Histonmodifikations-Screening mittels Flüssigkeitschromatographie, Ionenmobilitätsspektrometrie und Flugzeit-Massenspektrometrie

Es wird eine Methode vorgeschlagen, bei der ein Histon-Extraktionsprotokoll mit einer Effizienz von 95 % verwendet wird. Zusammen mit LC-TIMS-ToF MS/MS ist es möglich, in kurzer Zeit ein Screening auf die im Histon vorhandenen PTMs zu erhalten. Und vor allem die Möglichkeit, Isomere zu trennen.

Die Trennung von isomeren Peptiden ist zwar nur mit Tandem-Massenspektrometrie möglich, aber oft schwierig. Durch die Integration von TIMS führen wir eine zusätzliche Dimension der Trennung ein und vereinfachen viele Positionsisomerenidentifikationen. Darüber hinaus erhöht die passive Technologie die Empfindlichkeit dieser Experimente und verbessert so unsere Fähigkeit, epigenetische Variationen zu analysieren.

Mit der verbesserten Fähigkeit, PTM-Positionen zu identifizieren, geht die Möglichkeit einher, die Korrelation zwischen verschiedenen Umwelt- oder biologischen Faktoren und deren Auswirkungen auf das Epigenom weiter zu bestimmen. Methoden, die die Analyse von Histonen verbessern und erleichtern, können auf verschiedene Forschungsbereiche angewendet werden, einschließlich der Medizin- und Umweltchemie. Die Dynamik der Proteinbestätigung in nativen oder beschädigten Zuständen wird durch die Implementierung von TIMS MS/MS mit HDX ermittelt.

Durch LC-TIMS-ToF MS/MS und Nano LC-TIMS-ToF MS/MS werden die Unterschiede in PTM in verschiedenen biologischen Proben kartiert.