 다른 뇌 구조와 조직 conductivities 뿐만 아니라, 기존 모델에 서로 다른 전극 디자인 삽입의 효과 평가 하는 많은 사람에 대 한 환자-특정 모델의 생성 합니다. 이 프로토콜에서 설명 하는 이미지 전처리 단계는 완전히 자동화 하 고 처리 시간 일 걸릴 수 있습니다. 그러나,이 단계에서 생성 된 데이터를 완료 정적, 의미는 시뮬레이션 중이 데이터는 수정 되지 않습니다 간주 됩니다. 모델 생성의 자동화 수동 노력 없이 환자 관련 FEM에이 데이터를 적용 하는 시스템의 기능에서 발생 합니다. 모든 모델 생성, 시뮬레이션, 시각화 단계를 수행 하는 SCIRun 네트워크만 한 번 만들어질 필요가 있다. 따라서,만 이미지 전처리 단계 들어오는 환자를 위해 환자 전용 모델을 생성 하기 위해 다시 수행 해야 합니다.
성능 향상 모델링 파이프라인에서 결과 생성에서 메쉬 생성, 생체 분야 계산 및 시각화 솔루션의 단일 소프트웨어 환경으로의 통합 때문 이다. 기존 모델링 기법으로 적응 메쉬 생성 높은 만드는 데 사용 된 메쉬 밀도 전극 주위 및 구축 하 고 있는 FEM.를 해결 하는 시간을 감소 시키는 전극에서 낮은 밀도 소프트웨어, SCIRun, 메쉬 생성 및 생체 필드 계산을 자동화를 해줍니다. 대화형 도구를 사용 하 여 전극의 이동 사용자 정의 업데이트 전극 위치는 새로운 메시의 건설을 트리거합니다. 경계 조건 및 새로운 전극 위치에 대 한 전도도 값 수정 포함 됩니다.
그것의 위치는 FEM.에 통합 하기 전에 전극 형상은 뇌 볼륨 내부 무료 이동 개체로 처리 됩니다. 메쉬 건설에 대 한이 접근의 핵심 의미는 여러 전극 모델에 쉽게 삽입할 수 있습니다. 예를 들어 전극 기하학의 두 번째 복사본 몇 밀리미터 멀리 둘 수 있다 그리고 모두는 FEM.에 포함 될 것입니다. 최근 연구에서 두 전극 가까이 다 발성 경화 증 떨림13 치료와 효과적인 자극 대상21탐험 비 인간 영장류 실험에 사용 된 이식 되어 있다. 여러 개의 전극을 사용 하 여의 이점은 더 큰 영역에는 조직에서 생성 된 전기 분야의 더 나은 제어를 제공 하려면입니다. 두 전극에 활성 연락처와 자극은 대상 지역으로 하 고 부정적인 부작용으로 이어질 것 이라고 하는 영역에서 현재 보낼 수 있습니다. 더 큰 영역에 자극의 미세한 제어 DBS의 신흥 치료 응용 프로그램의 많은 경우는 목표의 정확한 위치는 알 때 다른 자극 위치를 찾아보기도 유용 합니다. 그러나, 치료 자극을 달성 하기 위해 매개 변수를 결정 이미 큰 매개 변수 공간에서의 증가로 인해 단일 전극 보다 더 많은 도전 이다.
우리는이 인터랙티브 모델링 도구 DBS 이식 수술 계획 하는 동안 혜택을 제공할 수 그리 다. 뇌 조직에 자극의 정도 대 한 피드백 외과 대상 지역에 치료 자극을 제공 하기 위해 그들의 수술 계획에 전극 위치를 수정할 수 있습니다. DBS 치료 동안이 도구를 개발을 위한 주요 동기 부여 요소,이 문서에 소개 된 기법 다른 자극 또는 녹음 패러다임 어떤 FEM 생체 필드 모델에 적용할 수 있습니다. 달성 하기의 최적의 위치를 결정 DBS로 동일한 과제를 공유 하는 우울증22 또는23 간 질 치료에 대 한 깊이 전극의 사용에 대 한 transcranial 직류 자극 등 자극 요법 치료 결과입니다. Electrocorticography, 발작 발병 영역을 식별 하는 두뇌의 표면에 전극의 배열 녹음 기술 두뇌24에 대상 지역에서 전극 배치 위치를 결정 하는 도전이 하고있다. 이러한 응용 프로그램의 모든 어떻게 전류 뇌 조직을 통해 흐름의 불확실성을 다루는 동안 전극 위치에 따라 달라 집니다. 이 문서에 소개 된 기술을 생성 하 고 연구자와 임상 모델링 전문가 이러한 장치를 사용 하 여 의미 있는 피드백을 제공 하면서 전산 모델을 사용 하 여 부담을 줄일.

