פרוטוקול יעיל לניתוח CUT&RUN של תאי לוויין עכבר מבודדים ב-FAC

מאז יותר מ -20 שנה, המעבדה שלנו מתעניינת בתפקיד הפתופיזיולוגי של קולטנים גרעיניים. כדי לפענח את פונקציית in vivo שלהם, הנדסנו מודל עכבר המאפשר שליטה מרחבית וזמנית על הביטוי שלהם. במקביל, פיתחנו טכניקות חדשניות לחקר תפקודן המולקולרי ברקמות העכבר.

העניין המדעי שלנו הוביל אותנו לאחרונה לקבוע איתות קולטן סקוסטרואידים וסטרואידים ברקמות שונות, כולל שרירי השלד. לאחרונה הוכחנו כי קולטן אנדרוגן במיוסיבים הממיינים תאים של שריר השלד הוא אינסטרומנטלי בתפקודים התכווצים ומטבוליים שלהם. הממצאים האחרונים שלנו מספקים הבנה עמוקה יותר של הדינמיקה הפתופיזיולוגית של שרירי השלד, שהיא חיונית לפיתוח טיפולים יעילים להפרעות הקשורות לשרירים.

פיתחנו פרוטוקול זה כדי להיות מסוגל לבצע ניתוח cistrome על תאי גזע שריר in vivo. כל הפרוטוקולים הקודמים ששימשו במודאלי מבחנה, מה שמנתק לחלוטין את החקירה מהקשר אורגניזם שלם. בנוסף להיותו זול וחסכוני בזמן, פרוטוקול זה מספק הגדרה ניסיונית יעילה לחקר גיוס פקטורי שעתוק ונוף הכרומטין בתאי אב של שרירי השלד.

כרומטין שהוכן על ידי פרוטוקול זה סיפק את הניתוח הגנומי הראשון של ציסטרומה AR בתאי לוויין, ויקל על מחקרים עתידיים על בקרת גנים. בין רבים, מטרתנו העתידית תהיה להרחיב את החקירות הללו על קולטני אוקסוסטרואידים אחרים ולחקור את הרגולטורים הספציפיים שלהם בסוגי התאים השונים המעורבים בתהליך ההתחדשות בשרירי השלד.