Screening farmacologico basato sulla trascrittomica efficiente in termini di costi

La trascrittomica ci permette di acquisire una profonda comprensione del programma cellulare e della sua reazione ai cambiamenti esterni. Tuttavia, nonostante una considerevole riduzione dei costi di produzione e sequenziamento delle biblioteche negli ultimi decenni, l'applicazione di questa tecnologia, alla scala necessaria per lo screening dei farmaci, è ancora inaccessibile, ostacolando il grande potenziale di questi metodi. Il nostro studio presenta un sistema economicamente vantaggioso per lo screening farmacologico basato sul trascrittoma, combinando colture perturbative miniaturizzate con trascrittomica mini-bulk.

Il protocollo mini-bulk ottimizzato fornisce un segnale biologico informativo a una profondità di sequenziamento conveniente, consentendo uno screening approfondito di farmaci noti e nuove molecole. Uno dei principali vantaggi della combinazione della trascrittomica con uno screening imparziale dei farmaci è la possibilità di identificare nuovi bersagli farmacologici che non sono stati precedentemente considerati. Gli approcci convenzionali di screening dei farmaci spesso si concentrano su molecole o percorsi bersaglio stabiliti, ostacolando l'identificazione di nuovi bersagli e potenzialmente dando luogo a farmaci con effetti collaterali imprevisti e un'efficacia limitata.