깊은 두뇌 자극 (DBS)은 진전1 ,2파 킨 슨 병 등 운동 장애에 대 한 설립된 치료 이다. 이 치료는 또한 외상 성 뇌 부상3, 증후군의4,5우울증 등 질환의 증가 대 한 잠재적인 치료로 조사 되 고 있다. DBS 시스템6지속적인 신경 활동 조절 하는 지역화 된 뇌 영역에 자극을 제공 하는 전극의 외과 이식을 해야 합니다. 전극 및 자극 매개 변수 위치 변조 치료 혜택을 제공 하는 신경 회로에 영향을 미칠. 위치에 있는 작은 변이 치료 창 치료 혜택은 달성된7,,89전에 불리 한 부작용의 가능성을 높일 가능성이 발생할 수 있습니다. 실제로, 그것은 종종 효과 자극 신경 활동에 있을 것 이다을 예측 하기 어려운 따라서, 치료 혜택의이 창 자극 장치 임상8,9프로그래밍 환자 여 환자 별로 식별 됩니다. 이 과정은 DBS 장치의 새로운 세대 사용할 수 있게 되 더 복잡 한 되. 예를 들어 소설 리드 디자인 더 많은 연락처10,,1112, 소개 되 고 하 고 어떤 경우에 여러 리드 근접 한 다른13에 이식 되 고 있습니다. 따라서, 탐구 하 고 크고 성장 매개 변수 공간에서 DBS의 효과 예측할 수 있을 필요가 있다.
전산 모델링 및 분석 환자 특정 기준 DBS의 생리와 임상 효과 예측 하기 위해 사용할 수 있습니다. 이러한 모델 뇌 조직의 3 차원 표현 및 이식된 전극의 생물 특성 유한 요소 모델링 (FEM)을 사용 합니다. FEM 생체 필드 모델 성공적으로 DBS14의 효과 예측 하기 위해 사용 되었습니다 있지만 지금까지이 고 시간이 많이 걸리는 계산 생성 하는 비용이 많이 드는. DBS 장치 복잡 한 성장에 발맞추어 새로운 모델링 기법에 대 한 필요가 있다. 이러한 환자 전용 모델 근처 리드 위치로 DBS의 효과에 실시간 시각적 피드백 제공 해야 또는 자극 매개 변수가 변경 됩니다. 사용자 지도 위치에 대 한 피드백을 얻을 것이 고 자극 설정을 사용 하면 몇 초에서 몇 분의 과정을 통해 리드 배치의 상세를 계속. 환자-특이성은 FEM을 작성할 때 환자의 해부학, 그들의 두뇌의 모양과 크기, 통합 조직 이방성 전도성 등 그들의 두뇌의 생물 속성을 적용 하 여 얻을 수 있다. 이방성 전도성 어떻게 설명 합니다 현재 다른 뇌 영역을 통해 확산 것 이다 전형적인 자기 공명 영상 (MRI)와 비슷한 전체 두뇌에 대 한 비 접촉 측정 될 수 있다.
DBS 모델링 접근 환자 관련 정보를 사용 하지 않는 자극 효과, 일반화 된 기 하 도형 및 뇌 조직에 전도도 값의 빠른, 하지만 덜 정확 하 게 예측을 제공할 수 있습니다. 이 방법에서는, 모든 환자에 대 한 단일 FEM을 사용 하 고 예측된 신경 활동을 사전에 계산 될 수 있다. 환자 전용 모델 일반화 하 고 이후 새로운 FEM 각각 만들어집니다 미리 계산 수 없습니다. 이러한 모델 구축에 더 많은 노력을 필요로 하지만 더 정확한 될 수 있습니다. 이러한 모델 구축 및 사용할 수 속도 제한 하는 여러 가지 요인: 1) 업데이트의 모든 후속 단계; 수동 노력이 필요 모델 건물 파이프라인 전극 위치 등의 시작 매개 변수 수정 그리고 2) 단계 모델링 파이프라인에 통합 되지 않은 쉽게 서로 요구 하는 여러 소프트웨어 패키지 간에 데이터를 전달. 종종, 전극 위치, 자극 매개 변수, 또는 전극 디자인 같은 많은 다른 상황을 평가 합니다. 이러한 변화는 환자가 받게 됩니다 치료 효과에 효과 대 한 의미 있는 피드백을 제공 하려면 이러한 결과 해야 합니다 정확 하 고 생성 된 신속 하 게.
우리의 목표는 환자 전용 모델은 속도 활용 하는 일반된 모델에서 얻은 건물과 많은 실시간 비주얼 근처 제공 하는 인터랙티브 모델링 환경을 만들기 위해 파이프라인 단계 자동화에 대 한 새로운 기법을 제시 하 DBS의 효과 대 한 의견입니다. 인터랙티브 시뮬레이션 예측 테스트와 모델의 세부 사항에 집중 하지 않고 신속 하 게 결과 얻을 수 있습니다. 이 때 도움이 큰 매개 변수 공간을 탐구 하 고 어떻게 이러한 매개 변수에 영향을 시뮬레이션 하는 것은 확실입니다. 우리는 자기 공명 영상 (MRI) 인수에서 대화형, 환자 관련 FEM 모델을 생성 하는 처리 파이프라인의 단계를 설명 합니다. 이 문서에 설명 된 기술과 도구를 활용 하 여 FEM 생체 필드 모델을 만들기 위한 시간 비용 하는 이러한 모델을 연구자와 임상 전문가 모델링 하지 사람에 액세스할 수 있도록 하는 방법을 제공 하십시오.
이 프로토콜 인수 MRI 볼륨에서 환자 전용 유한 요소 모델을 구축 하 고 다음 DBS 전극에 의해 유도 된 전기 분야를 시뮬레이션 하는 방법을 설명 합니다. 이러한 모델의 생성에서 하는 주요 단계는: 1) 유한 요소 모델 (FEM) 대표 하는 환자의 뇌 이식된 전극, 2) FEM, DBS 장치 두뇌와 자극 매개 변수의 생물 속성 추가 3)에 대 한 해결 모델에서 전극에 의해 생성 된 전압. DBS 시뮬레이션에 대 한 환자의 특정 모델 두 이미징 형식 필요 합니다. T1 MRI는 뇌 표면, 심, 및 특정 핵의 세그먼트를 생성 하는 데 사용 됩니다. 유포가 중 영상 (뒤), 물 확산 율의 측정15뇌 조직 걸쳐 확산 tensors 추정 하는 데 사용 됩니다. 보급 tensors 복으로16전도도 tensors를 계량 한 복에 조직의 휘도가 이방성 생물 속성으로 변환 됩니다. 전극에 의해 유도 된 두뇌에 걸쳐 전압 분배는 FEM의 응용 프로그램을 통해 시스템을 선형 방정식을 단순화 푸아송 방정식을 해결 하 여 계산 됩니다 Ax = b A 가 강성 매트릭스를 전도도 나타내고 메시의 지오메트리, x 는 메시의 각 노드에 전압 솔루션 이며 b 는 경계 조건 및 전류 소스 수정.

