希少細胞集団におけるプロモーター中心の時空間ゲノム構造を研究するための統合ワークフロー

liCHi-Cでは、私たちが答えようとしている主な問題は、クロマチンが核内でどのように相互作用するか、したがって遺伝子調節の新しい層を理解することです。liCHi-Cを使用して、特定のサンプルのゲノム構成を探索し、疾患に関連する非コード変異を影響を受ける可能性のある遺伝子と関連付け、たとえば腫瘍サンプルの転座などの染色体再構成を検出できることが証明されました。これで、初代幹細胞や関連する臨床サンプルなどの瘢痕細胞タイプの3Dクロマチン組織を調べることができます。

私たちのプロトコルは、制限フラグメントの解像度でゲノム構成を探索するための高品質のデータを取得するために必要な入力材料と時間とコストを削減します。liCHi-Cは、3Dクロマチン組織化分野の範囲を拡大し、これまで分析できなかった新しい細胞タイプを探索することを可能にしています。liCHi-Cのおかげで、科学界は遺伝子発現の特別な調節を探求することができます。

例えば、腫瘍内の特定のクローン亜集団においてのみ悪性形質転換において。