<table><tbody><tr><td>FreeSurfer</td><td>Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging</td><td></td><td>&lt;a href=&quot;https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/&quot;&gt;https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/&lt;/a&gt;</td></tr><tr><td>3D Slicer</td><td>BWH, Harvard University</td><td></td><td>&lt;a href=&quot;https://www.slicer.org/&quot;&gt;https://www.slicer.org/&lt;/a&gt;</td></tr><tr><td>SCIRun&amp;nbsp;</td><td>University of Utah Center for Integrative Biomedical Computing</td><td></td><td>&lt;a href=&quot;http://www.sci.utah.edu/cibc-software/scirun.html&quot;&gt;http://www.sci.utah.edu/cibc-software/scirun.html&lt;/a&gt;</td></tr></tbody></table>

targeting neuronal fiber tracts for deep brain stimulation therapy using interactive, patient-specific models

지역화 된 뇌 영역에 자극을 제공 하는 전극의 삽입을 포함 한다, 깊은 뇌 자극 (DBS), 운동 장애에 대 한 설립된 치료 이며, 무질서의 성장 수에 적용 되는. 전산 모델링 성공적으로 DBS;의 임상 효과 예측 하는 데 사용 되었습니다. 그러나, DBS 장치 복잡 한 성장에 발맞추어 새로운 모델링 기법에 대 한 필요가 있다. 이 모델 또한 신속 하 고 정확 하 게 예측을 생성 해야 합니다. 이 프로젝트의 목표는 DBS의 효과 시뮬레이션 하는 대화형, 환자 특정 모델에 구조 자기 공명 영상 (MRI) 및 가중치 확산 이미징 (뒤)를 통합 하는 이미지 처리 파이프라인을 개발 하는 것입니다. 가상 DBS 리드 활성 연락처는 환자 모델 안에 배치 될 수 있습니다 및 자극 설정, 리드 위치 또는 방향에서 변화는 새로운 유한 요소 메쉬 및 생물 분야 문제에의 해결책을 생성 하는 어디 근처 실시간, 약 10 초의 timespan. 이 시스템은 또한 다양 한 양극 및 음극 다른 리드에 의해 현재 운영 수 있도록 가까이에 여러 리드의 시뮬레이션을 수 있습니다. 이 문서에 소개 된 기술을 생성 하 고 연구자 또는 임상 전극 위치, 전극 디자인 및 자극 구성의 효과 대 한 의미 있는 피드백을 제공 하면서 전산 모델을 사용 하 여 부담을 줄일 누가 모델링 전문가 되지 않을 수 있습니다.

이 프로토콜의 끝에 모든 환자-특정 모델을 만드는 데 필요한 입력 제공 됩니다: 뇌 표면 전극 형상과 전도도 tensors. SCIRun 네트워크 해야 또한 만들어진 모든 유한 요소 모델을 구축 하 고 유도 생물 분야 시뮬레이션에 대 한 입력을 통합 하. 시뮬레이션 모델 두뇌 내에서 전극의 움직임 및 활성 연락처 또는 자극 진폭 등의 수정에 대 한 수 있습니다.
그림 1 시뮬레이션 여러 전극 위치에서 섬유 활성화 예측을 비교 하는 기능을 보여 줍니다. 보급 영상에서 섬유 책자의 생성 하지이 프로토콜에서 설명 되었다 하지만이 분석은 어떤 결정적 tractography 방법으로 수행할 수 있습니다. 위치 2 위치 1에 비해 모든 연락처에서 낮은 자극 진폭에서 대상 섬유 번들의 더 강력한 활성화를 예측 합니다. 이 분석 DBS 수술의 계획 단계 동안 효과적으로 대상 섬유 통로 자극 하는 것 이다 전극 궤적을 결정 하는 데 사용 됩니다.
이 시스템의 새로운 기능 전극 형상 모델에 신속 하 게 전환 하는 기능 및 서로 게 가까운 근접에서 여러 단서를 시뮬레이션 하는 기능입니다. 이러한 접근의 둘 다 모양과 전극 주변의 전기장의 스티어링을 더 잘 제어할 제공 하는 데 사용 됩니다. 그림 2 에서는 DBS로 이어질 지도 위치를 조사 하는 동안 중앙 thalamic 섬유 경로 및 인근 지역 감각 핵 등 피하 자극 하는 axisymmetric와 방향 사이 섬유 활성화 예측의 비교 . 동일한 전극 궤적에 대 한 우리 방향 리드는 바람직하지 않은 섬유의 자극을 피하고 있는 동안 대상 지역으로 섬유 활성화를 보낼 수를 볼 수 있습니다. 이 분석은 환자 원치 않는 부작용을 일으킬 것 이다 인근 지역의 자극을 피하기 위해 DBS 치료 받게 하는 장치를 변경 해야 할 것 이다 때 결정 하기 위해 사용할 수 있습니다. 이 방식은 인근 내부 캡슐을 피하는 동안 파 킨 슨 병의 증상을 치료 하 시상 핵을 타겟팅 하는 데 유용 합니다.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57292/57292fig1.jpg"> 그림 1 : 전극 위치 및 대상 섬유 활성화의 예측의 비교. 자극 진폭 (-0.5 V-5.0 V ~)에 대 한 총 섬유 번들 활성화 및 두 개의 서로 다른 전극 위치에 대 한 모든 4 개의 연락처 예측 <a href="https://www-jove-com.bdigitaluss.remotexs.co/files/ftp_upload/57292/57292fig1large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57292/57292fig2.jpg"> 그림 2 : Axisymmetric 및 방향 DBS와 중앙 thalamic 섬유 번들 활성화 예측의 비교 리드. (A) 둘 다의 시각화 Medtronic 3387 원통형 DBS 리드 고 사피엔스 방향 DBS 단일 monopolar 자극 진폭에 대 한 대상 중앙 thalamic 섬유 번들에 함수 계산을 활성화와 함께. (B) (i)는 횡단면 쪼 갠 다 DBS 리드와 섬유 번들을 통해. (ii)는 DBS의 식별과 단면적의 2 차원 투영 리드, 섬유 및 섬유를 피하기 위해. (C) 대상 섬유 및 섬유 자극 진폭으로 회피의 활성화의 확산 axisymmetric와 방향에 대 한 증가 DBS 리드. 주어진된 자극 진폭에 대 한 활성화 된 섬유 섬유 활성화 되지 파란색에서 표시는 빨간색으로 표시 됩니다. (D) C, 섬유 번들의 모든 지역에 걸쳐 예측된 자극 임계값 진폭을 보여주는 패널에 표시 된 모든 시뮬레이션의 편집. <a href="https://www-jove-com.bdigitaluss.remotexs.co/files/ftp_upload/57292/57292fig2large.jpg">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>

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Targeting Neuronal Fiber Tracts for Deep Brain Stimulation Therapy Using Interactive, Patient-Specific Models

이 프로젝트의 목표는 거의 실시간으로 깊은 두뇌 자극의 효과 시뮬레이션 하 고 어떻게 이러한 장치에 영향을 미칠 뇌의 신경 활동으로 의미 있는 피드백을 제공 하는 대화형, 환자 관련 모델링 파이프라인을 개발 하는 것입니다.

대화형, 환자 전용 모델을 사용 하 여 깊은 두뇌 자극 치료를 위한 신경 섬유 책자를 대상으로

Deep brain stimulation (DBS), which involves insertion of an electrode to deliver stimulation to a localized brain region, is an established therapy for ...

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Universidad San Sebastian

Research

JoVE Journal

Bioengineering

8.8K 조회수.  University of Utah. 이 프로젝트의 목표는 거의 실시간으로 깊은 두뇌 자극의 효과 시뮬레이션 하 고 어떻게 이러한 장치에 영향을 미칠 뇌의 신경 활동으로 의미 있는 피드백을 제공 하는 대화형, 환자 관련 모델링 파이프라인을 개발 하는 것입니다.

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Intra-Operative Behavioral Tasks in Awake Humans Undergoing Deep Brain Stimulation Surgery

Deep brain stimulation (DBS) is a surgical procedure that directs chronic, high frequency electrical stimulation to specific targets in the brain through implanted electrodes. Deep brain stimulation was first implemented as a therapeutic modality by Benabid et al. in the late 1980s, when he used this technique to stimulate the ventral intermediate nucleus of the thalamus for the treatment of tremor 1. Currently, the procedure is used to treat patients who fail to respond adequately to medical management for diseases such as Parkinson's, dystonia, and essential tremor. The efficacy of this procedure for the treatment of Parkinson's disease has been demonstrated in well-powered, randomized controlled trials 2. Presently, the U.S. Food and Drug Administration has approved DBS as a treatment for patients with medically refractory essential tremor, Parkinson's disease, and dystonia. Additionally, DBS is currently being evaluated for the treatment of other psychiatric and neurological disorders, such as obsessive compulsive disorder, major depressive disorder, and epilepsy. 
DBS has not only been shown to help people by improving their quality of life, it also provides researchers with the unique opportunity to study and understand the human brain. Microelectrode recordings are routinely performed during DBS surgery in order to enhance the precision of anatomical targeting. Firing patterns of individual neurons can therefore be recorded while the subject performs a behavioral task. Early studies using these data focused on descriptive aspects, including firing and burst rates, and frequency modulation 3. More recent studies have focused on cognitive aspects of behavior in relation to neuronal activity 4,5. This article will provide a description of the intra-operative methods used to perform behavioral tasks and record neuronal data with awake patients during DBS cases. Our exposition of the process of acquiring electrophysiological data will illuminate the current scope and limitations of intra-operative human experiments.

Deep brain stimulation surgery offers a unique opportunity to examine information encoding in the awake human brain. This article will describe intra-operative methods used to perform cognitive and behavioral tasks while simultaneously acquiring physiological data such as EMG, single-unit neuronal activity and/or local field potentials.

딥 뇌 자극 수술을받은 깨어 인간 내부 수술 행동 작업

Deep brain stimulation (DBS) is a surgical procedure that directs chronic, high frequency electrical stimulation to specific targets in the brain through ...

연구

의학

A General Method for Evaluating Deep Brain Stimulation Effects on Intravenous Methamphetamine Self-Administration

Substance use disorders, particularly to methamphetamine, are devastating, relapsing diseases that disproportionally affect young people. There is a need for novel, effective and practical treatment strategies that are validated in animal models. Neuromodulation, including deep brain stimulation (DBS) therapy, refers to the use of electricity to influence pathological neuronal activity and has shown promise for psychiatric disorders, including drug dependence. DBS in clinical practice involves the continuous delivery of stimulation into brain structures using an implantable pacemaker-like system that is programmed externally by a physician to alleviate symptoms. This treatment will be limited in methamphetamine users due to challenging psychosocial situations. Electrical treatments that can be delivered intermittently, non-invasively and remotely from the drug-use setting will be more realistic. This article describes the delivery of intracranial electrical stimulation that is temporally and spatially separate from the drug-use environment for the treatment of IV methamphetamine dependence. Methamphetamine dependence is rapidly developed in rodents using an operant paradigm of intravenous (IV) self-administration that incorporates a period of extended access to drug and demonstrates both escalation of use and high motivation to obtain drug.

This article describes the delivery of intracranial electrical stimulation that is temporally and spatially separate from the drug-use environment for the treatment of IV methamphetamine dependence.

정맥 필로폰 자기 관리에 깊은 뇌 자극의 효과를 평가하기위한 일반적인 방법

Substance use disorders, particularly to methamphetamine, are devastating, relapsing diseases that disproportionally affect young people.  There is a need ...

행동분석학

Non-Invasive Electrical Brain Stimulation Montages for Modulation of Human Motor Function

Non-invasive electrical brain stimulation (NEBS) is used to modulate brain function and behavior, both for research and clinical purposes. In particular, NEBS can be applied transcranially either as direct current stimulation (tDCS) or alternating current stimulation (tACS). These stimulation types exert time-, dose- and in the case of tDCS polarity-specific effects on motor function and skill learning in healthy subjects. Lately, tDCS has been used to augment the therapy of motor disabilities in patients with stroke or movement disorders. This article provides a step-by-step protocol for targeting the primary motor cortex with tDCS and transcranial random noise stimulation (tRNS), a specific form of tACS using an electrical current applied randomly within a pre-defined frequency range. The setup of two different stimulation montages is explained. In both montages the emitting electrode (the anode for tDCS) is placed on the primary motor cortex of interest. For unilateral motor cortex stimulation the receiving electrode is placed on the contralateral forehead while for bilateral motor cortex stimulation the receiving electrode is placed on the opposite primary motor cortex. The advantages and disadvantages of each montage for the modulation of cortical excitability and motor function including learning are discussed, as well as safety, tolerability and blinding aspects.

Non-invasive electrical brain stimulation can modulate cortical function and behavior, both for research and clinical purposes. This protocol describes different brain stimulation approaches for modulation of the human motor system.

인간의 운동 기능의 변조를위한 비 침습 뇌 전기 자극 몽타주

Non-invasive electrical brain stimulation (NEBS) is used to modulate brain function and behavior, both for research and clinical purposes. In particular, ...

Deep Brain Stimulation with Simultaneous fMRI in Rodents

In order to visualize the global and downstream neuronal responses to deep brain stimulation (DBS) at various targets, we have developed a protocol for using blood oxygen level dependent (BOLD) functional magnetic resonance imaging (fMRI) to image rodents with simultaneous DBS. DBS fMRI presents a number of technical challenges, including accuracy of electrode implantation, MR artifacts created by the electrode, choice of anesthesia and paralytic to minimize any neuronal effects while simultaneously eliminating animal motion, and maintenance of physiological parameters, deviation from which can confound the BOLD signal.&#160;Our laboratory has developed a set of procedures that are capable of overcoming most of these possible issues. For electrical stimulation, a homemade tungsten bipolar microelectrode is used, inserted stereotactically at the stimulation site in the anesthetized subject. In preparation for imaging, rodents are fixed on a plastic headpiece and transferred to the magnet bore. For sedation and paralysis during scanning, a cocktail of dexmedetomidine and pancuronium is continuously infused, along with a minimal dose of isoflurane; this preparation minimizes the BOLD ceiling effect of volatile anesthetics. In this example experiment, stimulation of the subthalamic nucleus (STN) produces BOLD responses which are observed primarily in ipsilateral cortical regions, centered in motor cortex. Simultaneous DBS and fMRI allows the unambiguous modulation of neural circuits dependent on stimulation location and stimulation parameters, and permits observation of neuronal modulations free of regional bias. This technique may be used to explore the downstream effects of modulating neural circuitry at nearly any brain region, with implications for both experimental and clinical DBS.

This protocol describes a standard method for simultaneous functional magnetic resonance imaging and deep brain stimulation in the rodent. The combined use of these experimental tools allows for the exploration of global downstream activity in response to electrical stimulation at virtually any brain target.

설치류에 동시 fMRI를 깊은 뇌 자극

In order to visualize the global and downstream neuronal responses to deep brain stimulation (DBS) at various targets, we have developed a protocol for ...

신경과학

Individualized rTMS Treatment for Depression using an fMRI-Based Targeting Method

To achieve greater clinical efficacy, a revolution in treatment for major depressive disorder (MDD) is highly anticipated. Repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) is a non-invasive and safe neuromodulation technique that immediately changes brain activity. Despite its wide application in the treatment for MDD, the treatment response remains different among individuals, which may be attributable to the inaccurate positioning of the stimulation target. Our study aims to examine whether the functional magnetic resonance imaging (fMRI)-assisted positioning improves the efficacy of rTMS in treating depression. We intend to identify and stimulate the subregion of dorsolateral prefrontal cortex (DLPFC) in MDD with strongest anti-correlation with the subgenual anterior cingulate cortex (sgACC), and to conduct a comparative investigation of this novel method and the traditional 5-cm rule. To achieve more precise stimulation, both methods were applied under the guidance of neuronavigation system. We expected that the TMS treatment with individualized positioning based on resting state functional connectivity may show better clinical efficacy than the 5-cm method.

The present protocol describes the application of repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS), where a subregion of the dorsolateral prefrontal cortex (DLPFC) with the strongest functional anticorrelation with the subgenual anterior cingulate cortex (sgACC) was located as the stimulation target under the assistance of a fMRI-based neuronavigation system.

fMRI 기반 표적화 방법을 이용한 우울증에 대한 개별화된 rTMS 치료

To achieve greater clinical efficacy, a revolution in treatment for major depressive disorder (MDD) is highly anticipated. Repetitive transcranial ...

Analysis of Gene Expression Changes in the Rat Hippocampus After Deep Brain Stimulation of the Anterior Thalamic Nucleus

Deep brain stimulation (DBS) surgery, targeting various regions of the brain such as the basal ganglia, thalamus, and subthalamic regions, is an effective treatment for several movement disorders that have failed to respond to medication. Recent progress in the field of DBS surgery has begun to extend the application of this surgical technique to other conditions as diverse as morbid obesity, depression and obsessive compulsive disorder. Despite these expanding indications, little is known about the underlying physiological mechanisms that facilitate the beneficial effects of DBS surgery. One approach to this question is to perform gene expression analysis in neurons that receive the electrical stimulation. Previous studies have shown that neurogenesis in the rat dentate gyrus is elicited in DBS targeting of the anterior nucleus of the thalamus1. DBS surgery targeting the ATN is used widely for treatment refractory epilepsy. It is thus of much interest for us to explore the transcriptional changes induced by electrically stimulating the ATN. In this manuscript, we describe our methodologies for stereotactically-guided DBS surgery targeting the ATN in adult male Wistar rats. We also discuss the subsequent steps for tissue dissection, RNA isolation, cDNA preparation and quantitative RT-PCR for measuring gene expression changes. This method could be applied and modified for stimulating the basal ganglia and other regions of the brain commonly clinically targeted. The gene expression study described here assumes a candidate target gene approach for discovering molecular players that could be directing the mechanism for DBS.

The mechanism underlying the therapeutic effects of Deep Brain Stimulation (DBS) surgery needs investigation. The methods presented in this manuscript describe an experimental approach to examine the cellular events triggered by DBS by analyzing the gene expression profile of candidate genes that can facilitate neurogenesis post DBS surgery.

전방 시상 핵의 깊은 뇌 자극 후 쥐 해마의 유전자 발현 변화 분석

Deep brain stimulation (DBS) surgery, targeting various regions of the brain such as the basal ganglia, thalamus, and subthalamic regions, is an effective ...

MRI-guided dmPFC-rTMS as a Treatment for Treatment-resistant Major Depressive Disorder

Here we outline the protocol for magnetic resonance imaging (MRI) guided repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) to the dorsal medial prefrontal cortex (dmPFC) in patients with major depressive disorder (MDD). Technicians used a neuronavigation system to process patient MRIs to generate a 3-dimensional head model. The head model was subsequently used to identify patient-specific stimulatory targets. The dmPFC was stimulated daily for 20 sessions. Stimulation intensity was titrated to address scalp pain associated with rTMS. Weekly assessments were conducted on the patients using the Hamilton Rating Scale for Depression (HamD17) and Beck Depression Index II (BDI-II). Treatment-resistant MDD patients achieved significant improvements on both HAMD and BDI-II. Of note, angled, double-cone coil rTMS at 120% resting motor threshold allows for optimal stimulation of deeper midline prefrontal regions, which results in a possible therapeutic application for MDD. One major limitation of the rTMS field is the heterogeneity of treatment parameters across studies, including duty cycle, number of pulses per session and intensity. Further work should be done to clarify the effect of stimulation parameters on outcome. Future dmPFC-rTMS work should include sham-controlled studies to confirm its clinical efficacy in MDD.

Here we outline the procedure for MRI-guided repetitive transcranial magnetic stimulation to the dorsomedial prefrontal cortex as an experimental treatment for major depressive disorder.

Here we outline the protocol for magnetic resonance imaging (MRI) guided repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) to the dorsal medial ...

Stimulation Location Determination using a 3D Digitizer with High-Definition Transcranial Direct Current Stimulation

The abundance of neuroimaging data and rapid development of machine learning has made it possible to investigate brain activation patterns. However, causal evidence of brain area activation leading to a behavior is often left missing. Transcranial direct current stimulation (tDCS), which can temporarily alter brain cortical excitability and activity, is a noninvasive neurophysiological tool used to study causal relationships in the human brain. High-definition transcranial direct current stimulation (HD-tDCS) is a noninvasive brain stimulation (NIBS) technique that produces a more focal current compared to conventional tDCS. Traditionally, the stimulation location has been roughly determined through the 10-20 EEG system, because determining precise stimulation points can be difficult. This protocol uses a 3D digitizer with HD-tDCS to increase accuracy in determination of stimulation points. The method is demonstrated using a 3D digitizer for more accurate localization of stimulation points in the right temporo-parietal junction (rTPJ).

Presented here is a protocol to achieve higher accuracy in determination of stimulation location combining a 3D digitizer with high-definition transcranial direct current stimulation.

고화질 경부 직접 전류 자극이 있는 3D 디지타이저를 사용한 자극 위치 측정

The abundance of neuroimaging data and rapid development of machine learning has made it possible to investigate brain activation patterns. However, ...

Measuring and Manipulating Functionally Specific Neural Pathways in the Human Motor System with Transcranial Magnetic Stimulation

Understanding interactions between brain areas is important for the study of goal-directed behavior. Functional neuroimaging of brain connectivity has provided important insights into fundamental processes of the brain like cognition, learning, and motor control. However, this approach cannot provide causal evidence for the involvement of brain areas of interest. Transcranial magnetic stimulation (TMS) is a powerful, noninvasive tool for studying the human brain that can overcome this limitation by transiently modifying brain activity. Here, we highlight recent advances using a paired-pulse, dual-site TMS method with two coils that causally probes cortico-cortical interactions in the human motor system during different task contexts. Additionally, we describe a dual-site TMS protocol based on cortical paired associative stimulation (cPAS) that transiently enhances synaptic efficiency in two interconnected brain areas by applying repeated pairs of cortical stimuli with two coils. These methods can provide a better understanding of the mechanisms underlying cognitive-motor function as well as a new perspective on manipulating specific neural pathways in a targeted fashion to modulate brain circuits and improve behavior. This approach may prove to be an effective tool to develop more sophisticated models of brain-behavior relations and improve diagnosis and treatment of many neurological and psychiatric disorders.

This article describes new approaches to measure and strengthen functionally specific neural pathways with transcranial magnetic stimulation. These advanced noninvasive brain stimulation methodologies can provide new opportunities for the understanding of brain-behavior relations and development of new therapies to treat brain disorders.

경두개 자기 자극을 통해 인간 모터 시스템의 기능적으로 특정신경 경로 측정 및 조작

Understanding interactions between brain areas is important for the study of goal-directed behavior. Functional neuroimaging of brain connectivity has ...

신경 질환 환자를 위한 뇌심부 자극 최적화

Bringing the Clinic Home: An At-Home Multi-Modal Data Collection Ecosystem to Support Adaptive Deep Brain Stimulation

Adaptive deep brain stimulation (aDBS) shows promise for improving treatment for neurological disorders such as Parkinson's disease (PD). aDBS uses symptom-related biomarkers to adjust stimulation parameters in real-time to target symptoms more precisely. To enable these dynamic adjustments, parameters for an aDBS algorithm must be determined for each individual patient. This requires time-consuming manual tuning by clinical researchers, making it difficult to find an optimal configuration for a single patient or to scale to many patients. Furthermore, the long-term effectiveness of aDBS algorithms configured in-clinic while the patient is at home remains an open question. To implement this therapy at large scale, a methodology to automatically configure aDBS algorithm parameters while remotely monitoring therapy outcomes is needed. In this paper, we share a design for an at-home data collection platform to help the field address both issues. The platform is composed of an integrated hardware and software ecosystem that is open-source and allows for at-home collection of neural, inertial, and multi-camera video data. To ensure privacy for patient-identifiable data, the platform encrypts and transfers data through a virtual private network. The methods include time-aligning data streams and extracting pose estimates from video recordings. To demonstrate the use of this system, we deployed this platform to the home of an individual with PD and collected data during self-guided clinical tasks and periods of free behavior over the course of 1.5 years. Data were recorded at sub-therapeutic, therapeutic, and supra-therapeutic stimulation amplitudes to evaluate motor symptom severity under different therapeutic conditions. These time-aligned data show the platform is capable of synchronized at-home multi-modal data collection for therapeutic evaluation. This system architecture may be used to support automated aDBS research, to collect new datasets and to study the long-term effects of DBS therapy outside the clinic for those suffering from neurological disorders.

저자 스포트라이트: 파킨슨병에 대한 자동 뇌심부 자극 - 가정 모니터링의 가능성과 과제 탐색 

The protocol shows a prototype of the at-home multi-modal data collection platform that supports research optimizing adaptive deep brain stimulation (aDBS) for people with neurological movement disorders. We also present key findings from deploying the platform for over a year to the home of an individual with Parkinson's disease.

클리닉을 집으로 가져오다: 적응형 뇌심부 자극을 지원하는 재택 다중 모드 데이터 수집 에코시스템

Adaptive deep brain stimulation (aDBS) shows promise for improving treatment for neurological disorders such as Parkinson's disease (PD). aDBS uses ...